Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4YBE3

Protein Details
Accession C4YBE3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-312DESRNMRTPSVRRRKHKRSSMRVSPEAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-303VRRRKHKRS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031398  She3  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048309  P:endoplasmic reticulum inheritance  
GO:0051028  P:mRNA transport  
KEGG clu:CLUG_05521  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17078  SHE3  
Amino Acid Sequences MESPARNKPTSSRVIDSLHSQIDELKAELEHLRLSQSEHKKNHAVLASKHESLVDQLANAKHENDMVNALLKRKERRIADLEEDTDKLSAANDSLRHGNANLKIRCEQLQDSSASSTAEYERLKIAYDALLAAQNEYKRHYQSELAQVAQQFEEYKQESRKQMAELSSKLDSNDKDIDTLLDGLVHKRKVMDNLYVNRNRTVLELLAALSRAAKAHGEESRELLAENICAINSIREKFPDLQEKISEHNGRQIDIDDLLSQTSASFDTSVDELEQGQNTGHDKADESRNMRTPSVRRRKHKRSSMRVSPEAEPSDALPRARPHQEPARTPEPGRRPMSQQDLLARNSLSRSTSGGRNSPRPQSSGHSSYSGHTSQSNTSHRPSHNAKNGRVASTGSGSRTPSGGAKRRSFYGGSNNYNNGSNRRSSSKADTSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.52
3 0.5
4 0.46
5 0.4
6 0.33
7 0.29
8 0.26
9 0.25
10 0.25
11 0.21
12 0.17
13 0.14
14 0.16
15 0.17
16 0.16
17 0.15
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.19
22 0.27
23 0.36
24 0.44
25 0.46
26 0.52
27 0.57
28 0.57
29 0.6
30 0.56
31 0.52
32 0.46
33 0.52
34 0.51
35 0.46
36 0.44
37 0.38
38 0.32
39 0.28
40 0.28
41 0.19
42 0.14
43 0.18
44 0.2
45 0.22
46 0.23
47 0.21
48 0.17
49 0.19
50 0.2
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.2
55 0.21
56 0.23
57 0.25
58 0.3
59 0.35
60 0.4
61 0.47
62 0.44
63 0.51
64 0.54
65 0.55
66 0.56
67 0.55
68 0.51
69 0.46
70 0.43
71 0.36
72 0.3
73 0.23
74 0.16
75 0.11
76 0.09
77 0.08
78 0.1
79 0.11
80 0.13
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.22
86 0.25
87 0.34
88 0.33
89 0.34
90 0.36
91 0.37
92 0.39
93 0.37
94 0.33
95 0.28
96 0.3
97 0.27
98 0.27
99 0.25
100 0.23
101 0.19
102 0.17
103 0.14
104 0.12
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.11
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.17
124 0.19
125 0.19
126 0.21
127 0.22
128 0.23
129 0.26
130 0.35
131 0.34
132 0.32
133 0.32
134 0.3
135 0.29
136 0.26
137 0.21
138 0.12
139 0.1
140 0.14
141 0.14
142 0.18
143 0.21
144 0.27
145 0.29
146 0.32
147 0.33
148 0.3
149 0.32
150 0.34
151 0.34
152 0.3
153 0.3
154 0.28
155 0.27
156 0.25
157 0.25
158 0.2
159 0.19
160 0.22
161 0.18
162 0.17
163 0.17
164 0.17
165 0.14
166 0.14
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.1
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.14
175 0.16
176 0.19
177 0.22
178 0.25
179 0.28
180 0.34
181 0.42
182 0.45
183 0.45
184 0.41
185 0.38
186 0.32
187 0.26
188 0.22
189 0.13
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.08
203 0.11
204 0.13
205 0.13
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.14
210 0.11
211 0.09
212 0.07
213 0.07
214 0.05
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.07
219 0.09
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.15
224 0.17
225 0.21
226 0.28
227 0.27
228 0.28
229 0.3
230 0.3
231 0.3
232 0.35
233 0.32
234 0.23
235 0.28
236 0.26
237 0.25
238 0.24
239 0.22
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.14
271 0.2
272 0.24
273 0.25
274 0.28
275 0.35
276 0.37
277 0.37
278 0.39
279 0.41
280 0.47
281 0.55
282 0.6
283 0.63
284 0.72
285 0.81
286 0.86
287 0.89
288 0.89
289 0.89
290 0.9
291 0.91
292 0.88
293 0.83
294 0.77
295 0.69
296 0.64
297 0.55
298 0.45
299 0.35
300 0.27
301 0.27
302 0.25
303 0.22
304 0.2
305 0.21
306 0.26
307 0.31
308 0.32
309 0.33
310 0.4
311 0.47
312 0.49
313 0.54
314 0.55
315 0.53
316 0.52
317 0.54
318 0.53
319 0.55
320 0.54
321 0.49
322 0.48
323 0.52
324 0.59
325 0.54
326 0.49
327 0.48
328 0.48
329 0.47
330 0.43
331 0.36
332 0.29
333 0.27
334 0.26
335 0.19
336 0.15
337 0.18
338 0.19
339 0.24
340 0.28
341 0.34
342 0.38
343 0.45
344 0.5
345 0.55
346 0.54
347 0.51
348 0.49
349 0.49
350 0.51
351 0.47
352 0.45
353 0.39
354 0.37
355 0.37
356 0.4
357 0.34
358 0.27
359 0.24
360 0.24
361 0.25
362 0.33
363 0.38
364 0.36
365 0.39
366 0.46
367 0.45
368 0.51
369 0.54
370 0.56
371 0.59
372 0.64
373 0.63
374 0.65
375 0.67
376 0.62
377 0.56
378 0.47
379 0.4
380 0.36
381 0.36
382 0.29
383 0.28
384 0.27
385 0.27
386 0.26
387 0.24
388 0.26
389 0.32
390 0.38
391 0.44
392 0.5
393 0.52
394 0.55
395 0.57
396 0.53
397 0.49
398 0.51
399 0.51
400 0.52
401 0.54
402 0.54
403 0.51
404 0.55
405 0.53
406 0.48
407 0.43
408 0.41
409 0.4
410 0.43
411 0.46
412 0.46
413 0.52