Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y410

Protein Details
Accession C4Y410    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-31QKIQSKGQIRNPPPRPTPKPPTATHydrophilic
222-241PSSKLQSKLKSKKADKSQSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-81RLKAARKAEKEAKEREMRAKKGSAPKKE
147-169PKTKTPEAQPRRKTPERDERRAR
231-231K
332-345RRAKLKEARKKAKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 10.5, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
KEGG clu:CLUG_02382  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSLSSILQKIQSKGQIRNPPPRPTPKPPTATALKPTYPSSSSSNERTVDPVVARLKAARKAEKEAKEREMRAKKGSAPKKETSHSRTSKTTSAASSGTRGTINRNKNASTQPLAPQKSERKPKMSFSELMKKASSIDQSKMSISIKPKTKTPEAQPRRKTPERDERRARTTSPRTQGRQEQKPESTIVRSNGGNSKHLKDVRSSQPERKAVAPRQPIPIRQPSSKLQSKLKSKKADKSQSGYDDEADEDEDDDLDSFIASDEEEQVSEEHDYDRDEIWSIFNRGRKRSYYEQYDDEDSDDMEATGAEILEEEALSKRIALKDDQRELLEEQRRAKLKEARKKAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.65
4 0.73
5 0.74
6 0.75
7 0.78
8 0.81
9 0.8
10 0.8
11 0.82
12 0.81
13 0.79
14 0.73
15 0.71
16 0.67
17 0.64
18 0.61
19 0.58
20 0.51
21 0.48
22 0.48
23 0.45
24 0.4
25 0.37
26 0.34
27 0.34
28 0.37
29 0.39
30 0.42
31 0.39
32 0.38
33 0.38
34 0.35
35 0.32
36 0.27
37 0.28
38 0.26
39 0.25
40 0.25
41 0.27
42 0.3
43 0.33
44 0.4
45 0.41
46 0.42
47 0.5
48 0.59
49 0.63
50 0.65
51 0.65
52 0.66
53 0.66
54 0.67
55 0.68
56 0.68
57 0.64
58 0.62
59 0.59
60 0.58
61 0.61
62 0.66
63 0.65
64 0.63
65 0.66
66 0.66
67 0.68
68 0.7
69 0.67
70 0.69
71 0.65
72 0.63
73 0.61
74 0.59
75 0.57
76 0.51
77 0.47
78 0.38
79 0.34
80 0.31
81 0.27
82 0.24
83 0.2
84 0.19
85 0.17
86 0.16
87 0.21
88 0.27
89 0.33
90 0.37
91 0.4
92 0.4
93 0.43
94 0.47
95 0.45
96 0.4
97 0.37
98 0.37
99 0.43
100 0.43
101 0.4
102 0.43
103 0.46
104 0.52
105 0.59
106 0.57
107 0.55
108 0.57
109 0.62
110 0.62
111 0.58
112 0.53
113 0.5
114 0.55
115 0.51
116 0.5
117 0.43
118 0.36
119 0.33
120 0.31
121 0.3
122 0.22
123 0.22
124 0.23
125 0.24
126 0.24
127 0.25
128 0.22
129 0.21
130 0.21
131 0.26
132 0.3
133 0.3
134 0.34
135 0.37
136 0.42
137 0.43
138 0.49
139 0.53
140 0.56
141 0.64
142 0.68
143 0.71
144 0.74
145 0.75
146 0.72
147 0.69
148 0.71
149 0.7
150 0.73
151 0.74
152 0.7
153 0.7
154 0.67
155 0.6
156 0.59
157 0.58
158 0.56
159 0.55
160 0.56
161 0.53
162 0.55
163 0.62
164 0.6
165 0.61
166 0.59
167 0.56
168 0.5
169 0.49
170 0.47
171 0.39
172 0.34
173 0.29
174 0.24
175 0.21
176 0.2
177 0.21
178 0.24
179 0.23
180 0.25
181 0.24
182 0.25
183 0.28
184 0.31
185 0.3
186 0.28
187 0.34
188 0.39
189 0.46
190 0.48
191 0.48
192 0.54
193 0.57
194 0.56
195 0.53
196 0.52
197 0.48
198 0.52
199 0.53
200 0.48
201 0.53
202 0.54
203 0.52
204 0.5
205 0.54
206 0.5
207 0.45
208 0.46
209 0.42
210 0.48
211 0.51
212 0.5
213 0.48
214 0.52
215 0.6
216 0.65
217 0.69
218 0.71
219 0.71
220 0.75
221 0.78
222 0.8
223 0.75
224 0.71
225 0.69
226 0.64
227 0.62
228 0.54
229 0.44
230 0.35
231 0.29
232 0.23
233 0.17
234 0.12
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.14
265 0.18
266 0.2
267 0.22
268 0.26
269 0.32
270 0.36
271 0.41
272 0.42
273 0.46
274 0.53
275 0.58
276 0.62
277 0.62
278 0.61
279 0.6
280 0.6
281 0.53
282 0.44
283 0.36
284 0.26
285 0.22
286 0.17
287 0.13
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.13
304 0.16
305 0.19
306 0.24
307 0.32
308 0.41
309 0.48
310 0.51
311 0.47
312 0.48
313 0.48
314 0.51
315 0.5
316 0.45
317 0.44
318 0.49
319 0.53
320 0.52
321 0.58
322 0.58
323 0.6
324 0.66
325 0.72