Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y7V6

Protein Details
Accession C4Y7V6    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-49GTWKERRNLKLKLQGRERKPGSBasic
73-98AEQYPQKKSTKTEFRKKDRKPAESAEHydrophilic
719-743GQSDAPAKKKEDPRKKMLRMARMAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-37K
39-39K
86-93FRKKDRKP
282-292KKKSEKARIRK
712-737KKLGRSSGQSDAPAKKKEDPRKKMLR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.833, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG clu:CLUG_04284  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17949  DEADc_DDX31  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MEDDGLILNFATEDAPSVPQKAAKVTGGTWKERRNLKLKLQGRERKPGSGVNNIEIDNIRTDRLKEKAEQMMAEQYPQKKSTKTEFRKKDRKPAESAEATKRPSSEPMGITSKKVKFSETSGENGGKNNSYVSSLFTSNKGSEILKESTGSLTSYSASNAPLQDDSTFAGLGLNDRLVTHLTGPMRYMAPTKVQRAVIPQMVRTQEDLFVKAQTGSGKTLAFVLPIIHRLMSESETISRKSGLFALILTPTRELASQIYSVLESLLRCHHHIVPGIVVGGEKKKSEKARIRKGVNVLVATPGRLADHLENTESLDVSQVRWLVLDEGDRLVELGFHETISKITDQLARTSKAMDTMHKWPGLPTRRVNVLCSATMPEDVKKLGSTVLNNPQMISVDREDTSNTNATAPDQLVQKVMVVPPKLRLVTLSAVLKNISHKRDGATRTIVFFSCSDSVNFHFEVFSRGGSPISRKRKESDEEKKGDDKEEEQKTESCASSAPQIADKTAIFRLHGSLSQQLRTSTLQQFTEENGENEGKHLILFCTDVASRGLDLPNIAHVVEYDPPFAIDDHLHRIGRSARVGKKGEAILFLLPGEEEGYVEGKLRVVHPKQGSLRITNYEKVLQEAFAEDSEPVTKTDAKAKQGKWDIHATTWHLEVERWLLEDSGALERASHAFVSHIRAYATHLSSERSFFNVKLLHLGHLAKAFGLRETPKKLGRSSGQSDAPAKKKEDPRKKMLRMARMAEKASSSEFNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.12
3 0.14
4 0.16
5 0.17
6 0.2
7 0.22
8 0.24
9 0.27
10 0.26
11 0.27
12 0.27
13 0.35
14 0.39
15 0.45
16 0.48
17 0.51
18 0.56
19 0.61
20 0.66
21 0.65
22 0.68
23 0.7
24 0.73
25 0.74
26 0.77
27 0.8
28 0.82
29 0.8
30 0.82
31 0.75
32 0.7
33 0.66
34 0.63
35 0.58
36 0.58
37 0.55
38 0.48
39 0.48
40 0.42
41 0.41
42 0.35
43 0.31
44 0.26
45 0.23
46 0.21
47 0.2
48 0.22
49 0.26
50 0.3
51 0.33
52 0.33
53 0.39
54 0.45
55 0.46
56 0.44
57 0.4
58 0.43
59 0.39
60 0.39
61 0.38
62 0.35
63 0.37
64 0.39
65 0.4
66 0.36
67 0.41
68 0.48
69 0.54
70 0.6
71 0.66
72 0.73
73 0.81
74 0.88
75 0.89
76 0.9
77 0.88
78 0.85
79 0.82
80 0.79
81 0.77
82 0.75
83 0.73
84 0.71
85 0.68
86 0.64
87 0.58
88 0.52
89 0.44
90 0.4
91 0.39
92 0.36
93 0.31
94 0.34
95 0.4
96 0.4
97 0.41
98 0.46
99 0.45
100 0.45
101 0.44
102 0.41
103 0.35
104 0.39
105 0.45
106 0.39
107 0.38
108 0.36
109 0.39
110 0.37
111 0.37
112 0.35
113 0.26
114 0.24
115 0.21
116 0.17
117 0.16
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.19
122 0.2
123 0.21
124 0.24
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.18
129 0.18
130 0.22
131 0.23
132 0.2
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.2
137 0.18
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.09
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.17
175 0.15
176 0.22
177 0.27
178 0.3
179 0.33
180 0.34
181 0.34
182 0.37
183 0.4
184 0.38
185 0.34
186 0.32
187 0.32
188 0.33
189 0.32
190 0.29
191 0.26
192 0.24
193 0.24
194 0.24
195 0.2
196 0.18
197 0.18
198 0.16
199 0.16
200 0.14
201 0.15
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.14
208 0.12
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.11
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.15
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.16
227 0.16
228 0.17
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.06
251 0.08
252 0.11
253 0.13
254 0.14
255 0.17
256 0.18
257 0.2
258 0.22
259 0.21
260 0.18
261 0.17
262 0.16
263 0.13
264 0.11
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.17
271 0.22
272 0.32
273 0.4
274 0.48
275 0.58
276 0.66
277 0.68
278 0.67
279 0.68
280 0.63
281 0.56
282 0.46
283 0.35
284 0.3
285 0.27
286 0.21
287 0.17
288 0.12
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.08
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.06
329 0.08
330 0.12
331 0.13
332 0.17
333 0.21
334 0.21
335 0.21
336 0.22
337 0.2
338 0.21
339 0.21
340 0.18
341 0.19
342 0.22
343 0.26
344 0.25
345 0.25
346 0.22
347 0.29
348 0.34
349 0.35
350 0.32
351 0.32
352 0.37
353 0.38
354 0.38
355 0.34
356 0.29
357 0.24
358 0.22
359 0.21
360 0.15
361 0.15
362 0.15
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.09
371 0.1
372 0.14
373 0.22
374 0.25
375 0.25
376 0.25
377 0.23
378 0.23
379 0.22
380 0.19
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.13
406 0.15
407 0.18
408 0.18
409 0.16
410 0.16
411 0.15
412 0.15
413 0.18
414 0.18
415 0.16
416 0.16
417 0.16
418 0.16
419 0.19
420 0.23
421 0.22
422 0.2
423 0.21
424 0.22
425 0.29
426 0.31
427 0.29
428 0.29
429 0.28
430 0.29
431 0.29
432 0.28
433 0.22
434 0.2
435 0.19
436 0.15
437 0.14
438 0.13
439 0.13
440 0.15
441 0.16
442 0.16
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.14
447 0.13
448 0.12
449 0.1
450 0.1
451 0.11
452 0.12
453 0.18
454 0.24
455 0.34
456 0.37
457 0.39
458 0.41
459 0.48
460 0.53
461 0.58
462 0.59
463 0.59
464 0.59
465 0.61
466 0.63
467 0.57
468 0.53
469 0.44
470 0.37
471 0.36
472 0.38
473 0.36
474 0.33
475 0.33
476 0.33
477 0.34
478 0.3
479 0.21
480 0.16
481 0.15
482 0.16
483 0.17
484 0.16
485 0.16
486 0.16
487 0.16
488 0.17
489 0.17
490 0.16
491 0.17
492 0.17
493 0.14
494 0.14
495 0.16
496 0.15
497 0.16
498 0.16
499 0.19
500 0.21
501 0.22
502 0.23
503 0.22
504 0.23
505 0.23
506 0.27
507 0.25
508 0.27
509 0.26
510 0.26
511 0.27
512 0.25
513 0.29
514 0.25
515 0.2
516 0.19
517 0.19
518 0.18
519 0.18
520 0.17
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.07
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.11
533 0.1
534 0.12
535 0.12
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.1
542 0.08
543 0.07
544 0.09
545 0.13
546 0.13
547 0.12
548 0.12
549 0.12
550 0.13
551 0.13
552 0.12
553 0.11
554 0.12
555 0.18
556 0.22
557 0.22
558 0.22
559 0.25
560 0.27
561 0.29
562 0.33
563 0.35
564 0.36
565 0.44
566 0.47
567 0.45
568 0.47
569 0.46
570 0.41
571 0.34
572 0.3
573 0.23
574 0.2
575 0.19
576 0.13
577 0.1
578 0.08
579 0.07
580 0.06
581 0.05
582 0.05
583 0.07
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.09
588 0.1
589 0.13
590 0.21
591 0.22
592 0.3
593 0.32
594 0.4
595 0.43
596 0.5
597 0.51
598 0.46
599 0.47
600 0.46
601 0.48
602 0.43
603 0.41
604 0.38
605 0.34
606 0.33
607 0.3
608 0.23
609 0.19
610 0.18
611 0.17
612 0.12
613 0.13
614 0.1
615 0.1
616 0.11
617 0.12
618 0.11
619 0.12
620 0.14
621 0.15
622 0.24
623 0.29
624 0.34
625 0.42
626 0.43
627 0.51
628 0.57
629 0.59
630 0.54
631 0.57
632 0.52
633 0.46
634 0.49
635 0.43
636 0.36
637 0.34
638 0.31
639 0.23
640 0.21
641 0.2
642 0.2
643 0.17
644 0.16
645 0.15
646 0.14
647 0.13
648 0.14
649 0.14
650 0.14
651 0.14
652 0.12
653 0.12
654 0.13
655 0.14
656 0.15
657 0.13
658 0.1
659 0.11
660 0.13
661 0.2
662 0.21
663 0.21
664 0.2
665 0.2
666 0.25
667 0.31
668 0.3
669 0.27
670 0.26
671 0.29
672 0.31
673 0.33
674 0.29
675 0.25
676 0.26
677 0.22
678 0.28
679 0.27
680 0.26
681 0.3
682 0.3
683 0.28
684 0.3
685 0.31
686 0.27
687 0.27
688 0.26
689 0.19
690 0.2
691 0.19
692 0.16
693 0.2
694 0.23
695 0.28
696 0.34
697 0.4
698 0.44
699 0.49
700 0.5
701 0.53
702 0.56
703 0.57
704 0.57
705 0.58
706 0.56
707 0.56
708 0.6
709 0.6
710 0.6
711 0.57
712 0.55
713 0.56
714 0.62
715 0.69
716 0.73
717 0.73
718 0.77
719 0.82
720 0.85
721 0.86
722 0.85
723 0.84
724 0.81
725 0.8
726 0.79
727 0.74
728 0.68
729 0.61
730 0.54
731 0.46
732 0.41