Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y241

Protein Details
Accession C4Y241    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-55LVPVKNKKEPQAKSKKIFTTHydrophilic
291-315ELPAIGGKKKPKNKIRKKMGAMTDTHydrophilic
400-425ADSVSKSKTAARRKKEKSSMDKLGGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
296-308GGKKKPKNKIRKK
405-416KSKTAARRKKEK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG clu:CLUG_02273  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MGRRKFDKKSAQTFSVVHRSHEDSLYFDNDASRHVLVPVKNKKEPQAKSKKIFTTAELEKNLTPSEIKSIRENEGLAAQYGIFFDDSKYDYMQHLKPIGKAADAVFIEAGAETKPQKKNIEDLLKDSLPSEKTRKVTHDVLENIPRELQGFNPEMDPRLREVLEALEDEAYIEGEAQDDDDIFADLLQSGEVEDEEEFYYGSDGDYDEWDLDNYEDEYEQYNSENEPEPVELENPYNEGEAPEDFEGVQLQSNLWEKDFQKYKNATKNTANDWDSDDDFEDENENADTLGELPAIGGKKKPKNKIRKKMGAMTDTTSFSMTSSALFRSEGLTLLDDRYEQLAKKFEEDEDEKTPEEFDIKKERSDFEGMLDDFLDNYELEKGGRRLVKKNDRLKAIQEAADSVSKSKTAARRKKEKSSMDKLGGSFGNLNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.64
3 0.55
4 0.47
5 0.44
6 0.45
7 0.43
8 0.44
9 0.37
10 0.3
11 0.32
12 0.33
13 0.29
14 0.24
15 0.23
16 0.2
17 0.21
18 0.21
19 0.18
20 0.15
21 0.17
22 0.22
23 0.24
24 0.34
25 0.42
26 0.47
27 0.52
28 0.56
29 0.63
30 0.67
31 0.71
32 0.71
33 0.73
34 0.75
35 0.76
36 0.82
37 0.78
38 0.75
39 0.7
40 0.62
41 0.59
42 0.57
43 0.56
44 0.5
45 0.46
46 0.4
47 0.4
48 0.37
49 0.29
50 0.23
51 0.17
52 0.23
53 0.24
54 0.25
55 0.29
56 0.33
57 0.35
58 0.37
59 0.36
60 0.28
61 0.28
62 0.27
63 0.21
64 0.17
65 0.13
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.09
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.16
78 0.22
79 0.24
80 0.26
81 0.3
82 0.31
83 0.31
84 0.35
85 0.34
86 0.28
87 0.28
88 0.23
89 0.24
90 0.22
91 0.2
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.05
98 0.07
99 0.09
100 0.16
101 0.21
102 0.26
103 0.3
104 0.32
105 0.37
106 0.45
107 0.53
108 0.47
109 0.47
110 0.48
111 0.44
112 0.42
113 0.37
114 0.31
115 0.24
116 0.26
117 0.28
118 0.27
119 0.3
120 0.34
121 0.38
122 0.4
123 0.43
124 0.42
125 0.44
126 0.42
127 0.43
128 0.46
129 0.42
130 0.36
131 0.32
132 0.29
133 0.22
134 0.19
135 0.15
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.16
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.14
145 0.16
146 0.15
147 0.13
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.03
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.15
243 0.15
244 0.22
245 0.29
246 0.27
247 0.33
248 0.39
249 0.46
250 0.51
251 0.54
252 0.52
253 0.52
254 0.56
255 0.52
256 0.54
257 0.47
258 0.39
259 0.38
260 0.36
261 0.3
262 0.26
263 0.22
264 0.15
265 0.15
266 0.14
267 0.12
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.12
284 0.2
285 0.28
286 0.36
287 0.47
288 0.54
289 0.65
290 0.75
291 0.83
292 0.86
293 0.88
294 0.87
295 0.86
296 0.83
297 0.77
298 0.68
299 0.6
300 0.52
301 0.43
302 0.37
303 0.28
304 0.2
305 0.16
306 0.14
307 0.11
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.14
326 0.13
327 0.16
328 0.22
329 0.22
330 0.25
331 0.26
332 0.24
333 0.29
334 0.31
335 0.33
336 0.32
337 0.33
338 0.31
339 0.3
340 0.3
341 0.23
342 0.23
343 0.19
344 0.19
345 0.27
346 0.29
347 0.32
348 0.34
349 0.36
350 0.37
351 0.41
352 0.36
353 0.28
354 0.34
355 0.3
356 0.28
357 0.26
358 0.22
359 0.17
360 0.17
361 0.14
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.14
368 0.15
369 0.21
370 0.27
371 0.3
372 0.38
373 0.48
374 0.59
375 0.63
376 0.72
377 0.73
378 0.75
379 0.74
380 0.71
381 0.69
382 0.64
383 0.57
384 0.48
385 0.42
386 0.37
387 0.37
388 0.33
389 0.25
390 0.21
391 0.18
392 0.18
393 0.23
394 0.29
395 0.37
396 0.47
397 0.55
398 0.65
399 0.73
400 0.84
401 0.87
402 0.88
403 0.88
404 0.88
405 0.87
406 0.83
407 0.79
408 0.69
409 0.64
410 0.54
411 0.47