Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y6L7

Protein Details
Accession C4Y6L7    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-195DPMLPPKFKLRKNRHKEPSPPPPIBasic
269-291RDDIRIRNQRRKEQAIQEQRDKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-189KFKLRKNRHKEP
308-311KRPG
314-323LRNIGKKSRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG clu:CLUG_03801  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MFSSLLPKPEHATHDTIPVSIIKESRRSALIVSPGISDRTKTHVIPNPNTADKTLSELHVSSDGSLDYAKTIALAQDSKVAVQATYEDTIPLKERYPNLKHHFPRYTLQNCPDKSLATCVEETRELIEKLISQSDGATEKSEGASFVNFTPSGMGDPDDGGKTIEIRDYKEDPMLPPKFKLRKNRHKEPSPPPPILKSSSNTKVTKELKDQWKIPSAVSNWKNNQGFSISLDKRVNATGMGGASVESSINVEKFSSLSSALENAHNQARDDIRIRNQRRKEQAIQEQRDKESQLRQLLERTRTERLGKRPGDDLRNIGKKSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.36
4 0.32
5 0.29
6 0.26
7 0.23
8 0.25
9 0.21
10 0.27
11 0.29
12 0.31
13 0.31
14 0.29
15 0.29
16 0.31
17 0.33
18 0.28
19 0.27
20 0.26
21 0.26
22 0.28
23 0.26
24 0.23
25 0.19
26 0.23
27 0.26
28 0.25
29 0.32
30 0.36
31 0.45
32 0.48
33 0.53
34 0.53
35 0.53
36 0.53
37 0.45
38 0.41
39 0.33
40 0.33
41 0.27
42 0.22
43 0.2
44 0.19
45 0.2
46 0.2
47 0.2
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.09
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.05
58 0.06
59 0.06
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.13
69 0.12
70 0.13
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.1
75 0.1
76 0.12
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.17
81 0.22
82 0.3
83 0.35
84 0.43
85 0.48
86 0.57
87 0.59
88 0.64
89 0.64
90 0.58
91 0.59
92 0.58
93 0.56
94 0.52
95 0.54
96 0.53
97 0.49
98 0.49
99 0.45
100 0.37
101 0.33
102 0.31
103 0.26
104 0.2
105 0.21
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.15
111 0.16
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.11
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.14
155 0.16
156 0.17
157 0.18
158 0.19
159 0.17
160 0.25
161 0.28
162 0.25
163 0.25
164 0.32
165 0.38
166 0.43
167 0.52
168 0.55
169 0.62
170 0.7
171 0.79
172 0.8
173 0.81
174 0.85
175 0.83
176 0.83
177 0.79
178 0.74
179 0.64
180 0.58
181 0.53
182 0.48
183 0.41
184 0.33
185 0.34
186 0.37
187 0.43
188 0.41
189 0.39
190 0.44
191 0.46
192 0.47
193 0.46
194 0.48
195 0.5
196 0.54
197 0.56
198 0.51
199 0.54
200 0.5
201 0.44
202 0.41
203 0.35
204 0.39
205 0.4
206 0.44
207 0.39
208 0.47
209 0.48
210 0.42
211 0.4
212 0.32
213 0.29
214 0.24
215 0.31
216 0.24
217 0.29
218 0.3
219 0.29
220 0.28
221 0.28
222 0.25
223 0.15
224 0.15
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.11
247 0.13
248 0.15
249 0.15
250 0.17
251 0.2
252 0.21
253 0.21
254 0.23
255 0.23
256 0.25
257 0.27
258 0.3
259 0.35
260 0.45
261 0.52
262 0.58
263 0.65
264 0.7
265 0.76
266 0.79
267 0.78
268 0.78
269 0.81
270 0.82
271 0.82
272 0.82
273 0.78
274 0.73
275 0.68
276 0.6
277 0.54
278 0.51
279 0.5
280 0.48
281 0.46
282 0.45
283 0.5
284 0.55
285 0.56
286 0.55
287 0.53
288 0.51
289 0.54
290 0.59
291 0.59
292 0.6
293 0.64
294 0.61
295 0.59
296 0.62
297 0.64
298 0.63
299 0.6
300 0.58
301 0.58
302 0.62
303 0.61