Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XYC4

Protein Details
Accession C4XYC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-180TSNGHKSKQHHIRRGRQEAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-175KNKPTEERASKSRTSNGHKSKQHHIRRG
Subcellular Location(s) plas 10, nucl 6, mito 4, cyto_nucl 4, pero 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007209  RNaseL-inhib-like_metal-bd_dom  
IPR022968  Tsr3-like  
IPR007177  Tsr3_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0106388  F:18S rRNA aminocarboxypropyltransferase activity  
GO:1904047  F:S-adenosyl-L-methionine binding  
GO:0000455  P:enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis  
KEGG clu:CLUG_00947  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04034  Ribo_biogen_C  
PF04068  RLI  
Amino Acid Sequences MSPTHSTLWRTFPWQERPTFSRREFRTTRRSVSWHRPTMPAPPRTPSPSTKTFRSRVTLGYKTHYVVRLFGCFFLSFFNHVFIGISSGPCASGMGSGHSFLICLIQKSQKTLSRVLWCKSSVHPVTPSLFTCSTDEPLIILHQMGKGKNKPTEERASKSRTSNGHKSKQHHIRRGRQEAGSQTKHASADFPVKLAMWDFDHCDPKRCSGKKLERLGYIKNLRVGQKFQGIVVSPNGTGVVCPNDREIVETMGAAVVECSWARLDEIPFNKIGGKNERLLPYLVAANTVNYGRPWKLNCVEALAACFAIVGHWEWAETLLENFSWGLTFLEINKELIEVYQQCTDSESVTAAQDEWMAKLEAEVQERKKQSAAGDVWMMGNVNRKGDSADEDDSETERSDEESEEVEYDNLGNIVRRGPADLAESEDESDSEEEPESEEYEYDKLGNIISKSTGLEQDMKTVQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.59
3 0.61
4 0.63
5 0.64
6 0.67
7 0.64
8 0.63
9 0.61
10 0.65
11 0.66
12 0.69
13 0.73
14 0.72
15 0.73
16 0.7
17 0.74
18 0.73
19 0.76
20 0.77
21 0.76
22 0.71
23 0.69
24 0.64
25 0.67
26 0.67
27 0.64
28 0.57
29 0.53
30 0.56
31 0.57
32 0.61
33 0.57
34 0.55
35 0.57
36 0.59
37 0.62
38 0.65
39 0.64
40 0.64
41 0.63
42 0.59
43 0.56
44 0.59
45 0.57
46 0.52
47 0.52
48 0.49
49 0.45
50 0.47
51 0.45
52 0.37
53 0.34
54 0.34
55 0.33
56 0.31
57 0.3
58 0.28
59 0.22
60 0.22
61 0.2
62 0.2
63 0.17
64 0.17
65 0.18
66 0.16
67 0.16
68 0.16
69 0.13
70 0.15
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.09
88 0.14
89 0.12
90 0.12
91 0.16
92 0.22
93 0.23
94 0.27
95 0.33
96 0.34
97 0.36
98 0.4
99 0.43
100 0.47
101 0.52
102 0.5
103 0.49
104 0.45
105 0.43
106 0.41
107 0.44
108 0.36
109 0.34
110 0.34
111 0.32
112 0.34
113 0.34
114 0.32
115 0.28
116 0.26
117 0.24
118 0.24
119 0.23
120 0.22
121 0.2
122 0.19
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.1
127 0.08
128 0.07
129 0.1
130 0.13
131 0.15
132 0.21
133 0.25
134 0.31
135 0.35
136 0.39
137 0.41
138 0.45
139 0.53
140 0.53
141 0.53
142 0.55
143 0.56
144 0.56
145 0.54
146 0.54
147 0.5
148 0.52
149 0.57
150 0.6
151 0.63
152 0.65
153 0.66
154 0.7
155 0.74
156 0.75
157 0.74
158 0.74
159 0.75
160 0.79
161 0.83
162 0.77
163 0.69
164 0.63
165 0.61
166 0.61
167 0.53
168 0.44
169 0.37
170 0.34
171 0.32
172 0.29
173 0.22
174 0.15
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.14
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.14
187 0.22
188 0.22
189 0.28
190 0.28
191 0.33
192 0.41
193 0.4
194 0.42
195 0.44
196 0.54
197 0.58
198 0.65
199 0.63
200 0.6
201 0.61
202 0.59
203 0.58
204 0.51
205 0.44
206 0.39
207 0.37
208 0.34
209 0.34
210 0.33
211 0.27
212 0.28
213 0.26
214 0.22
215 0.21
216 0.17
217 0.16
218 0.16
219 0.14
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.13
233 0.13
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.05
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.07
250 0.08
251 0.14
252 0.16
253 0.17
254 0.17
255 0.17
256 0.19
257 0.19
258 0.22
259 0.23
260 0.24
261 0.25
262 0.3
263 0.32
264 0.3
265 0.29
266 0.25
267 0.2
268 0.19
269 0.16
270 0.13
271 0.11
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.08
277 0.11
278 0.11
279 0.14
280 0.16
281 0.21
282 0.23
283 0.24
284 0.24
285 0.25
286 0.25
287 0.21
288 0.21
289 0.15
290 0.12
291 0.1
292 0.1
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.14
324 0.11
325 0.13
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.18
330 0.19
331 0.15
332 0.14
333 0.13
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.13
347 0.15
348 0.19
349 0.24
350 0.27
351 0.34
352 0.36
353 0.38
354 0.35
355 0.34
356 0.31
357 0.34
358 0.32
359 0.28
360 0.27
361 0.27
362 0.25
363 0.23
364 0.22
365 0.14
366 0.2
367 0.18
368 0.18
369 0.18
370 0.18
371 0.19
372 0.21
373 0.24
374 0.21
375 0.22
376 0.21
377 0.22
378 0.23
379 0.23
380 0.22
381 0.18
382 0.14
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.1
401 0.12
402 0.13
403 0.15
404 0.15
405 0.17
406 0.19
407 0.19
408 0.22
409 0.22
410 0.22
411 0.21
412 0.2
413 0.18
414 0.17
415 0.17
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.11
420 0.12
421 0.14
422 0.13
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.13
427 0.13
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.12
432 0.16
433 0.15
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.19
438 0.21
439 0.23
440 0.22
441 0.28
442 0.26
443 0.31