FuNGI

C4YB39

Protein Details

Accession

C4YB39

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
238-266	DKTGPVKMKKLKMKKPKQKRKAIDDTVKV	Basic
506-527	DVNPHSKYSRYEKKPDRLSDYR	Hydrophilic
550-572	QLSHKYHGSAPKQKKESPKAKSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
243-258	VKMKKLKMKKPKQKRK
296-301	KKVKRR
561-568	KQKKESPK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 13.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	clu:CLUG_05331 -
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MAAEIELSIAETNKLRAQLGLPLIPVSEEREEKSPERDSSELTIEQTNKLRASLGLRQLEDAPPKRKNATPSNTKSAANRFSASQVSADLYKEVDTDAWLEGLGKGKRSTKMPETIAAQDDDEPQMEVAHDAKVLAEVADGDVFTLEDQDLLGEGNDVLSNEKLAKVSKQKQDETERKKIDRLRFGAKVSFESDDDMESAGPVVIRGTSIDISEKPDSPPMPIHSVSAPLFQDEPAEDKTGPVKMKKLKMKKPKQKRKAIDDTVKVTEPMVTQTLLEEEQEDAEELEAILAASRDKKVKRRKLMSAEEIAHEVSLHSRLDTVDKIDGIVYDSTKDFLDTLSAEKDARGEKGNGKEIEEEVEKVEGKEEVENEDHQPRELVSGVEKIDEVQVEKSADNELGQRESDDVRSEAKTQAPLNSLSATLQYLRKSNFVPDTNEEQKQVEKKLREARKEAQLMKLQISIEERTLREELEKDSGYKGLPAKEKENTFDRILNQRLIEKGLVSDVNPHSKYSRYEKKPDRLSDYRPQVKLSYKDEKGNLLDRKQAWKQLSHKYHGSAPKQKKESPKAKSELEPREIHPE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.18
3	0.18
4	0.19
5	0.24
6	0.28
7	0.27
8	0.25
9	0.23
10	0.23
11	0.22
12	0.21
13	0.19
14	0.2
15	0.2
16	0.22
17	0.26
18	0.32
19	0.33
20	0.39
21	0.41
22	0.39
23	0.43
24	0.41
25	0.4
26	0.39
27	0.42
28	0.37
29	0.32
30	0.35
31	0.31
32	0.34
33	0.36
34	0.36
35	0.31
36	0.3
37	0.29
38	0.25
39	0.3
40	0.34
41	0.37
42	0.39
43	0.39
44	0.4
45	0.42
46	0.44
47	0.47
48	0.47
49	0.46
50	0.45
51	0.49
52	0.51
53	0.53
54	0.56
55	0.58
56	0.6
57	0.63
58	0.66
59	0.7
60	0.69
61	0.67
62	0.64
63	0.62
64	0.58
65	0.5
66	0.44
67	0.37
68	0.37
69	0.37
70	0.33
71	0.25
72	0.2
73	0.18
74	0.18
75	0.18
76	0.15
77	0.13
78	0.12
79	0.12
80	0.11
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.09
85	0.08
86	0.08
87	0.08
88	0.09
89	0.16
90	0.17
91	0.18
92	0.21
93	0.26
94	0.3
95	0.34
96	0.4
97	0.4
98	0.46
99	0.46
100	0.47
101	0.46
102	0.46
103	0.44
104	0.38
105	0.31
106	0.25
107	0.24
108	0.21
109	0.17
110	0.14
111	0.11
112	0.11
113	0.1
114	0.09
115	0.08
116	0.08
117	0.08
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.06
123	0.05
124	0.05
125	0.05
126	0.06
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.04
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.04
138	0.04
139	0.04
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.05
144	0.05
145	0.06
146	0.06
147	0.07
148	0.07
149	0.08
150	0.09
151	0.1
152	0.16
153	0.25
154	0.33
155	0.4
156	0.47
157	0.5
158	0.56
159	0.66
160	0.7
161	0.69
162	0.71
163	0.7
164	0.65
165	0.67
166	0.67
167	0.65
168	0.64
169	0.6
170	0.57
171	0.54
172	0.55
173	0.52
174	0.46
175	0.4
176	0.33
177	0.29
178	0.22
179	0.2
180	0.18
181	0.14
182	0.13
183	0.11
184	0.09
185	0.07
186	0.07
187	0.05
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.06
195	0.06
196	0.07
197	0.09
198	0.09
199	0.14
200	0.16
201	0.17
202	0.16
203	0.19
204	0.19
205	0.2
206	0.22
207	0.2
208	0.23
209	0.23
210	0.23
211	0.2
212	0.23
213	0.22
214	0.21
215	0.18
216	0.14
217	0.14
218	0.13
219	0.13
220	0.1
221	0.12
222	0.11
223	0.13
224	0.12
225	0.12
226	0.14
227	0.17
228	0.19
229	0.17
230	0.23
231	0.27
232	0.35
233	0.44
234	0.52
235	0.57
236	0.67
237	0.76
238	0.8
239	0.85
240	0.89
241	0.9
242	0.91
243	0.89
244	0.88
245	0.88
246	0.86
247	0.83
248	0.76
249	0.7
250	0.62
251	0.54
252	0.44
253	0.34
254	0.26
255	0.18
256	0.14
257	0.11
258	0.09
259	0.08
260	0.08
261	0.09
262	0.08
263	0.07
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.06
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.04
280	0.06
281	0.11
282	0.14
283	0.23
284	0.33
285	0.43
286	0.52
287	0.58
288	0.65
289	0.7
290	0.74
291	0.71
292	0.66
293	0.58
294	0.49
295	0.43
296	0.34
297	0.25
298	0.17
299	0.12
300	0.07
301	0.08
302	0.07
303	0.06
304	0.06
305	0.07
306	0.09
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.07
323	0.06
324	0.07
325	0.06
326	0.08
327	0.08
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.11
332	0.11
333	0.12
334	0.13
335	0.14
336	0.19
337	0.24
338	0.31
339	0.3
340	0.3
341	0.3
342	0.27
343	0.28
344	0.24
345	0.19
346	0.13
347	0.14
348	0.13
349	0.11
350	0.12
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.1
355	0.11
356	0.13
357	0.14
358	0.16
359	0.2
360	0.19
361	0.18
362	0.18
363	0.15
364	0.15
365	0.14
366	0.12
367	0.09
368	0.12
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.08
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.12
385	0.12
386	0.12
387	0.12
388	0.12
389	0.12
390	0.13
391	0.14
392	0.14
393	0.13
394	0.14
395	0.16
396	0.18
397	0.19
398	0.2
399	0.22
400	0.22
401	0.24
402	0.24
403	0.24
404	0.23
405	0.22
406	0.2
407	0.16
408	0.15
409	0.13
410	0.13
411	0.15
412	0.15
413	0.19
414	0.2
415	0.22
416	0.22
417	0.27
418	0.31
419	0.32
420	0.35
421	0.36
422	0.43
423	0.46
424	0.46
425	0.42
426	0.36
427	0.38
428	0.38
429	0.39
430	0.38
431	0.36
432	0.42
433	0.5
434	0.57
435	0.59
436	0.62
437	0.62
438	0.64
439	0.7
440	0.65
441	0.62
442	0.6
443	0.55
444	0.5
445	0.46
446	0.37
447	0.31
448	0.31
449	0.25
450	0.22
451	0.24
452	0.23
453	0.23
454	0.24
455	0.22
456	0.22
457	0.22
458	0.22
459	0.24
460	0.24
461	0.22
462	0.22
463	0.23
464	0.21
465	0.23
466	0.24
467	0.25
468	0.31
469	0.33
470	0.37
471	0.43
472	0.45
473	0.45
474	0.47
475	0.45
476	0.41
477	0.41
478	0.4
479	0.42
480	0.43
481	0.42
482	0.39
483	0.38
484	0.36
485	0.35
486	0.31
487	0.23
488	0.2
489	0.19
490	0.18
491	0.15
492	0.22
493	0.23
494	0.31
495	0.31
496	0.32
497	0.31
498	0.34
499	0.4
500	0.42
501	0.49
502	0.48
503	0.58
504	0.67
505	0.75
506	0.81
507	0.83
508	0.82
509	0.78
510	0.78
511	0.78
512	0.79
513	0.77
514	0.69
515	0.65
516	0.6
517	0.61
518	0.61
519	0.58
520	0.58
521	0.53
522	0.58
523	0.58
524	0.58
525	0.55
526	0.57
527	0.56
528	0.5
529	0.53
530	0.5
531	0.57
532	0.56
533	0.59
534	0.54
535	0.55
536	0.59
537	0.62
538	0.67
539	0.65
540	0.64
541	0.6
542	0.65
543	0.65
544	0.67
545	0.67
546	0.69
547	0.73
548	0.75
549	0.78
550	0.8
551	0.82
552	0.82
553	0.8
554	0.8
555	0.76
556	0.76
557	0.78
558	0.77
559	0.76
560	0.73
561	0.68

C4YB39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer