Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y4K3

Protein Details
Accession C4Y4K3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-156ASPPYSPHFKVNKKRGRKKKASAVCKQCLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
138-148VNKKRGRKKKA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG clu:CLUG_02575  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MYNSSWEHKSLSCFPSLWQPPVVQIGDSSDHPKPTQMKSSTRLPSISEMLAGINNYSTPSHWPITPIHKNSNQPRSFEGINFASSQFQVHQPQTSISPRSHQYVSLDAKRILTYGNSSSFHQGEIQVASPPYSPHFKVNKKRGRKKKASAVCKQCLSTQTPEWRCGPNGSRTLCNACGLYYSKLKKKFGSKEAGQIFGYKKRHNQVHVRVVPTSQEKHMFCNSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.4
3 0.42
4 0.39
5 0.34
6 0.31
7 0.31
8 0.36
9 0.35
10 0.25
11 0.2
12 0.21
13 0.21
14 0.22
15 0.25
16 0.21
17 0.23
18 0.23
19 0.28
20 0.3
21 0.32
22 0.4
23 0.41
24 0.45
25 0.48
26 0.57
27 0.57
28 0.54
29 0.5
30 0.43
31 0.41
32 0.38
33 0.33
34 0.24
35 0.19
36 0.16
37 0.16
38 0.14
39 0.1
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.11
46 0.15
47 0.16
48 0.16
49 0.19
50 0.22
51 0.31
52 0.39
53 0.4
54 0.43
55 0.47
56 0.55
57 0.61
58 0.68
59 0.61
60 0.54
61 0.52
62 0.5
63 0.45
64 0.37
65 0.33
66 0.24
67 0.22
68 0.21
69 0.19
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.11
74 0.13
75 0.16
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.2
81 0.23
82 0.22
83 0.18
84 0.21
85 0.22
86 0.24
87 0.24
88 0.22
89 0.2
90 0.24
91 0.28
92 0.28
93 0.29
94 0.26
95 0.26
96 0.25
97 0.23
98 0.17
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.15
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.13
120 0.14
121 0.2
122 0.29
123 0.37
124 0.47
125 0.57
126 0.64
127 0.72
128 0.81
129 0.84
130 0.87
131 0.88
132 0.88
133 0.87
134 0.88
135 0.86
136 0.86
137 0.84
138 0.8
139 0.73
140 0.65
141 0.58
142 0.51
143 0.46
144 0.41
145 0.38
146 0.41
147 0.41
148 0.43
149 0.43
150 0.42
151 0.4
152 0.4
153 0.38
154 0.36
155 0.4
156 0.39
157 0.39
158 0.4
159 0.43
160 0.39
161 0.36
162 0.29
163 0.22
164 0.22
165 0.23
166 0.23
167 0.26
168 0.32
169 0.38
170 0.45
171 0.48
172 0.51
173 0.58
174 0.64
175 0.64
176 0.67
177 0.63
178 0.65
179 0.65
180 0.63
181 0.53
182 0.48
183 0.44
184 0.43
185 0.46
186 0.41
187 0.45
188 0.5
189 0.57
190 0.6
191 0.67
192 0.69
193 0.74
194 0.75
195 0.71
196 0.63
197 0.57
198 0.56
199 0.52
200 0.45
201 0.4
202 0.41
203 0.39
204 0.43