Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y1X6

Protein Details
Accession C4Y1X6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
779-801LQQQRRAMRPQQQQQPQHQQQQQHydrophilic
804-824QQQQQQQQQQQQQRQQQQQLQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG clu:CLUG_02208  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSRDPCVLSAHILFLSNPARMKNWNGARPTAQQLQQLTPAQRQALQQQLQARANGSPLLQQQLRQARSKLGNYHFASTTSEILRKYAKYPPSLTFHIYDTHFRFNNTQDSSIIPRNSPMARSFLTHILREEIPTEMAELLKDFAVRFYDGCLVLQVYDHRTRGGNASNSNASANGNGKSSDSKDGEQGGESNGTAASDKTGAKNVRPKTYRTLLRPTPLSLYYDLLYHTDSALTKFTDQLSLQMEAEILNLTQRKVDLSVPLNPYVHDEYLRPESEYPKKVWDKKTGDWKMVHSHRDEVPRVSRRLHEDSLVIHRSSEYEELMCLLSNNYKAPDASAAKRLVVVGPSATTADPSSLEATPAPDKTKRDKPASSVLGNATSNQFMRLRFIEEIRKRKESQKAAAAAVAVPRDAMAAQRQQHMKQQQQQQQQNLHQQNLHQPQNPQAVPTQQNPGQAMPNSQVGSGQQNPQLRQQLQQQQQQSSPQQQMHQMGQMGQMGQMGQAQNGPMQMQNSQGAQNAQYGQARFAQTRPQMTKQAQLMRAQQLQIQQARQQQMRAQQLQAPPAKRAKMAPALNQNLNPNQHSPTVPAQNIPSQNVGQNMPSQNVSQQNMSPNMSQNMSSNMSQNMSPNMAQNVPAQAGSPYGLSPPGSGLATPVVPSGMPTPQMGLSSPQMGQMASPNVNRMAPRPATQPSAPVPSAQQQQQQIFQMSLTPQEQHTFRQLQARMNALVQMGNTGVAPNRSRLTPPQQQQAMQQAKHIQQQLLQRFPTYFQRLRQFQLLQQQRRAMRPQQQQQPQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRQQQQQLQQQLQQQQLQQSQLQQQSQLQQQIPQQQVQQPDLDMYMGMNMSSPMMQQQMMGSPMMQQINKNMKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.22
4 0.23
5 0.23
6 0.25
7 0.27
8 0.33
9 0.37
10 0.43
11 0.47
12 0.49
13 0.52
14 0.55
15 0.57
16 0.58
17 0.56
18 0.51
19 0.49
20 0.49
21 0.47
22 0.49
23 0.5
24 0.47
25 0.44
26 0.44
27 0.4
28 0.4
29 0.4
30 0.4
31 0.43
32 0.43
33 0.42
34 0.45
35 0.51
36 0.5
37 0.49
38 0.44
39 0.35
40 0.33
41 0.31
42 0.25
43 0.22
44 0.21
45 0.27
46 0.26
47 0.27
48 0.34
49 0.42
50 0.46
51 0.46
52 0.46
53 0.47
54 0.53
55 0.57
56 0.58
57 0.54
58 0.59
59 0.56
60 0.59
61 0.51
62 0.45
63 0.43
64 0.36
65 0.35
66 0.28
67 0.29
68 0.25
69 0.27
70 0.3
71 0.28
72 0.3
73 0.34
74 0.36
75 0.39
76 0.43
77 0.47
78 0.49
79 0.5
80 0.5
81 0.44
82 0.4
83 0.38
84 0.36
85 0.38
86 0.36
87 0.4
88 0.38
89 0.38
90 0.4
91 0.39
92 0.45
93 0.41
94 0.38
95 0.31
96 0.33
97 0.37
98 0.41
99 0.39
100 0.31
101 0.29
102 0.32
103 0.33
104 0.32
105 0.28
106 0.27
107 0.26
108 0.28
109 0.3
110 0.33
111 0.35
112 0.33
113 0.33
114 0.31
115 0.31
116 0.29
117 0.27
118 0.2
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.17
136 0.16
137 0.17
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.15
142 0.15
143 0.17
144 0.21
145 0.22
146 0.22
147 0.23
148 0.24
149 0.27
150 0.32
151 0.32
152 0.29
153 0.34
154 0.34
155 0.34
156 0.33
157 0.28
158 0.22
159 0.19
160 0.19
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.18
166 0.2
167 0.25
168 0.25
169 0.25
170 0.27
171 0.29
172 0.28
173 0.26
174 0.24
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.13
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.19
188 0.2
189 0.26
190 0.34
191 0.38
192 0.46
193 0.47
194 0.5
195 0.51
196 0.59
197 0.61
198 0.59
199 0.63
200 0.58
201 0.62
202 0.6
203 0.54
204 0.49
205 0.42
206 0.39
207 0.31
208 0.27
209 0.21
210 0.19
211 0.18
212 0.15
213 0.14
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.14
223 0.14
224 0.16
225 0.15
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.19
230 0.17
231 0.16
232 0.13
233 0.13
234 0.1
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.14
244 0.16
245 0.18
246 0.25
247 0.28
248 0.3
249 0.3
250 0.28
251 0.31
252 0.28
253 0.26
254 0.2
255 0.17
256 0.18
257 0.23
258 0.24
259 0.21
260 0.2
261 0.25
262 0.32
263 0.35
264 0.33
265 0.37
266 0.45
267 0.51
268 0.56
269 0.6
270 0.58
271 0.61
272 0.71
273 0.67
274 0.64
275 0.58
276 0.55
277 0.54
278 0.54
279 0.51
280 0.42
281 0.41
282 0.4
283 0.45
284 0.44
285 0.39
286 0.41
287 0.44
288 0.45
289 0.43
290 0.42
291 0.42
292 0.47
293 0.44
294 0.36
295 0.31
296 0.31
297 0.36
298 0.35
299 0.28
300 0.21
301 0.2
302 0.19
303 0.2
304 0.18
305 0.12
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.16
321 0.18
322 0.19
323 0.24
324 0.23
325 0.23
326 0.23
327 0.23
328 0.18
329 0.15
330 0.13
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.09
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.11
346 0.13
347 0.14
348 0.16
349 0.17
350 0.21
351 0.27
352 0.36
353 0.41
354 0.45
355 0.46
356 0.47
357 0.53
358 0.55
359 0.48
360 0.42
361 0.36
362 0.32
363 0.3
364 0.26
365 0.18
366 0.14
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.11
371 0.14
372 0.14
373 0.16
374 0.16
375 0.19
376 0.26
377 0.32
378 0.41
379 0.43
380 0.46
381 0.46
382 0.51
383 0.58
384 0.54
385 0.53
386 0.51
387 0.49
388 0.45
389 0.43
390 0.36
391 0.28
392 0.23
393 0.17
394 0.1
395 0.07
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.07
401 0.11
402 0.13
403 0.18
404 0.2
405 0.22
406 0.28
407 0.33
408 0.37
409 0.4
410 0.48
411 0.51
412 0.58
413 0.62
414 0.61
415 0.61
416 0.59
417 0.62
418 0.55
419 0.49
420 0.4
421 0.36
422 0.4
423 0.41
424 0.4
425 0.33
426 0.31
427 0.35
428 0.41
429 0.39
430 0.32
431 0.26
432 0.27
433 0.27
434 0.28
435 0.27
436 0.22
437 0.25
438 0.25
439 0.25
440 0.22
441 0.19
442 0.19
443 0.16
444 0.16
445 0.14
446 0.13
447 0.13
448 0.11
449 0.14
450 0.15
451 0.16
452 0.17
453 0.2
454 0.22
455 0.26
456 0.31
457 0.28
458 0.29
459 0.34
460 0.39
461 0.43
462 0.47
463 0.47
464 0.43
465 0.44
466 0.46
467 0.41
468 0.37
469 0.35
470 0.31
471 0.29
472 0.31
473 0.32
474 0.28
475 0.27
476 0.22
477 0.18
478 0.18
479 0.17
480 0.13
481 0.1
482 0.09
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.07
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.09
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.13
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.14
508 0.14
509 0.17
510 0.18
511 0.17
512 0.17
513 0.22
514 0.23
515 0.3
516 0.33
517 0.33
518 0.38
519 0.39
520 0.44
521 0.42
522 0.46
523 0.42
524 0.42
525 0.43
526 0.41
527 0.42
528 0.36
529 0.33
530 0.3
531 0.32
532 0.31
533 0.27
534 0.27
535 0.3
536 0.35
537 0.34
538 0.32
539 0.3
540 0.34
541 0.41
542 0.38
543 0.34
544 0.34
545 0.35
546 0.41
547 0.42
548 0.36
549 0.33
550 0.35
551 0.35
552 0.31
553 0.31
554 0.29
555 0.33
556 0.35
557 0.37
558 0.42
559 0.45
560 0.46
561 0.46
562 0.44
563 0.39
564 0.38
565 0.34
566 0.26
567 0.24
568 0.24
569 0.23
570 0.23
571 0.25
572 0.29
573 0.27
574 0.27
575 0.26
576 0.3
577 0.31
578 0.29
579 0.26
580 0.21
581 0.22
582 0.23
583 0.22
584 0.17
585 0.2
586 0.2
587 0.19
588 0.19
589 0.18
590 0.19
591 0.24
592 0.24
593 0.21
594 0.22
595 0.25
596 0.27
597 0.29
598 0.26
599 0.24
600 0.24
601 0.23
602 0.22
603 0.18
604 0.2
605 0.2
606 0.2
607 0.19
608 0.18
609 0.18
610 0.18
611 0.19
612 0.16
613 0.15
614 0.15
615 0.15
616 0.16
617 0.16
618 0.17
619 0.16
620 0.16
621 0.15
622 0.14
623 0.13
624 0.11
625 0.11
626 0.1
627 0.09
628 0.07
629 0.07
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.09
635 0.09
636 0.08
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.09
641 0.08
642 0.07
643 0.07
644 0.08
645 0.09
646 0.09
647 0.1
648 0.1
649 0.12
650 0.12
651 0.13
652 0.13
653 0.14
654 0.14
655 0.15
656 0.15
657 0.15
658 0.15
659 0.14
660 0.13
661 0.14
662 0.17
663 0.18
664 0.18
665 0.18
666 0.19
667 0.21
668 0.22
669 0.2
670 0.24
671 0.23
672 0.25
673 0.28
674 0.3
675 0.33
676 0.33
677 0.35
678 0.32
679 0.36
680 0.33
681 0.29
682 0.29
683 0.3
684 0.35
685 0.34
686 0.36
687 0.36
688 0.38
689 0.41
690 0.41
691 0.36
692 0.31
693 0.27
694 0.25
695 0.19
696 0.21
697 0.18
698 0.16
699 0.16
700 0.2
701 0.21
702 0.21
703 0.28
704 0.27
705 0.28
706 0.35
707 0.37
708 0.39
709 0.42
710 0.43
711 0.37
712 0.34
713 0.34
714 0.26
715 0.23
716 0.17
717 0.14
718 0.1
719 0.09
720 0.09
721 0.08
722 0.09
723 0.12
724 0.13
725 0.16
726 0.18
727 0.19
728 0.22
729 0.29
730 0.36
731 0.41
732 0.46
733 0.53
734 0.55
735 0.55
736 0.57
737 0.6
738 0.6
739 0.5
740 0.49
741 0.46
742 0.46
743 0.51
744 0.5
745 0.41
746 0.37
747 0.46
748 0.49
749 0.49
750 0.46
751 0.41
752 0.38
753 0.4
754 0.45
755 0.44
756 0.41
757 0.42
758 0.51
759 0.53
760 0.56
761 0.61
762 0.54
763 0.5
764 0.56
765 0.59
766 0.56
767 0.58
768 0.62
769 0.59
770 0.62
771 0.64
772 0.62
773 0.62
774 0.65
775 0.68
776 0.71
777 0.76
778 0.79
779 0.82
780 0.85
781 0.84
782 0.83
783 0.79
784 0.77
785 0.76
786 0.79
787 0.78
788 0.76
789 0.74
790 0.73
791 0.76
792 0.76
793 0.77
794 0.75
795 0.74
796 0.73
797 0.75
798 0.76
799 0.77
800 0.77
801 0.78
802 0.79
803 0.8
804 0.8
805 0.81
806 0.79
807 0.78
808 0.77
809 0.78
810 0.73
811 0.68
812 0.66
813 0.64
814 0.62
815 0.58
816 0.53
817 0.5
818 0.5
819 0.48
820 0.44
821 0.43
822 0.45
823 0.47
824 0.45
825 0.41
826 0.41
827 0.44
828 0.48
829 0.49
830 0.42
831 0.41
832 0.45
833 0.51
834 0.51
835 0.47
836 0.46
837 0.43
838 0.48
839 0.45
840 0.41
841 0.33
842 0.31
843 0.28
844 0.23
845 0.18
846 0.13
847 0.12
848 0.1
849 0.09
850 0.08
851 0.08
852 0.08
853 0.09
854 0.09
855 0.09
856 0.11
857 0.11
858 0.12
859 0.13
860 0.16
861 0.17
862 0.17
863 0.15
864 0.16
865 0.21
866 0.25
867 0.25
868 0.23
869 0.31