Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XVT5

Protein Details
Accession C4XVT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-125NSMAQEKNRKRERKLKERVFYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-119RKRERKL
Subcellular Location(s) nucl 23.5, mito_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG clu:CLUG_00014  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MGSDLLRQKKAIEQKKAEIARIKKEIETKLGAKRQIIPSKFQYLLYLPRESQESNHENHSQQHNQYYDVFLVDDDGRSLMSLKGWIQSKKAGDHHLETSNDSHNNSMAQEKNRKRERKLKERVFYALPHSWLASNMASTDDCDRVQVNNVTYAVVNGGKRLIPLSNPDADQSPSVEWGSWTYRKSVHGTLKRTDMTKVPIYCRSFSRTGVCEEGESCKHIHDRRMQRLCWDFLNDQCHGECSLSHMSSEYNVPLCSYFLAGNCKNPACSFSHNPPPHSMDDKYSIWLCRPFSKGGWCIRGKKCPFLHLYQCPDYEEYGQCPLGNNCNLQHVDSESSSDPQKIIINSFTVNPVVLFTGCNNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.7
3 0.72
4 0.7
5 0.68
6 0.65
7 0.64
8 0.64
9 0.59
10 0.54
11 0.57
12 0.55
13 0.52
14 0.53
15 0.49
16 0.52
17 0.56
18 0.55
19 0.5
20 0.54
21 0.58
22 0.61
23 0.58
24 0.55
25 0.54
26 0.58
27 0.56
28 0.49
29 0.42
30 0.36
31 0.42
32 0.4
33 0.39
34 0.32
35 0.32
36 0.35
37 0.32
38 0.3
39 0.31
40 0.31
41 0.29
42 0.34
43 0.37
44 0.35
45 0.41
46 0.47
47 0.44
48 0.43
49 0.48
50 0.43
51 0.42
52 0.41
53 0.36
54 0.29
55 0.23
56 0.2
57 0.12
58 0.14
59 0.12
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.15
71 0.2
72 0.22
73 0.23
74 0.28
75 0.3
76 0.34
77 0.38
78 0.38
79 0.37
80 0.39
81 0.41
82 0.41
83 0.39
84 0.34
85 0.33
86 0.32
87 0.3
88 0.27
89 0.23
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.2
94 0.2
95 0.25
96 0.34
97 0.4
98 0.5
99 0.59
100 0.65
101 0.67
102 0.72
103 0.76
104 0.77
105 0.82
106 0.82
107 0.79
108 0.76
109 0.73
110 0.65
111 0.57
112 0.52
113 0.44
114 0.35
115 0.29
116 0.26
117 0.22
118 0.19
119 0.19
120 0.13
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.15
133 0.17
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.07
150 0.11
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.13
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.17
170 0.2
171 0.23
172 0.27
173 0.33
174 0.36
175 0.4
176 0.41
177 0.44
178 0.43
179 0.41
180 0.36
181 0.29
182 0.27
183 0.28
184 0.28
185 0.27
186 0.32
187 0.34
188 0.34
189 0.34
190 0.34
191 0.31
192 0.3
193 0.31
194 0.26
195 0.26
196 0.26
197 0.24
198 0.2
199 0.19
200 0.2
201 0.17
202 0.16
203 0.14
204 0.13
205 0.18
206 0.21
207 0.26
208 0.32
209 0.41
210 0.5
211 0.57
212 0.56
213 0.57
214 0.59
215 0.55
216 0.48
217 0.43
218 0.34
219 0.31
220 0.35
221 0.29
222 0.25
223 0.23
224 0.23
225 0.18
226 0.17
227 0.12
228 0.13
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.17
236 0.14
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.18
247 0.19
248 0.22
249 0.26
250 0.26
251 0.26
252 0.25
253 0.26
254 0.22
255 0.29
256 0.31
257 0.34
258 0.44
259 0.47
260 0.49
261 0.51
262 0.5
263 0.48
264 0.47
265 0.41
266 0.34
267 0.37
268 0.35
269 0.34
270 0.33
271 0.29
272 0.28
273 0.31
274 0.3
275 0.3
276 0.32
277 0.32
278 0.32
279 0.39
280 0.42
281 0.45
282 0.51
283 0.51
284 0.57
285 0.61
286 0.68
287 0.64
288 0.66
289 0.62
290 0.61
291 0.61
292 0.59
293 0.62
294 0.6
295 0.65
296 0.6
297 0.58
298 0.53
299 0.49
300 0.43
301 0.38
302 0.32
303 0.26
304 0.26
305 0.25
306 0.23
307 0.25
308 0.25
309 0.28
310 0.29
311 0.29
312 0.26
313 0.33
314 0.33
315 0.31
316 0.3
317 0.26
318 0.27
319 0.24
320 0.27
321 0.22
322 0.24
323 0.25
324 0.24
325 0.21
326 0.19
327 0.24
328 0.21
329 0.23
330 0.23
331 0.23
332 0.23
333 0.25
334 0.25
335 0.21
336 0.19
337 0.16
338 0.15
339 0.14
340 0.13
341 0.13