Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4YBA4

Protein Details
Accession C4YBA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-308PENWLMLHRWGKRRKEKAKTKMGYSVHydrophilic
323-346ELQKRMGPAVKRRKTSKEKQSDDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-302WGKRRKEKAKT
333-336KRRK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.833, cyto 9, cyto_mito 7.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015886  DNA_glyclase/AP_lyase_DNA-bd  
IPR012319  FPG_cat  
IPR035937  MutM-like_N-ter  
IPR010979  Ribosomal_S13-like_H2TH  
Gene Ontology GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0019104  F:DNA N-glycosylase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
KEGG clu:CLUG_05482  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01149  Fapy_DNA_glyco  
PF06831  H2TH  
Amino Acid Sequences MAVLMHFGMTGMIHLRDVKSHLVFMENGGDKKIKSEKENGDETPELESEPEPQEWPPRFSKFELELENGQKTELAFVDPRRLARVRLLWGPECSSDELLMQQEPLKRQGPDYSKGGEREVKKEEGEVKREVKKEEGEVKEEVNKIKEEAEGEEGLAKAEQDVISLFSPSHEPSVSDFPRPTVFHPDPDPDPHGRARLAFPDFAKLVLSRRKPIKALLLDQAFFAGVGNWVSDEILYHAQIHPSENLAEHISDPEDPRLARLYYSLIYVMEVSVAVEGNVREFPENWLMLHRWGKRRKEKAKTKMGYSVAFETVGGRTSCFVPELQKRMGPAVKRRKTSKEKQSDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.15
4 0.18
5 0.23
6 0.22
7 0.23
8 0.23
9 0.23
10 0.23
11 0.22
12 0.28
13 0.26
14 0.25
15 0.26
16 0.27
17 0.24
18 0.3
19 0.36
20 0.33
21 0.33
22 0.43
23 0.49
24 0.54
25 0.6
26 0.55
27 0.54
28 0.5
29 0.45
30 0.39
31 0.3
32 0.24
33 0.19
34 0.18
35 0.16
36 0.18
37 0.18
38 0.16
39 0.17
40 0.26
41 0.28
42 0.33
43 0.35
44 0.37
45 0.39
46 0.4
47 0.46
48 0.42
49 0.45
50 0.44
51 0.42
52 0.43
53 0.43
54 0.43
55 0.36
56 0.31
57 0.26
58 0.22
59 0.19
60 0.14
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.23
65 0.24
66 0.25
67 0.29
68 0.3
69 0.28
70 0.31
71 0.36
72 0.32
73 0.35
74 0.39
75 0.37
76 0.37
77 0.38
78 0.33
79 0.29
80 0.27
81 0.22
82 0.18
83 0.15
84 0.15
85 0.14
86 0.13
87 0.11
88 0.12
89 0.15
90 0.16
91 0.21
92 0.23
93 0.22
94 0.23
95 0.31
96 0.32
97 0.34
98 0.35
99 0.34
100 0.34
101 0.35
102 0.37
103 0.35
104 0.32
105 0.33
106 0.34
107 0.33
108 0.3
109 0.31
110 0.37
111 0.36
112 0.38
113 0.37
114 0.39
115 0.43
116 0.46
117 0.44
118 0.39
119 0.35
120 0.37
121 0.4
122 0.37
123 0.34
124 0.32
125 0.32
126 0.33
127 0.33
128 0.29
129 0.22
130 0.2
131 0.17
132 0.17
133 0.17
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.07
158 0.08
159 0.1
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.19
164 0.19
165 0.23
166 0.23
167 0.22
168 0.24
169 0.24
170 0.24
171 0.26
172 0.28
173 0.26
174 0.29
175 0.3
176 0.22
177 0.24
178 0.23
179 0.23
180 0.2
181 0.2
182 0.18
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.18
191 0.13
192 0.16
193 0.22
194 0.24
195 0.27
196 0.32
197 0.35
198 0.35
199 0.37
200 0.41
201 0.38
202 0.39
203 0.39
204 0.37
205 0.34
206 0.33
207 0.3
208 0.21
209 0.17
210 0.13
211 0.06
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.12
226 0.12
227 0.14
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.15
244 0.17
245 0.17
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.15
250 0.16
251 0.15
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.15
270 0.18
271 0.19
272 0.18
273 0.21
274 0.22
275 0.27
276 0.34
277 0.37
278 0.42
279 0.5
280 0.6
281 0.67
282 0.77
283 0.81
284 0.84
285 0.88
286 0.89
287 0.91
288 0.87
289 0.82
290 0.8
291 0.74
292 0.66
293 0.59
294 0.52
295 0.42
296 0.36
297 0.31
298 0.23
299 0.19
300 0.2
301 0.16
302 0.13
303 0.13
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.16
308 0.2
309 0.28
310 0.34
311 0.37
312 0.37
313 0.38
314 0.44
315 0.48
316 0.48
317 0.5
318 0.55
319 0.6
320 0.67
321 0.72
322 0.76
323 0.81
324 0.84
325 0.84
326 0.84