Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y7M1

Protein Details
Accession C4Y7M1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-209RTTWSTGKSSRRRRTAPRRTSFCAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-202KSSRRRRTAP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 12, mito 9.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018618  Vacuolar_import/degrad_Vid24  
KEGG clu:CLUG_04199  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09783  Vac_ImportDeg  
Amino Acid Sequences MPVTQHQRELKPAAASKAAKATKPFKLVSSDFRVVVPPNMERHMPPVAPKETLPDFLTATPRFPVRISRQTRKYSAGDSARQFFVEQGGWQAPTPPPTLLSTYLRPRARFVGEQQSGSSRYDIKVEFKTVDLQCGIVTGFFEISGLTDDHPVITTCSGARSSTTRLRAPSSTRLPRRKATGGSFSRTTWSTGKSSRRRRTAPRRTSFCAGSRRIHAGSADPSHIYMRWKEEFLLPDSRVKVLKNASFEGFYYVVLNIGPGNGTRNASGYSADMDPGRSAACTSTRRTRSSSPCRFGMWRPAAAGWRLTLPEQRAAWMYDDTNMNGMGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.46
3 0.42
4 0.48
5 0.46
6 0.42
7 0.45
8 0.48
9 0.47
10 0.52
11 0.51
12 0.44
13 0.49
14 0.49
15 0.5
16 0.52
17 0.48
18 0.42
19 0.41
20 0.41
21 0.35
22 0.35
23 0.31
24 0.26
25 0.27
26 0.28
27 0.29
28 0.27
29 0.3
30 0.31
31 0.28
32 0.29
33 0.33
34 0.33
35 0.33
36 0.33
37 0.35
38 0.32
39 0.34
40 0.31
41 0.25
42 0.24
43 0.24
44 0.31
45 0.25
46 0.24
47 0.23
48 0.23
49 0.22
50 0.21
51 0.28
52 0.3
53 0.39
54 0.46
55 0.54
56 0.62
57 0.68
58 0.71
59 0.68
60 0.63
61 0.56
62 0.56
63 0.52
64 0.5
65 0.47
66 0.47
67 0.41
68 0.39
69 0.36
70 0.27
71 0.23
72 0.17
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.16
79 0.15
80 0.16
81 0.18
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.19
86 0.2
87 0.22
88 0.25
89 0.3
90 0.38
91 0.4
92 0.39
93 0.39
94 0.4
95 0.4
96 0.37
97 0.36
98 0.38
99 0.37
100 0.37
101 0.35
102 0.34
103 0.31
104 0.29
105 0.26
106 0.16
107 0.15
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.2
114 0.19
115 0.26
116 0.23
117 0.24
118 0.19
119 0.17
120 0.15
121 0.15
122 0.14
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.14
149 0.19
150 0.23
151 0.24
152 0.25
153 0.28
154 0.29
155 0.31
156 0.34
157 0.37
158 0.43
159 0.49
160 0.56
161 0.57
162 0.58
163 0.6
164 0.56
165 0.52
166 0.48
167 0.49
168 0.45
169 0.44
170 0.43
171 0.37
172 0.35
173 0.31
174 0.3
175 0.21
176 0.21
177 0.2
178 0.25
179 0.35
180 0.42
181 0.52
182 0.58
183 0.65
184 0.69
185 0.76
186 0.81
187 0.82
188 0.83
189 0.83
190 0.81
191 0.78
192 0.76
193 0.69
194 0.64
195 0.61
196 0.54
197 0.48
198 0.44
199 0.43
200 0.39
201 0.36
202 0.3
203 0.25
204 0.25
205 0.24
206 0.22
207 0.17
208 0.18
209 0.18
210 0.19
211 0.18
212 0.16
213 0.19
214 0.2
215 0.21
216 0.21
217 0.24
218 0.26
219 0.27
220 0.31
221 0.27
222 0.29
223 0.3
224 0.3
225 0.28
226 0.26
227 0.27
228 0.27
229 0.3
230 0.29
231 0.31
232 0.3
233 0.29
234 0.29
235 0.28
236 0.22
237 0.18
238 0.15
239 0.13
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.08
248 0.1
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.15
253 0.15
254 0.16
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.17
268 0.2
269 0.25
270 0.35
271 0.41
272 0.44
273 0.5
274 0.57
275 0.61
276 0.68
277 0.73
278 0.68
279 0.65
280 0.66
281 0.65
282 0.61
283 0.61
284 0.56
285 0.48
286 0.44
287 0.44
288 0.43
289 0.41
290 0.37
291 0.28
292 0.25
293 0.24
294 0.24
295 0.27
296 0.26
297 0.31
298 0.29
299 0.3
300 0.3
301 0.3
302 0.3
303 0.27
304 0.25
305 0.23
306 0.25
307 0.23
308 0.23