Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y493

Protein Details
Accession C4Y493    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-217SSTQIEDERRRGRRRRRKMAKGRGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-217RRRGRRRRRKMAKGRGR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR023486  TFIIB_CS  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
KEGG clu:CLUG_02465  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00782  TFIIB  
Amino Acid Sequences MSSDWIHEGRRPAGIAGACVLLAARMNHINRTHAEIVAVARVGEETIQKRLNEFKNTTSANLTISEFRDSQNSNDSLPPSYKKNRAIEKKVHLILKEREMALRRFQQLAKGKQLISTLGIELGERIHKDGRRESKDADHTSETHDDDANEGSSASLTGTNKHKQNTRTASDTNEEDASTELEGSKKQTQIIISSTQIEDERRRGRRRRRKMAKGRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.23
3 0.19
4 0.17
5 0.14
6 0.13
7 0.12
8 0.07
9 0.09
10 0.08
11 0.1
12 0.16
13 0.17
14 0.23
15 0.25
16 0.28
17 0.27
18 0.34
19 0.33
20 0.27
21 0.27
22 0.22
23 0.22
24 0.2
25 0.19
26 0.11
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.12
32 0.12
33 0.17
34 0.21
35 0.21
36 0.23
37 0.31
38 0.37
39 0.4
40 0.4
41 0.38
42 0.41
43 0.43
44 0.42
45 0.37
46 0.31
47 0.24
48 0.23
49 0.22
50 0.17
51 0.17
52 0.19
53 0.16
54 0.16
55 0.19
56 0.19
57 0.19
58 0.23
59 0.23
60 0.21
61 0.23
62 0.23
63 0.21
64 0.22
65 0.23
66 0.23
67 0.28
68 0.34
69 0.39
70 0.45
71 0.53
72 0.6
73 0.65
74 0.67
75 0.67
76 0.68
77 0.64
78 0.59
79 0.51
80 0.48
81 0.43
82 0.39
83 0.36
84 0.28
85 0.27
86 0.27
87 0.28
88 0.26
89 0.28
90 0.26
91 0.26
92 0.25
93 0.31
94 0.36
95 0.38
96 0.39
97 0.36
98 0.35
99 0.34
100 0.34
101 0.27
102 0.21
103 0.17
104 0.11
105 0.09
106 0.09
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.08
113 0.11
114 0.13
115 0.17
116 0.24
117 0.33
118 0.38
119 0.41
120 0.41
121 0.45
122 0.51
123 0.51
124 0.48
125 0.4
126 0.35
127 0.37
128 0.37
129 0.3
130 0.23
131 0.21
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.12
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.18
146 0.24
147 0.28
148 0.33
149 0.38
150 0.39
151 0.49
152 0.52
153 0.52
154 0.52
155 0.49
156 0.49
157 0.47
158 0.46
159 0.38
160 0.31
161 0.26
162 0.2
163 0.19
164 0.16
165 0.12
166 0.1
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.15
171 0.19
172 0.2
173 0.21
174 0.23
175 0.24
176 0.27
177 0.29
178 0.28
179 0.25
180 0.26
181 0.25
182 0.24
183 0.25
184 0.26
185 0.27
186 0.31
187 0.39
188 0.45
189 0.55
190 0.63
191 0.73
192 0.8
193 0.86
194 0.89
195 0.91
196 0.93
197 0.95