Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y516

Protein Details
Accession C4Y516    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-34DKENKVTRITTGRRKRKKETSKTEMGTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-24GRRKRKK
Subcellular Location(s) plas 21, vacu 2, nucl 1, mito 1, pero 1, golg 1, mito_nucl 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG clu:CLUG_03250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MTTNDRDKENKVTRITTGRRKRKKETSKTEMGTAYKQSGHGAAPRCAPIIFAWARAQPHRLCPGKSSNLSPTPLITGYVRLDPMSADSRLSGYMKYLKREPTTFPLPQLFFPPMSTNNTTSSNTYTWKAYQYVPSQVLAIVAIVLFALATLMTCVQFIRALVKAPANTGARRRICSIIPFIVGGFFEIIGYIGRAASHNDTQALGPYIIQAILLLVAPALFAASIYMTLARIIVQLNAQHQSVVPVKYLTKIFVCGDVLSFLLQAAGGGVQSGGSLDMLHLGEKLIIVGLFIQIAFFGLFIVALTIFQVRINKNPTSHSLSLRNFPSNKRNWQMVIITLIVCSILIFIRSIVRVVEYLQGNHGFIISHEAFLYTLDGLMMLFNMIVFNLEDIGYYYAQSARQEDDSNSYEMSEYINDSSKYNMVSAPLVNQP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.67
3 0.67
4 0.69
5 0.72
6 0.77
7 0.83
8 0.87
9 0.88
10 0.91
11 0.91
12 0.91
13 0.89
14 0.89
15 0.83
16 0.79
17 0.73
18 0.65
19 0.59
20 0.51
21 0.45
22 0.37
23 0.34
24 0.3
25 0.27
26 0.25
27 0.27
28 0.29
29 0.28
30 0.31
31 0.32
32 0.31
33 0.29
34 0.27
35 0.22
36 0.25
37 0.23
38 0.22
39 0.23
40 0.26
41 0.3
42 0.32
43 0.37
44 0.32
45 0.38
46 0.44
47 0.46
48 0.44
49 0.46
50 0.52
51 0.55
52 0.55
53 0.53
54 0.52
55 0.53
56 0.53
57 0.48
58 0.4
59 0.35
60 0.31
61 0.28
62 0.2
63 0.18
64 0.18
65 0.2
66 0.19
67 0.16
68 0.16
69 0.14
70 0.17
71 0.18
72 0.16
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.17
77 0.17
78 0.14
79 0.13
80 0.21
81 0.24
82 0.28
83 0.33
84 0.38
85 0.41
86 0.44
87 0.46
88 0.45
89 0.49
90 0.47
91 0.45
92 0.45
93 0.42
94 0.4
95 0.38
96 0.33
97 0.26
98 0.26
99 0.25
100 0.21
101 0.26
102 0.28
103 0.26
104 0.27
105 0.3
106 0.3
107 0.28
108 0.29
109 0.25
110 0.25
111 0.24
112 0.24
113 0.21
114 0.23
115 0.24
116 0.22
117 0.27
118 0.28
119 0.32
120 0.31
121 0.3
122 0.27
123 0.25
124 0.23
125 0.16
126 0.12
127 0.06
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.11
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.2
153 0.19
154 0.21
155 0.24
156 0.31
157 0.32
158 0.33
159 0.35
160 0.32
161 0.31
162 0.32
163 0.32
164 0.25
165 0.23
166 0.21
167 0.18
168 0.16
169 0.14
170 0.11
171 0.07
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.06
183 0.08
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.11
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.08
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.13
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.14
234 0.17
235 0.17
236 0.15
237 0.12
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.15
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.02
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.04
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.06
295 0.11
296 0.12
297 0.18
298 0.23
299 0.26
300 0.27
301 0.3
302 0.35
303 0.38
304 0.4
305 0.39
306 0.43
307 0.43
308 0.48
309 0.48
310 0.49
311 0.44
312 0.47
313 0.51
314 0.5
315 0.56
316 0.55
317 0.55
318 0.5
319 0.51
320 0.47
321 0.4
322 0.35
323 0.27
324 0.23
325 0.18
326 0.16
327 0.12
328 0.1
329 0.07
330 0.05
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.17
343 0.16
344 0.17
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.2
349 0.19
350 0.12
351 0.11
352 0.18
353 0.15
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.16
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.08
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.15
385 0.17
386 0.18
387 0.18
388 0.22
389 0.24
390 0.25
391 0.29
392 0.3
393 0.3
394 0.27
395 0.25
396 0.22
397 0.19
398 0.19
399 0.14
400 0.13
401 0.14
402 0.19
403 0.2
404 0.2
405 0.23
406 0.23
407 0.23
408 0.22
409 0.21
410 0.18
411 0.2
412 0.2