Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y8S2

Protein Details
Accession C4Y8S2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
271-294LEQVPKIKQKSTSPRRKRIGIVRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
276-294KIKQKSTSPRRKRIGIVRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG clu:CLUG_04600  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
Amino Acid Sequences MDSHLLPTVWKCTVIGDSQYMYGFARRSPYAVYVTDLSNLWLDEPSEEKVQKLALSEGISDFDASKYDLLLSQLETAFNDAQKLEFSAPSDGPITIKAPLSSELVWNFELVKADEKVTSLFFSQVFTHSLSNHNYLLFRIAKLESMIRTRDNYMLYLEENYKTVNGTELIDKYRRQRPDDAKLLTRYDSDATKLDTSSSFRNLMLKNTDADSHSLLWRIVSAAVDDEHTWKSSIANPEKDVVAETVPPVIKRERDTSSDSITSKRIKLEPLEQVPKIKQKSTSPRRKRIGIVRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.22
4 0.22
5 0.23
6 0.23
7 0.21
8 0.19
9 0.19
10 0.17
11 0.15
12 0.19
13 0.18
14 0.19
15 0.21
16 0.24
17 0.24
18 0.24
19 0.26
20 0.23
21 0.23
22 0.23
23 0.21
24 0.18
25 0.16
26 0.14
27 0.12
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.12
32 0.14
33 0.19
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.2
38 0.2
39 0.19
40 0.17
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.13
48 0.12
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.12
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.11
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.14
88 0.13
89 0.15
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.13
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.15
117 0.16
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.15
123 0.18
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.11
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.16
158 0.18
159 0.22
160 0.28
161 0.32
162 0.34
163 0.42
164 0.47
165 0.54
166 0.6
167 0.58
168 0.57
169 0.55
170 0.53
171 0.45
172 0.38
173 0.3
174 0.23
175 0.2
176 0.17
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.17
184 0.18
185 0.19
186 0.18
187 0.17
188 0.23
189 0.23
190 0.26
191 0.27
192 0.25
193 0.23
194 0.23
195 0.24
196 0.19
197 0.2
198 0.18
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.17
220 0.27
221 0.32
222 0.35
223 0.36
224 0.37
225 0.37
226 0.36
227 0.32
228 0.23
229 0.17
230 0.13
231 0.12
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.18
236 0.21
237 0.24
238 0.27
239 0.33
240 0.32
241 0.36
242 0.42
243 0.43
244 0.45
245 0.46
246 0.43
247 0.4
248 0.41
249 0.42
250 0.38
251 0.4
252 0.36
253 0.36
254 0.4
255 0.45
256 0.49
257 0.54
258 0.58
259 0.55
260 0.58
261 0.59
262 0.63
263 0.6
264 0.54
265 0.51
266 0.54
267 0.64
268 0.69
269 0.74
270 0.76
271 0.82
272 0.86
273 0.86
274 0.85