FuNGI

C4Y4A6

Protein Details

Accession

C4Y4A6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
394-427	EVVLIKKHYVRKSKKSKYRNWKLKRMAREHNEIM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
402-419	YVRKSKKSKYRNWKLKRM

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
KEGG	clu:CLUG_02478 -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSYVPIQNEAQGPVATVLCCNCGVPMDGSSGLVMCYDCIKLNVDITEGIPREANISFCRNCERFLQPPQQWIRAELESRELLAICLRRLKGLSKVRLIDASFIWTEPHSRRIRVKLTVQGEAMQNTIVQQTFEVEYVVIAMQCPDCAKSFTANTWRATVQIRQKVAHKRTFLYLEQLILKHNAHQDTISIQETKDGLDFFYSQRNHATKMLDFLNAVAPIKSKRSEELISIDTQSGSSSYKFSFSVEIAPICRDDLVVLPRKLANQLGNIPRLVICSKVSNMLQFLDPNTLQTADLQAGVYWRAPFFSLLDVTQLVEFIVLDVEPTGDVKGKHVLADITVSRASDFGVNDNTFYVRSHLGGILHPGDSCMGYYLTNTNFNSDLWDTLDTDNCPEVVLIKKHYVRKSKKSKYRNWKLKRMAREHNEIMANEDSRQAKQEQERAERDYELFLQELEEDQELRKTINLYKAGEEAPQDADDEDEMDDDEVAPEIGIDELLDEIDGMTLD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.16
3	0.15
4	0.14
5	0.14
6	0.14
7	0.13
8	0.12
9	0.12
10	0.14
11	0.14
12	0.15
13	0.16
14	0.16
15	0.16
16	0.16
17	0.15
18	0.12
19	0.11
20	0.1
21	0.07
22	0.08
23	0.09
24	0.1
25	0.11
26	0.14
27	0.15
28	0.18
29	0.18
30	0.17
31	0.17
32	0.17
33	0.23
34	0.21
35	0.2
36	0.18
37	0.17
38	0.19
39	0.19
40	0.21
41	0.17
42	0.24
43	0.25
44	0.27
45	0.35
46	0.34
47	0.35
48	0.37
49	0.4
50	0.4
51	0.47
52	0.55
53	0.5
54	0.58
55	0.62
56	0.63
57	0.58
58	0.53
59	0.49
60	0.44
61	0.43
62	0.34
63	0.34
64	0.27
65	0.27
66	0.25
67	0.2
68	0.16
69	0.18
70	0.19
71	0.16
72	0.22
73	0.21
74	0.23
75	0.24
76	0.27
77	0.32
78	0.4
79	0.45
80	0.46
81	0.48
82	0.48
83	0.5
84	0.48
85	0.4
86	0.31
87	0.28
88	0.21
89	0.19
90	0.18
91	0.15
92	0.19
93	0.19
94	0.28
95	0.27
96	0.32
97	0.38
98	0.46
99	0.52
100	0.53
101	0.57
102	0.56
103	0.56
104	0.55
105	0.49
106	0.44
107	0.4
108	0.34
109	0.28
110	0.2
111	0.15
112	0.12
113	0.13
114	0.1
115	0.08
116	0.07
117	0.09
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.08
122	0.07
123	0.08
124	0.08
125	0.06
126	0.05
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.07
131	0.08
132	0.08
133	0.1
134	0.12
135	0.14
136	0.16
137	0.2
138	0.29
139	0.32
140	0.32
141	0.33
142	0.32
143	0.3
144	0.31
145	0.33
146	0.33
147	0.35
148	0.37
149	0.36
150	0.43
151	0.51
152	0.56
153	0.57
154	0.51
155	0.46
156	0.48
157	0.5
158	0.44
159	0.39
160	0.32
161	0.28
162	0.27
163	0.25
164	0.22
165	0.2
166	0.19
167	0.18
168	0.21
169	0.2
170	0.18
171	0.17
172	0.17
173	0.16
174	0.18
175	0.16
176	0.13
177	0.12
178	0.13
179	0.13
180	0.13
181	0.13
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.11
186	0.09
187	0.17
188	0.17
189	0.16
190	0.23
191	0.24
192	0.25
193	0.27
194	0.28
195	0.21
196	0.24
197	0.25
198	0.19
199	0.18
200	0.16
201	0.15
202	0.13
203	0.13
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.13
208	0.14
209	0.13
210	0.14
211	0.18
212	0.19
213	0.2
214	0.22
215	0.21
216	0.2
217	0.2
218	0.19
219	0.14
220	0.13
221	0.11
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.08
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.1
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.11
238	0.1
239	0.09
240	0.07
241	0.06
242	0.08
243	0.12
244	0.18
245	0.18
246	0.19
247	0.2
248	0.2
249	0.21
250	0.21
251	0.18
252	0.14
253	0.2
254	0.23
255	0.24
256	0.23
257	0.22
258	0.2
259	0.2
260	0.18
261	0.13
262	0.1
263	0.1
264	0.11
265	0.14
266	0.14
267	0.13
268	0.14
269	0.14
270	0.13
271	0.12
272	0.12
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.11
277	0.11
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.07
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.1
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.04
313	0.04
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.14
321	0.14
322	0.12
323	0.15
324	0.14
325	0.12
326	0.12
327	0.12
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.15
335	0.15
336	0.16
337	0.16
338	0.16
339	0.14
340	0.14
341	0.14
342	0.1
343	0.1
344	0.11
345	0.12
346	0.13
347	0.13
348	0.16
349	0.15
350	0.14
351	0.13
352	0.12
353	0.11
354	0.1
355	0.1
356	0.08
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.11
361	0.13
362	0.19
363	0.19
364	0.2
365	0.2
366	0.2
367	0.23
368	0.2
369	0.19
370	0.15
371	0.16
372	0.16
373	0.16
374	0.19
375	0.16
376	0.17
377	0.16
378	0.14
379	0.13
380	0.11
381	0.12
382	0.16
383	0.19
384	0.2
385	0.27
386	0.33
387	0.4
388	0.48
389	0.56
390	0.6
391	0.68
392	0.75
393	0.79
394	0.84
395	0.87
396	0.9
397	0.91
398	0.93
399	0.93
400	0.91
401	0.91
402	0.92
403	0.9
404	0.9
405	0.87
406	0.86
407	0.82
408	0.81
409	0.74
410	0.69
411	0.64
412	0.54
413	0.49
414	0.42
415	0.36
416	0.28
417	0.3
418	0.25
419	0.22
420	0.26
421	0.23
422	0.26
423	0.32
424	0.38
425	0.42
426	0.49
427	0.53
428	0.54
429	0.55
430	0.5
431	0.44
432	0.41
433	0.34
434	0.27
435	0.22
436	0.18
437	0.16
438	0.14
439	0.14
440	0.13
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.14
445	0.14
446	0.14
447	0.15
448	0.16
449	0.21
450	0.28
451	0.33
452	0.33
453	0.34
454	0.37
455	0.36
456	0.35
457	0.32
458	0.26
459	0.23
460	0.21
461	0.19
462	0.16
463	0.16
464	0.14
465	0.13
466	0.11
467	0.09
468	0.09
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.05
484	0.05
485	0.04
486	0.04

C4Y4A6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer