FuNGI

C4Y0M3

Protein Details

Accession

C4Y0M3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-107	QVSVAQSNKSKKSKKRSHDEVLMVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
93-97	KKSKK

Subcellular Location(s)

mito 23.5, cyto_mito 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR013103 RVT_2
KEGG	clu:CLUG_01755 -
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MPSRKVAKTSSLTPSATLAQLSTSSATNPVTAPPASPQPPSSSSPPHYRTRSYTRSLFPKLSSSTKGGRQHDHLLKFPARSQQVSVAQSNKSKKSKKRSHDEVLMVLRTDMVDTPGHKEEIPSTTSVLHAATVYAENHLNNSRPIPNSYSEAMRAADKQNWLEACNSEMQAHHENGTFTLVPLPPNVKPIGCRWVFNIKDKGLYKARLVAKGYTQKEGIDYEETFSPVIKHTSLRLLLAIAGRLKMHVHQMDVKTAFLNGDLKEDLYMRQPPGYKAVSKNSEDKTTEYVLKLNKSIYGLKQAPLVWNQTINKTLVSLGFKKTIHEPCIYYKFDNKDQTLVALYVDDMLIAGTNLAKINQLKIHLGQVYQMKDLGVATKFIGMNLEISSTGIQVCMKDYIRNLLAEYNMTDCNPVKTPANKTNLDDLPDSTDLPCDENEYRSIVGKLLYAANTVRYDINYIVSKLSRYFASPKVKHMDAAKRVLRYLKGTPTFGLRYTSYAPNELFSYSDANLASEADTKSRSTTGSVVLYGGSPVSWRSKLQTLVALSTANSELVALCYTTQESVWLLNLLKDMNINCNASLFCDNQPAIKTVQSDALLEGTKHIRIKVDFVKQQLQCTVLSLQYVPTKLNCADMFTKAITDPLFSNLRQRCASGLSPIDLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.39
3	0.34
4	0.28
5	0.2
6	0.15
7	0.15
8	0.15
9	0.14
10	0.12
11	0.12
12	0.14
13	0.15
14	0.15
15	0.15
16	0.15
17	0.18
18	0.17
19	0.18
20	0.19
21	0.27
22	0.28
23	0.31
24	0.31
25	0.33
26	0.37
27	0.41
28	0.43
29	0.43
30	0.46
31	0.53
32	0.56
33	0.59
34	0.61
35	0.62
36	0.64
37	0.65
38	0.67
39	0.64
40	0.67
41	0.65
42	0.69
43	0.69
44	0.66
45	0.58
46	0.57
47	0.55
48	0.53
49	0.49
50	0.46
51	0.45
52	0.49
53	0.56
54	0.55
55	0.55
56	0.55
57	0.61
58	0.64
59	0.63
60	0.58
61	0.57
62	0.56
63	0.52
64	0.51
65	0.49
66	0.45
67	0.43
68	0.41
69	0.42
70	0.45
71	0.47
72	0.47
73	0.43
74	0.43
75	0.48
76	0.53
77	0.53
78	0.55
79	0.6
80	0.65
81	0.72
82	0.78
83	0.82
84	0.85
85	0.86
86	0.86
87	0.86
88	0.81
89	0.76
90	0.72
91	0.63
92	0.52
93	0.42
94	0.33
95	0.24
96	0.2
97	0.13
98	0.1
99	0.11
100	0.12
101	0.17
102	0.19
103	0.21
104	0.2
105	0.2
106	0.22
107	0.23
108	0.24
109	0.19
110	0.18
111	0.17
112	0.18
113	0.18
114	0.14
115	0.11
116	0.09
117	0.08
118	0.08
119	0.1
120	0.1
121	0.11
122	0.12
123	0.11
124	0.14
125	0.17
126	0.17
127	0.17
128	0.2
129	0.23
130	0.24
131	0.27
132	0.28
133	0.28
134	0.3
135	0.31
136	0.3
137	0.26
138	0.26
139	0.23
140	0.21
141	0.22
142	0.21
143	0.23
144	0.23
145	0.23
146	0.26
147	0.26
148	0.25
149	0.24
150	0.21
151	0.19
152	0.19
153	0.19
154	0.16
155	0.15
156	0.19
157	0.22
158	0.22
159	0.22
160	0.2
161	0.2
162	0.2
163	0.22
164	0.17
165	0.13
166	0.16
167	0.15
168	0.14
169	0.16
170	0.19
171	0.16
172	0.19
173	0.2
174	0.17
175	0.18
176	0.21
177	0.28
178	0.26
179	0.26
180	0.27
181	0.36
182	0.38
183	0.43
184	0.47
185	0.39
186	0.45
187	0.45
188	0.47
189	0.43
190	0.43
191	0.36
192	0.38
193	0.4
194	0.38
195	0.39
196	0.35
197	0.36
198	0.42
199	0.43
200	0.38
201	0.34
202	0.29
203	0.29
204	0.28
205	0.23
206	0.17
207	0.16
208	0.15
209	0.15
210	0.16
211	0.14
212	0.13
213	0.12
214	0.1
215	0.12
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.17
220	0.17
221	0.17
222	0.16
223	0.14
224	0.15
225	0.15
226	0.15
227	0.11
228	0.1
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.1
233	0.15
234	0.14
235	0.16
236	0.21
237	0.22
238	0.27
239	0.27
240	0.26
241	0.2
242	0.2
243	0.17
244	0.13
245	0.14
246	0.09
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.15
255	0.13
256	0.16
257	0.18
258	0.18
259	0.23
260	0.24
261	0.25
262	0.25
263	0.32
264	0.34
265	0.35
266	0.41
267	0.38
268	0.41
269	0.38
270	0.36
271	0.32
272	0.3
273	0.29
274	0.23
275	0.24
276	0.22
277	0.22
278	0.22
279	0.18
280	0.17
281	0.17
282	0.19
283	0.17
284	0.22
285	0.22
286	0.21
287	0.24
288	0.23
289	0.23
290	0.23
291	0.24
292	0.17
293	0.19
294	0.2
295	0.19
296	0.2
297	0.18
298	0.16
299	0.14
300	0.14
301	0.12
302	0.14
303	0.15
304	0.15
305	0.19
306	0.19
307	0.2
308	0.26
309	0.28
310	0.27
311	0.27
312	0.27
313	0.28
314	0.34
315	0.35
316	0.29
317	0.3
318	0.31
319	0.35
320	0.39
321	0.34
322	0.3
323	0.28
324	0.27
325	0.23
326	0.19
327	0.13
328	0.08
329	0.07
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.02
337	0.03
338	0.02
339	0.03
340	0.03
341	0.04
342	0.06
343	0.06
344	0.08
345	0.1
346	0.12
347	0.12
348	0.13
349	0.16
350	0.15
351	0.14
352	0.16
353	0.19
354	0.19
355	0.18
356	0.17
357	0.14
358	0.13
359	0.13
360	0.13
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.11
365	0.11
366	0.1
367	0.11
368	0.08
369	0.09
370	0.08
371	0.09
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.06
379	0.05
380	0.06
381	0.09
382	0.1
383	0.11
384	0.12
385	0.15
386	0.16
387	0.17
388	0.16
389	0.14
390	0.14
391	0.13
392	0.13
393	0.12
394	0.11
395	0.1
396	0.12
397	0.1
398	0.13
399	0.13
400	0.14
401	0.16
402	0.21
403	0.28
404	0.34
405	0.4
406	0.4
407	0.4
408	0.46
409	0.44
410	0.42
411	0.36
412	0.29
413	0.27
414	0.25
415	0.24
416	0.16
417	0.16
418	0.13
419	0.14
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.14
424	0.15
425	0.15
426	0.15
427	0.16
428	0.16
429	0.13
430	0.12
431	0.11
432	0.12
433	0.12
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.13
438	0.13
439	0.14
440	0.13
441	0.11
442	0.13
443	0.12
444	0.16
445	0.14
446	0.15
447	0.15
448	0.15
449	0.16
450	0.15
451	0.17
452	0.14
453	0.15
454	0.19
455	0.25
456	0.35
457	0.36
458	0.41
459	0.45
460	0.45
461	0.45
462	0.47
463	0.49
464	0.44
465	0.51
466	0.49
467	0.45
468	0.46
469	0.47
470	0.42
471	0.38
472	0.37
473	0.37
474	0.37
475	0.37
476	0.36
477	0.37
478	0.37
479	0.33
480	0.31
481	0.23
482	0.23
483	0.26
484	0.3
485	0.26
486	0.28
487	0.27
488	0.25
489	0.25
490	0.22
491	0.18
492	0.14
493	0.15
494	0.12
495	0.15
496	0.13
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.12
501	0.12
502	0.13
503	0.12
504	0.13
505	0.14
506	0.15
507	0.16
508	0.16
509	0.14
510	0.16
511	0.18
512	0.19
513	0.19
514	0.17
515	0.16
516	0.16
517	0.14
518	0.11
519	0.07
520	0.06
521	0.07
522	0.12
523	0.13
524	0.14
525	0.18
526	0.24
527	0.27
528	0.28
529	0.32
530	0.29
531	0.29
532	0.3
533	0.26
534	0.2
535	0.2
536	0.18
537	0.12
538	0.1
539	0.08
540	0.07
541	0.08
542	0.09
543	0.07
544	0.06
545	0.07
546	0.08
547	0.09
548	0.08
549	0.09
550	0.09
551	0.1
552	0.11
553	0.12
554	0.12
555	0.13
556	0.14
557	0.13
558	0.13
559	0.15
560	0.15
561	0.18
562	0.21
563	0.21
564	0.2
565	0.22
566	0.21
567	0.22
568	0.24
569	0.21
570	0.19
571	0.24
572	0.24
573	0.26
574	0.28
575	0.26
576	0.25
577	0.26
578	0.25
579	0.2
580	0.26
581	0.23
582	0.22
583	0.21
584	0.22
585	0.2
586	0.18
587	0.21
588	0.18
589	0.21
590	0.22
591	0.23
592	0.25
593	0.25
594	0.33
595	0.38
596	0.45
597	0.45
598	0.49
599	0.57
600	0.54
601	0.57
602	0.52
603	0.45
604	0.35
605	0.34
606	0.31
607	0.23
608	0.22
609	0.19
610	0.2
611	0.23
612	0.23
613	0.22
614	0.21
615	0.25
616	0.24
617	0.3
618	0.26
619	0.28
620	0.29
621	0.3
622	0.32
623	0.28
624	0.29
625	0.22
626	0.25
627	0.2
628	0.19
629	0.17
630	0.19
631	0.23
632	0.21
633	0.31
634	0.33
635	0.39
636	0.38
637	0.38
638	0.35
639	0.37
640	0.39
641	0.37
642	0.35

C4Y0M3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer