Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QY56

Protein Details
Accession C4QY56    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-140VRCAIQSVRRNKKRSWKKVADVQPSSNHydrophilic
573-592KDYQDIKKTQEERNHKKQKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-127KKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR007147  TF_Vhr  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0336  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MPLPTSYRNSTFVPNSPDVTQDGSKDGDSTSSWKTNNTTSNKVGVTHFIRKKLNFSDETLWKQFSARRLELISLMKLSEKKASEQDEEITKCARLLLIEFQYPEENLLDFDKLVRCAIQSVRRNKKRSWKKVADVQPSSNPKPQKFVIFQPSDGQHVQEGSFRALEPPRLSSKDFLSQITKLNSSSENEGETPSYSKLQELPSTSKLAINSLITPSRTNNGHSSTKDLPVKSNSISNYKLESIMARNPEQSDFRVNLPSISSLPFGGHNPETNTLELESLAKLLHFIKKSKSCFQFTKTFHETVEEDFYNPGSSQSTYNTENIEVVGAAAISCCLAYTLQKYFSNSSPSSLSYLRIKLSSDSVLSRILKNLDDSSLDVIMLGEYTAAQLLKKLIGCLLKDFGFDDILQPLSNVFKSIVIKDYPLICKPIPKKSSILHTEEKREDIVVHLRYKSKFLKFNYIHDTSSAPTIIEILDNAKTGFNIVDNNKYLQLRNYKEPSELFHNDLQLELFFQRQTEAGKDIDIEVFASDNKELTSELSQNKDGNTAKIFPPLDIDSNKTHHLVKKDSLHSFKDYQDIKKTQEERNHKKQKIMVFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.42
4 0.41
5 0.36
6 0.36
7 0.32
8 0.25
9 0.25
10 0.23
11 0.23
12 0.21
13 0.2
14 0.16
15 0.16
16 0.18
17 0.22
18 0.27
19 0.27
20 0.3
21 0.33
22 0.38
23 0.45
24 0.48
25 0.49
26 0.46
27 0.51
28 0.49
29 0.48
30 0.43
31 0.41
32 0.42
33 0.45
34 0.47
35 0.48
36 0.54
37 0.54
38 0.59
39 0.59
40 0.61
41 0.53
42 0.53
43 0.54
44 0.54
45 0.6
46 0.56
47 0.5
48 0.42
49 0.42
50 0.4
51 0.39
52 0.41
53 0.35
54 0.35
55 0.36
56 0.37
57 0.39
58 0.39
59 0.34
60 0.26
61 0.25
62 0.25
63 0.25
64 0.25
65 0.27
66 0.25
67 0.26
68 0.32
69 0.37
70 0.37
71 0.37
72 0.4
73 0.41
74 0.41
75 0.39
76 0.34
77 0.28
78 0.25
79 0.23
80 0.19
81 0.12
82 0.13
83 0.18
84 0.2
85 0.22
86 0.23
87 0.24
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.16
92 0.13
93 0.12
94 0.13
95 0.12
96 0.1
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.16
104 0.22
105 0.29
106 0.35
107 0.45
108 0.55
109 0.64
110 0.69
111 0.72
112 0.77
113 0.79
114 0.81
115 0.82
116 0.8
117 0.79
118 0.84
119 0.87
120 0.86
121 0.8
122 0.74
123 0.71
124 0.69
125 0.66
126 0.62
127 0.58
128 0.49
129 0.5
130 0.48
131 0.47
132 0.43
133 0.46
134 0.5
135 0.47
136 0.47
137 0.46
138 0.45
139 0.42
140 0.38
141 0.31
142 0.22
143 0.2
144 0.19
145 0.17
146 0.17
147 0.14
148 0.15
149 0.14
150 0.17
151 0.17
152 0.21
153 0.19
154 0.22
155 0.26
156 0.28
157 0.3
158 0.28
159 0.3
160 0.34
161 0.34
162 0.32
163 0.31
164 0.29
165 0.33
166 0.34
167 0.31
168 0.24
169 0.24
170 0.24
171 0.22
172 0.24
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.13
181 0.15
182 0.13
183 0.13
184 0.16
185 0.18
186 0.2
187 0.23
188 0.26
189 0.27
190 0.29
191 0.29
192 0.27
193 0.25
194 0.22
195 0.2
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.2
206 0.21
207 0.25
208 0.29
209 0.28
210 0.34
211 0.32
212 0.38
213 0.39
214 0.36
215 0.34
216 0.32
217 0.34
218 0.29
219 0.3
220 0.26
221 0.26
222 0.27
223 0.25
224 0.25
225 0.23
226 0.22
227 0.18
228 0.18
229 0.16
230 0.18
231 0.2
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.21
236 0.21
237 0.2
238 0.2
239 0.18
240 0.18
241 0.2
242 0.19
243 0.17
244 0.16
245 0.16
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.16
258 0.17
259 0.16
260 0.16
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.12
272 0.13
273 0.15
274 0.21
275 0.28
276 0.33
277 0.4
278 0.44
279 0.44
280 0.46
281 0.49
282 0.51
283 0.47
284 0.51
285 0.47
286 0.43
287 0.37
288 0.36
289 0.32
290 0.25
291 0.27
292 0.18
293 0.15
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.13
304 0.14
305 0.15
306 0.16
307 0.15
308 0.14
309 0.13
310 0.11
311 0.07
312 0.05
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.03
322 0.03
323 0.04
324 0.07
325 0.1
326 0.14
327 0.16
328 0.18
329 0.2
330 0.22
331 0.28
332 0.25
333 0.25
334 0.23
335 0.22
336 0.23
337 0.21
338 0.21
339 0.18
340 0.2
341 0.19
342 0.18
343 0.18
344 0.16
345 0.18
346 0.17
347 0.14
348 0.13
349 0.14
350 0.17
351 0.18
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.16
356 0.17
357 0.17
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.06
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.11
381 0.14
382 0.15
383 0.16
384 0.18
385 0.17
386 0.17
387 0.17
388 0.15
389 0.13
390 0.12
391 0.11
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.08
401 0.11
402 0.13
403 0.14
404 0.17
405 0.16
406 0.17
407 0.18
408 0.23
409 0.23
410 0.23
411 0.26
412 0.23
413 0.3
414 0.34
415 0.42
416 0.4
417 0.39
418 0.42
419 0.42
420 0.51
421 0.49
422 0.51
423 0.49
424 0.52
425 0.57
426 0.54
427 0.52
428 0.43
429 0.37
430 0.31
431 0.26
432 0.28
433 0.26
434 0.27
435 0.29
436 0.34
437 0.34
438 0.4
439 0.44
440 0.43
441 0.46
442 0.46
443 0.54
444 0.51
445 0.58
446 0.59
447 0.55
448 0.49
449 0.42
450 0.4
451 0.3
452 0.29
453 0.22
454 0.14
455 0.11
456 0.11
457 0.1
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.14
470 0.16
471 0.22
472 0.24
473 0.26
474 0.29
475 0.31
476 0.31
477 0.32
478 0.38
479 0.37
480 0.44
481 0.48
482 0.46
483 0.48
484 0.47
485 0.45
486 0.45
487 0.43
488 0.38
489 0.35
490 0.35
491 0.32
492 0.31
493 0.27
494 0.18
495 0.17
496 0.13
497 0.12
498 0.1
499 0.1
500 0.11
501 0.12
502 0.14
503 0.15
504 0.16
505 0.15
506 0.16
507 0.16
508 0.17
509 0.16
510 0.14
511 0.12
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.11
522 0.15
523 0.2
524 0.24
525 0.28
526 0.31
527 0.32
528 0.33
529 0.37
530 0.34
531 0.32
532 0.32
533 0.31
534 0.29
535 0.36
536 0.36
537 0.28
538 0.31
539 0.31
540 0.33
541 0.31
542 0.34
543 0.31
544 0.34
545 0.36
546 0.34
547 0.36
548 0.36
549 0.4
550 0.43
551 0.45
552 0.51
553 0.57
554 0.63
555 0.64
556 0.63
557 0.62
558 0.6
559 0.54
560 0.54
561 0.51
562 0.49
563 0.53
564 0.53
565 0.52
566 0.58
567 0.62
568 0.61
569 0.65
570 0.7
571 0.7
572 0.77
573 0.83
574 0.77
575 0.78
576 0.76
577 0.76
578 0.76
579 0.74