Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UFD4

Protein Details
Accession Q0UFD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-113VLGNKVAQEDKKKKKSKKAAKAGAEEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-109KKKKKSKKAAKAG
412-423KKKAKPAPAAAQ
426-430GSGKR
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 13.5, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0034080  P:CENP-A containing chromatin assembly  
GO:0006335  P:DNA replication-dependent chromatin assembly  
KEGG pno:SNOG_09530  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MADAANQILAAVNEHEELPRTKEKLDELSTAASIHYSTKNFAAAAENYANAVEIQAELNGEMAPENAELLFYYGRALYKVAVAKSDVLGNKVAQEDKKKKKSKKAAKAGAEEGSSAANGAKSEPKEESVDSKPFFQLTGDENWTDSEEEDDEEGEQEEEDDDFGYAYETFELARVLYSKQLEALEGGDAADKGKGKAELSPKARAIKEKIADCHGFLVDISLENERFHDAITDARSALALQEELKPFEHENVTEGHYSLSLALEFASVTKVREDQTGKSADAGADATAETEDNKDGIDWDLRNEAAKHTELAVQSLQARLKKEEDALASDKLTPEQIKEKRAIVEEKKAMLEELSTRVTDLKADPTKQEFDSLDPSVFQGLLGGLLGADAATQKAKIAEATKSANDVSGMVKKKAKPAPAAAQASGSGKRKLEVDGAEANGKRAKTEEPAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.14
4 0.16
5 0.21
6 0.28
7 0.28
8 0.29
9 0.32
10 0.36
11 0.41
12 0.44
13 0.41
14 0.36
15 0.36
16 0.36
17 0.32
18 0.27
19 0.19
20 0.15
21 0.16
22 0.18
23 0.17
24 0.18
25 0.2
26 0.21
27 0.21
28 0.21
29 0.23
30 0.19
31 0.23
32 0.22
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.19
37 0.13
38 0.12
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.06
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.09
65 0.14
66 0.19
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.2
71 0.2
72 0.25
73 0.21
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.23
80 0.22
81 0.31
82 0.4
83 0.49
84 0.6
85 0.67
86 0.73
87 0.81
88 0.88
89 0.89
90 0.89
91 0.9
92 0.89
93 0.87
94 0.85
95 0.78
96 0.7
97 0.59
98 0.48
99 0.37
100 0.27
101 0.19
102 0.13
103 0.09
104 0.07
105 0.06
106 0.08
107 0.13
108 0.13
109 0.16
110 0.17
111 0.19
112 0.2
113 0.22
114 0.25
115 0.26
116 0.32
117 0.3
118 0.31
119 0.29
120 0.27
121 0.26
122 0.21
123 0.18
124 0.15
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.14
133 0.1
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.14
184 0.2
185 0.26
186 0.3
187 0.34
188 0.35
189 0.39
190 0.4
191 0.39
192 0.38
193 0.37
194 0.38
195 0.37
196 0.36
197 0.36
198 0.35
199 0.31
200 0.28
201 0.21
202 0.16
203 0.12
204 0.11
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.13
234 0.15
235 0.15
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.09
258 0.1
259 0.15
260 0.17
261 0.18
262 0.23
263 0.25
264 0.24
265 0.23
266 0.23
267 0.17
268 0.16
269 0.14
270 0.09
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.11
285 0.1
286 0.11
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.15
291 0.15
292 0.14
293 0.15
294 0.14
295 0.14
296 0.18
297 0.16
298 0.18
299 0.16
300 0.15
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.18
305 0.21
306 0.21
307 0.23
308 0.24
309 0.24
310 0.25
311 0.24
312 0.26
313 0.26
314 0.25
315 0.24
316 0.23
317 0.21
318 0.18
319 0.19
320 0.15
321 0.15
322 0.23
323 0.27
324 0.3
325 0.33
326 0.35
327 0.36
328 0.4
329 0.46
330 0.41
331 0.46
332 0.46
333 0.45
334 0.43
335 0.39
336 0.35
337 0.26
338 0.23
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.14
343 0.14
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.21
349 0.25
350 0.27
351 0.31
352 0.34
353 0.38
354 0.36
355 0.39
356 0.3
357 0.28
358 0.32
359 0.3
360 0.26
361 0.22
362 0.22
363 0.19
364 0.17
365 0.14
366 0.09
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.08
382 0.09
383 0.12
384 0.15
385 0.17
386 0.22
387 0.26
388 0.26
389 0.28
390 0.28
391 0.25
392 0.22
393 0.2
394 0.19
395 0.23
396 0.26
397 0.28
398 0.34
399 0.36
400 0.45
401 0.51
402 0.53
403 0.52
404 0.56
405 0.61
406 0.65
407 0.66
408 0.58
409 0.53
410 0.48
411 0.45
412 0.43
413 0.38
414 0.33
415 0.29
416 0.3
417 0.3
418 0.31
419 0.33
420 0.29
421 0.3
422 0.31
423 0.33
424 0.38
425 0.37
426 0.37
427 0.34
428 0.32
429 0.28
430 0.25
431 0.26