Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y0J4

Protein Details
Accession C4Y0J4    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-134VDPIISKKFHPQDKRKLRRALEHydrophilic
371-401GEENWKIHVKSRRHKKKLNYNEKKRVHEELIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
379-396VKSRRHKKKLNYNEKKRV
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG clu:CLUG_01726  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MQVYEGLPIITNKHPISERQGVTHHVMNHVKWNEDYFIHRYTQEANAAIDNIHAKGKVPIIIGGTHYYLQSLLFRNKTVGEKEDPKALRKLTKEEEDLLDGPVEPIFNRLCEVDPIISKKFHPQDKRKLRRALEIYLTSGMKPSELYREQKLDELEDSSLKYNTLLFWLYCDPEILKERLDKRVDMMMATGALDEIKEMESYYQKQDPRPDCTRGIWQVIGFKEFLPWLENGRSEEKLFNEGVERMKIRTRQYAKYQVKWIKKLLGVELNKESRFGFKYGGKMYLLDASNLDNWNSYVGERGVKIAEQFITNGPLGVSEPQATENLKELIPTPDFYEKFNSNKTVNSASNWKHMECPVCVDADGKPFVAVGEENWKIHVKSRRHKKKLNYNEKKRVHEELIAKYKKPKDDIACDQEASS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.4
4 0.46
5 0.44
6 0.42
7 0.45
8 0.44
9 0.46
10 0.47
11 0.4
12 0.38
13 0.41
14 0.37
15 0.44
16 0.42
17 0.4
18 0.36
19 0.37
20 0.32
21 0.3
22 0.34
23 0.29
24 0.29
25 0.29
26 0.28
27 0.26
28 0.27
29 0.3
30 0.29
31 0.26
32 0.24
33 0.23
34 0.23
35 0.22
36 0.2
37 0.17
38 0.14
39 0.14
40 0.13
41 0.13
42 0.15
43 0.18
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.2
48 0.21
49 0.22
50 0.21
51 0.2
52 0.18
53 0.17
54 0.15
55 0.13
56 0.12
57 0.15
58 0.18
59 0.22
60 0.24
61 0.25
62 0.26
63 0.29
64 0.33
65 0.32
66 0.32
67 0.33
68 0.38
69 0.39
70 0.46
71 0.45
72 0.44
73 0.46
74 0.46
75 0.45
76 0.42
77 0.48
78 0.46
79 0.51
80 0.5
81 0.47
82 0.45
83 0.43
84 0.4
85 0.33
86 0.26
87 0.19
88 0.16
89 0.13
90 0.11
91 0.07
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.14
100 0.14
101 0.17
102 0.21
103 0.23
104 0.23
105 0.23
106 0.3
107 0.35
108 0.41
109 0.48
110 0.53
111 0.62
112 0.73
113 0.82
114 0.83
115 0.84
116 0.79
117 0.79
118 0.74
119 0.68
120 0.63
121 0.55
122 0.47
123 0.42
124 0.39
125 0.29
126 0.25
127 0.2
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.16
132 0.2
133 0.23
134 0.26
135 0.29
136 0.3
137 0.32
138 0.32
139 0.26
140 0.22
141 0.2
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.1
160 0.12
161 0.16
162 0.14
163 0.14
164 0.19
165 0.22
166 0.29
167 0.3
168 0.27
169 0.26
170 0.29
171 0.28
172 0.22
173 0.2
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.07
188 0.1
189 0.13
190 0.17
191 0.19
192 0.22
193 0.31
194 0.33
195 0.38
196 0.41
197 0.42
198 0.39
199 0.39
200 0.42
201 0.36
202 0.35
203 0.28
204 0.24
205 0.24
206 0.23
207 0.22
208 0.17
209 0.14
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.13
218 0.15
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.19
223 0.17
224 0.18
225 0.17
226 0.15
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.19
234 0.23
235 0.25
236 0.32
237 0.36
238 0.39
239 0.46
240 0.56
241 0.58
242 0.58
243 0.65
244 0.63
245 0.65
246 0.64
247 0.59
248 0.53
249 0.49
250 0.46
251 0.4
252 0.41
253 0.35
254 0.34
255 0.37
256 0.36
257 0.34
258 0.33
259 0.29
260 0.24
261 0.25
262 0.23
263 0.21
264 0.2
265 0.26
266 0.27
267 0.3
268 0.26
269 0.24
270 0.24
271 0.26
272 0.23
273 0.18
274 0.16
275 0.15
276 0.17
277 0.18
278 0.17
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.13
296 0.12
297 0.15
298 0.14
299 0.13
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.18
317 0.18
318 0.18
319 0.19
320 0.25
321 0.26
322 0.27
323 0.32
324 0.31
325 0.34
326 0.38
327 0.39
328 0.33
329 0.35
330 0.38
331 0.38
332 0.36
333 0.35
334 0.39
335 0.37
336 0.44
337 0.44
338 0.41
339 0.38
340 0.41
341 0.41
342 0.34
343 0.37
344 0.3
345 0.28
346 0.27
347 0.24
348 0.23
349 0.24
350 0.24
351 0.18
352 0.16
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.13
357 0.1
358 0.17
359 0.19
360 0.19
361 0.22
362 0.25
363 0.23
364 0.31
365 0.38
366 0.4
367 0.48
368 0.6
369 0.69
370 0.76
371 0.84
372 0.87
373 0.9
374 0.91
375 0.92
376 0.92
377 0.92
378 0.93
379 0.93
380 0.9
381 0.85
382 0.81
383 0.74
384 0.71
385 0.67
386 0.66
387 0.68
388 0.65
389 0.61
390 0.63
391 0.65
392 0.64
393 0.61
394 0.6
395 0.58
396 0.63
397 0.71
398 0.7
399 0.68