Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y929

Protein Details
Accession C4Y929    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-29LPPDKKIGGKSQKKIKRLPLVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-23GGKSQKKIK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014381  Arch_Rpo5/euc_Rpb5  
IPR005571  RNA_pol_Rpb5_N  
IPR036710  RNA_pol_Rpb5_N_sf  
IPR000783  RNA_pol_subH/Rpb5_C  
IPR035913  RPB5-like_sf  
IPR021772  WDR48/Bun107  
Gene Ontology GO:0055029  C:nuclear DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG clu:CLUG_04706  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11816  DUF3337  
PF01191  RNA_pol_Rpb5_C  
PF03871  RNA_pol_Rpb5_N  
Amino Acid Sequences MEMDYSQLPPDKKIGGKSQKKIKRLPLVVNSTKLVSQNMLRVNKILYYVTEKFDTRTSEMKEKRNPSEWLALECRGQELQGNMTLQTIRTKIWKSSGDIGYYITDEEINMTLDEFKAKICPMGEAQRKLMCFQAQPTPEAAEKFPEMGSLWVEFCDEASVGIKTMRNFCIHISEKNFSTGIFIYQTSITPSANKLIPTVSPATIEVFQESDLVVNITHHELVPKHIRLSKPEKKELLDRYRLKESQLPRIQREDPVARYLGLKRGDVVKIIRRSETSGRYASYRICL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.49
3 0.58
4 0.65
5 0.72
6 0.75
7 0.79
8 0.81
9 0.8
10 0.8
11 0.77
12 0.78
13 0.77
14 0.78
15 0.76
16 0.71
17 0.63
18 0.53
19 0.48
20 0.4
21 0.32
22 0.25
23 0.22
24 0.25
25 0.31
26 0.33
27 0.31
28 0.31
29 0.31
30 0.29
31 0.29
32 0.23
33 0.18
34 0.22
35 0.24
36 0.26
37 0.28
38 0.27
39 0.27
40 0.29
41 0.31
42 0.27
43 0.31
44 0.34
45 0.41
46 0.47
47 0.54
48 0.59
49 0.62
50 0.65
51 0.65
52 0.62
53 0.57
54 0.59
55 0.52
56 0.48
57 0.44
58 0.4
59 0.34
60 0.31
61 0.29
62 0.2
63 0.18
64 0.15
65 0.12
66 0.13
67 0.15
68 0.15
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.13
73 0.15
74 0.14
75 0.12
76 0.17
77 0.19
78 0.2
79 0.26
80 0.28
81 0.29
82 0.36
83 0.38
84 0.34
85 0.32
86 0.31
87 0.26
88 0.23
89 0.19
90 0.11
91 0.08
92 0.06
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.1
108 0.12
109 0.21
110 0.27
111 0.27
112 0.3
113 0.3
114 0.31
115 0.3
116 0.3
117 0.22
118 0.17
119 0.17
120 0.21
121 0.19
122 0.2
123 0.2
124 0.2
125 0.19
126 0.19
127 0.17
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.07
149 0.09
150 0.1
151 0.13
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.23
157 0.24
158 0.27
159 0.28
160 0.29
161 0.28
162 0.29
163 0.29
164 0.2
165 0.2
166 0.16
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.15
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.16
185 0.17
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.11
207 0.11
208 0.17
209 0.24
210 0.25
211 0.28
212 0.32
213 0.34
214 0.4
215 0.5
216 0.53
217 0.54
218 0.6
219 0.6
220 0.59
221 0.66
222 0.68
223 0.67
224 0.68
225 0.66
226 0.64
227 0.68
228 0.65
229 0.61
230 0.57
231 0.52
232 0.53
233 0.56
234 0.56
235 0.52
236 0.58
237 0.56
238 0.54
239 0.57
240 0.53
241 0.47
242 0.45
243 0.42
244 0.36
245 0.37
246 0.36
247 0.35
248 0.31
249 0.28
250 0.26
251 0.31
252 0.31
253 0.32
254 0.35
255 0.37
256 0.42
257 0.44
258 0.45
259 0.41
260 0.46
261 0.5
262 0.51
263 0.48
264 0.43
265 0.43
266 0.42
267 0.43