Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XVT4

Protein Details
Accession C4XVT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-156KLSGQQAKKTKKKNLDSLKDHydrophilic
380-400LQLKKQQKQLRKIQSQEKARTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG clu:CLUG_00013  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MTYDRLIDYAVNAIAQILPLDHDTCLEMIKYALTLPNAEVETHLLDLLGHSEESYKFISRFLELKREEDENNSHQAKSKVKQTSKSSSPIPSITQNVKKNSAWDHSSQTTTKSNTRLKNNKDSITISELADVKPSNKLSGQQAKKTKKKNLDSLKDIEAALNELEIEKAQESVSLESSSVVKRVCNCMATRHPLFEVAPNCLNCGKIICVKEGLQPCSYCGAELLSEKEKIEIIKILNSEKENLKIKSANSTNKQVQEQPSKLSAPKKIKVAMSAGGNLWKAQEEALKQIEEESKKQRELEQKALEEKKELERQLQEIEHYERTKDVNPDLLKAQERLETLLDFQSTGAERTRIIDNASDFEMPDLSSGSMWLSPTERALQLKKQQKQLRKIQSQEKARTGRTKKVMEMVIKDGKVSMVEKHLIEDNEPDANEIKELDTLAKQEKVDQESSMIKNFWDYEKDQDKWEKPVYVFEPVSEAPNVEWKDSKVQLDSLDSNELVAMLPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.06
5 0.07
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.11
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.1
19 0.13
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.17
27 0.16
28 0.17
29 0.16
30 0.15
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.1
36 0.08
37 0.07
38 0.1
39 0.11
40 0.14
41 0.16
42 0.17
43 0.16
44 0.18
45 0.2
46 0.2
47 0.25
48 0.27
49 0.34
50 0.33
51 0.36
52 0.37
53 0.39
54 0.37
55 0.37
56 0.4
57 0.34
58 0.41
59 0.4
60 0.37
61 0.38
62 0.42
63 0.44
64 0.42
65 0.47
66 0.49
67 0.53
68 0.61
69 0.64
70 0.68
71 0.67
72 0.68
73 0.63
74 0.58
75 0.56
76 0.5
77 0.45
78 0.41
79 0.41
80 0.44
81 0.47
82 0.49
83 0.5
84 0.53
85 0.5
86 0.5
87 0.5
88 0.48
89 0.43
90 0.4
91 0.41
92 0.39
93 0.42
94 0.39
95 0.37
96 0.37
97 0.37
98 0.39
99 0.41
100 0.45
101 0.49
102 0.59
103 0.64
104 0.66
105 0.73
106 0.75
107 0.69
108 0.65
109 0.6
110 0.53
111 0.49
112 0.44
113 0.33
114 0.3
115 0.27
116 0.24
117 0.23
118 0.2
119 0.15
120 0.19
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.21
125 0.27
126 0.37
127 0.42
128 0.45
129 0.55
130 0.63
131 0.7
132 0.75
133 0.76
134 0.76
135 0.78
136 0.8
137 0.8
138 0.79
139 0.77
140 0.72
141 0.67
142 0.58
143 0.5
144 0.4
145 0.29
146 0.22
147 0.16
148 0.11
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.13
170 0.19
171 0.2
172 0.22
173 0.22
174 0.27
175 0.32
176 0.38
177 0.36
178 0.33
179 0.31
180 0.29
181 0.29
182 0.28
183 0.24
184 0.21
185 0.23
186 0.22
187 0.23
188 0.21
189 0.21
190 0.16
191 0.15
192 0.13
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.17
197 0.18
198 0.24
199 0.27
200 0.28
201 0.25
202 0.24
203 0.24
204 0.25
205 0.24
206 0.18
207 0.13
208 0.11
209 0.09
210 0.1
211 0.12
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.16
225 0.17
226 0.18
227 0.16
228 0.21
229 0.23
230 0.22
231 0.24
232 0.24
233 0.24
234 0.29
235 0.33
236 0.35
237 0.33
238 0.39
239 0.41
240 0.41
241 0.43
242 0.39
243 0.4
244 0.41
245 0.39
246 0.35
247 0.33
248 0.31
249 0.33
250 0.33
251 0.35
252 0.34
253 0.36
254 0.37
255 0.39
256 0.38
257 0.37
258 0.35
259 0.3
260 0.24
261 0.22
262 0.19
263 0.17
264 0.16
265 0.14
266 0.12
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.1
271 0.08
272 0.12
273 0.14
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.19
278 0.19
279 0.22
280 0.26
281 0.29
282 0.3
283 0.31
284 0.35
285 0.4
286 0.44
287 0.49
288 0.47
289 0.46
290 0.52
291 0.54
292 0.48
293 0.4
294 0.37
295 0.34
296 0.34
297 0.32
298 0.29
299 0.28
300 0.3
301 0.32
302 0.3
303 0.24
304 0.22
305 0.25
306 0.25
307 0.24
308 0.22
309 0.2
310 0.22
311 0.25
312 0.24
313 0.21
314 0.24
315 0.24
316 0.26
317 0.26
318 0.27
319 0.25
320 0.24
321 0.24
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.15
327 0.15
328 0.16
329 0.14
330 0.11
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.13
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.16
343 0.15
344 0.17
345 0.19
346 0.16
347 0.14
348 0.14
349 0.13
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.11
363 0.14
364 0.15
365 0.18
366 0.22
367 0.28
368 0.36
369 0.45
370 0.5
371 0.57
372 0.62
373 0.68
374 0.74
375 0.76
376 0.79
377 0.78
378 0.79
379 0.79
380 0.81
381 0.81
382 0.79
383 0.78
384 0.73
385 0.69
386 0.71
387 0.67
388 0.67
389 0.66
390 0.63
391 0.57
392 0.58
393 0.58
394 0.53
395 0.52
396 0.5
397 0.48
398 0.43
399 0.41
400 0.34
401 0.28
402 0.25
403 0.22
404 0.18
405 0.16
406 0.19
407 0.19
408 0.21
409 0.25
410 0.24
411 0.24
412 0.24
413 0.21
414 0.21
415 0.21
416 0.2
417 0.17
418 0.17
419 0.16
420 0.14
421 0.12
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.12
426 0.15
427 0.19
428 0.22
429 0.21
430 0.25
431 0.31
432 0.34
433 0.34
434 0.31
435 0.31
436 0.35
437 0.37
438 0.36
439 0.3
440 0.25
441 0.26
442 0.28
443 0.27
444 0.25
445 0.25
446 0.3
447 0.38
448 0.4
449 0.44
450 0.51
451 0.51
452 0.54
453 0.57
454 0.53
455 0.46
456 0.53
457 0.5
458 0.49
459 0.45
460 0.38
461 0.38
462 0.33
463 0.35
464 0.27
465 0.24
466 0.17
467 0.25
468 0.26
469 0.23
470 0.25
471 0.24
472 0.32
473 0.36
474 0.38
475 0.33
476 0.34
477 0.34
478 0.38
479 0.37
480 0.33
481 0.32
482 0.29
483 0.26
484 0.23
485 0.21