Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y4U0

Protein Details
Accession C4Y4U0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-26QGTEEPLKKRGRKPLLSQKHMDFHydrophilic
257-279FWAVCKSKVKKARVEKKEGLTSAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG clu:CLUG_04078  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
Amino Acid Sequences MSIQGTEEPLKKRGRKPLLSQKHMDFMKSLVAEDASITLDIMLKSLRTHFSDLEVSATTVHNFATKVCKLSLKRISKWPARRSSEDIKDQRYEWAKEYGDKLNFSENCIFIDEAGFNLSMRREYGWSSVGEKAITTAPITRGLNVSFIGAISSQGCISLKVRHPGGLVGNKKRKIETEVTSSTSSSTGTTADHIYGFVKSVIEQVSTSEELRTLKYLVLDNATIHKRRDIQLLVASSDLELVFLPPYSPCLNAIEEFWAVCKSKVKKARVEKKEGLTSAVRESIFQIPIESYRGFCRHAGKYVDYCLDRQLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.71
3 0.78
4 0.82
5 0.84
6 0.84
7 0.83
8 0.76
9 0.74
10 0.66
11 0.57
12 0.46
13 0.36
14 0.35
15 0.29
16 0.26
17 0.18
18 0.17
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.07
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.09
32 0.13
33 0.17
34 0.18
35 0.21
36 0.21
37 0.25
38 0.27
39 0.26
40 0.25
41 0.22
42 0.19
43 0.17
44 0.17
45 0.14
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.17
52 0.18
53 0.2
54 0.22
55 0.29
56 0.3
57 0.39
58 0.48
59 0.49
60 0.52
61 0.58
62 0.66
63 0.68
64 0.75
65 0.75
66 0.75
67 0.73
68 0.74
69 0.72
70 0.72
71 0.71
72 0.71
73 0.67
74 0.62
75 0.58
76 0.53
77 0.53
78 0.5
79 0.44
80 0.36
81 0.37
82 0.33
83 0.34
84 0.37
85 0.37
86 0.33
87 0.32
88 0.3
89 0.32
90 0.31
91 0.32
92 0.31
93 0.24
94 0.23
95 0.23
96 0.22
97 0.14
98 0.14
99 0.11
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.16
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.13
132 0.12
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.12
146 0.15
147 0.18
148 0.19
149 0.2
150 0.2
151 0.21
152 0.24
153 0.25
154 0.29
155 0.34
156 0.41
157 0.44
158 0.44
159 0.44
160 0.41
161 0.39
162 0.39
163 0.34
164 0.34
165 0.34
166 0.36
167 0.36
168 0.34
169 0.29
170 0.23
171 0.2
172 0.12
173 0.1
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.11
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.12
201 0.11
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.2
209 0.23
210 0.24
211 0.23
212 0.26
213 0.28
214 0.29
215 0.35
216 0.31
217 0.3
218 0.33
219 0.34
220 0.31
221 0.27
222 0.25
223 0.18
224 0.17
225 0.13
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.15
247 0.16
248 0.23
249 0.24
250 0.33
251 0.42
252 0.48
253 0.54
254 0.65
255 0.74
256 0.76
257 0.81
258 0.8
259 0.79
260 0.8
261 0.71
262 0.65
263 0.57
264 0.5
265 0.44
266 0.41
267 0.33
268 0.25
269 0.28
270 0.28
271 0.27
272 0.24
273 0.22
274 0.19
275 0.2
276 0.24
277 0.21
278 0.18
279 0.23
280 0.26
281 0.27
282 0.29
283 0.35
284 0.35
285 0.42
286 0.46
287 0.45
288 0.47
289 0.5
290 0.54
291 0.48
292 0.44