Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y8J9

Protein Details
Accession C4Y8J9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-42RYSSSDRHNSRDRNPRQRDPRDLAPGEHydrophilic
79-113QYNRGRPYEKYNPRRDNNRHRGDHRREKQDNHFNPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG clu:CLUG_04527  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MSNKDSYTGSRRDGDRYSSSDRHNSRDRNPRQRDPRDLAPGEREHLRERDTRGVDPRMSRYNDYREPNFRDRRYGNGNQYNRGRPYEKYNPRRDNNRHRGDHRREKQDNHFNPDASLTKEEKVAKYEKILIEQLKYPTLSTFPIKNSQWGIRPKGFEDVTAQRAKLSGLFPLPGSQAAEPAKLDAIEKGSAKSDVLLSTSKIDPIDSRHSRTVIVTNIDFSKVDYLKLADYINKHLCSADLEGTFLDDNIELKKKAKDGKSLIIQFKSSQCATFALTMNGKDIPMEQISQNESSETVVLSLERPGEYVVQCLPPYSSEATDIDDEVIDSPRKVTIFVDPSVTETMLLDDLQKIAKVKAFKLVRAVGTKESLGVAFVEFYISSKECTNTKSALKLIGTYVEEAKKLDIVSKIEFSCIKIGENYTSLTSIQDCPIDFKTLKSLVRNEYVQFHPKSKVIQLINIVTIEDLCNDETYKFIYSDIFEEAKTFGTVLSLKIPKPSYKKSPGVEEVNEPGVGKVFVEYEDEKTALSAIMGLAGRSYNDRTVLCAFFNHEDYIRGLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.49
4 0.53
5 0.52
6 0.55
7 0.59
8 0.59
9 0.6
10 0.64
11 0.65
12 0.66
13 0.71
14 0.76
15 0.77
16 0.82
17 0.85
18 0.87
19 0.88
20 0.89
21 0.85
22 0.84
23 0.83
24 0.77
25 0.7
26 0.67
27 0.6
28 0.54
29 0.52
30 0.46
31 0.41
32 0.41
33 0.41
34 0.4
35 0.42
36 0.48
37 0.47
38 0.5
39 0.52
40 0.55
41 0.55
42 0.55
43 0.55
44 0.54
45 0.55
46 0.54
47 0.53
48 0.56
49 0.59
50 0.61
51 0.62
52 0.62
53 0.66
54 0.71
55 0.74
56 0.68
57 0.69
58 0.64
59 0.65
60 0.65
61 0.65
62 0.65
63 0.66
64 0.67
65 0.66
66 0.71
67 0.71
68 0.66
69 0.63
70 0.55
71 0.48
72 0.53
73 0.56
74 0.59
75 0.62
76 0.69
77 0.73
78 0.79
79 0.87
80 0.88
81 0.89
82 0.89
83 0.89
84 0.86
85 0.84
86 0.87
87 0.86
88 0.87
89 0.85
90 0.85
91 0.81
92 0.8
93 0.83
94 0.83
95 0.8
96 0.77
97 0.72
98 0.61
99 0.55
100 0.52
101 0.43
102 0.35
103 0.33
104 0.27
105 0.24
106 0.29
107 0.32
108 0.29
109 0.32
110 0.32
111 0.29
112 0.31
113 0.37
114 0.33
115 0.33
116 0.36
117 0.34
118 0.32
119 0.35
120 0.33
121 0.29
122 0.28
123 0.24
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.21
129 0.22
130 0.29
131 0.29
132 0.32
133 0.35
134 0.36
135 0.4
136 0.43
137 0.47
138 0.44
139 0.45
140 0.43
141 0.46
142 0.42
143 0.35
144 0.34
145 0.32
146 0.33
147 0.33
148 0.32
149 0.25
150 0.25
151 0.24
152 0.22
153 0.17
154 0.14
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.13
161 0.14
162 0.11
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.09
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.11
181 0.09
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.12
191 0.16
192 0.25
193 0.26
194 0.3
195 0.32
196 0.32
197 0.32
198 0.33
199 0.31
200 0.24
201 0.24
202 0.19
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.14
208 0.16
209 0.14
210 0.14
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.14
215 0.14
216 0.11
217 0.12
218 0.19
219 0.23
220 0.22
221 0.22
222 0.2
223 0.2
224 0.2
225 0.2
226 0.17
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.12
232 0.1
233 0.08
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.09
238 0.09
239 0.11
240 0.13
241 0.17
242 0.24
243 0.27
244 0.33
245 0.35
246 0.4
247 0.46
248 0.5
249 0.5
250 0.44
251 0.42
252 0.35
253 0.33
254 0.3
255 0.23
256 0.17
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.16
261 0.15
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.1
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.09
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.09
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.1
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.14
322 0.17
323 0.18
324 0.2
325 0.18
326 0.2
327 0.21
328 0.2
329 0.14
330 0.1
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.11
342 0.13
343 0.13
344 0.21
345 0.23
346 0.23
347 0.28
348 0.3
349 0.31
350 0.32
351 0.34
352 0.27
353 0.27
354 0.25
355 0.2
356 0.17
357 0.14
358 0.11
359 0.09
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.1
370 0.12
371 0.14
372 0.16
373 0.19
374 0.2
375 0.22
376 0.24
377 0.24
378 0.27
379 0.25
380 0.25
381 0.22
382 0.21
383 0.2
384 0.18
385 0.2
386 0.17
387 0.18
388 0.17
389 0.17
390 0.14
391 0.14
392 0.16
393 0.16
394 0.17
395 0.19
396 0.23
397 0.23
398 0.23
399 0.24
400 0.22
401 0.22
402 0.2
403 0.19
404 0.16
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.18
409 0.15
410 0.16
411 0.15
412 0.14
413 0.14
414 0.14
415 0.14
416 0.15
417 0.14
418 0.17
419 0.18
420 0.23
421 0.21
422 0.2
423 0.25
424 0.29
425 0.32
426 0.33
427 0.37
428 0.36
429 0.41
430 0.43
431 0.38
432 0.38
433 0.4
434 0.43
435 0.4
436 0.39
437 0.37
438 0.37
439 0.38
440 0.36
441 0.4
442 0.33
443 0.35
444 0.36
445 0.35
446 0.35
447 0.31
448 0.28
449 0.19
450 0.18
451 0.14
452 0.1
453 0.09
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.12
460 0.13
461 0.12
462 0.12
463 0.13
464 0.13
465 0.15
466 0.19
467 0.18
468 0.16
469 0.17
470 0.17
471 0.16
472 0.15
473 0.13
474 0.09
475 0.1
476 0.11
477 0.11
478 0.19
479 0.22
480 0.22
481 0.29
482 0.32
483 0.37
484 0.45
485 0.52
486 0.54
487 0.59
488 0.67
489 0.65
490 0.71
491 0.71
492 0.7
493 0.64
494 0.59
495 0.53
496 0.47
497 0.43
498 0.34
499 0.27
500 0.21
501 0.18
502 0.14
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.14
507 0.15
508 0.18
509 0.2
510 0.2
511 0.19
512 0.19
513 0.19
514 0.14
515 0.12
516 0.09
517 0.06
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.11
524 0.14
525 0.17
526 0.16
527 0.2
528 0.2
529 0.23
530 0.28
531 0.29
532 0.27
533 0.26
534 0.28
535 0.28
536 0.3
537 0.29
538 0.25
539 0.25