Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y4U6

Protein Details
Accession C4Y4U6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-115REVSENVSSKHRKKARRRRRSSAQSSSEPRAEKVHKKKLKRDNEPVSIVYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-106KHRKKARRRRRSSAQSSSEPRAEKVHKKKLKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR034922  REX1-like_exo  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG clu:CLUG_04084  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06145  REX1_like  
Amino Acid Sequences MTNNDEQLSQTAARLSISTDDKSVIKQVRDFLADQSPKRRDSAVSITSIDEEPKHNGVIEPPNGNREVSENVSSKHRKKARRRRRSSAQSSSEPRAEKVHKKKLKRDNEPVSIVYDESCGKALAMAQFRTLLHSIVSGTPAQGQRLVKVNKPTKVTKVVFAFVPGLRPSDFNVVKSSEEPLLQPMVKENETKMAFFYNVFDYLMPLTISGSKDSIYSCSQTLINFGLSKKEKKQRAEESRQTKLVLYDLLLTRDQMEKSNYPIHSSQSGEESVEEGWVETTNFEHDGSHTFALDCEFCESSSGKVLTRISIVNFQGETVYDTYVKPKEEITDYVTRYSGITEEILKGVTTTLADVQAKVLDTVSSSDILIGHSLDSDLRVLKVKHPRVIDTAIIYDHHRGPPSKPGLKWLSATFLSRSIQQGEQTGAGHSSVEDSLACLDLVKMKLVEGPEFGRVPREVTLFEKLREEKVDKLSTIIDHSPALWGPYIWEQPNLRVLSVSDDDEVAEEAVNAVKDSDLLLLRFKEIDFNSGAVAVPSSFKGKLYSELDNTRHAKATLTEENRLELLGRLNERLQKVFDSLPSDSVFIVASEGSDSREMMNLQRVRRNFQNLERSGADLSSLSPEECWDFDKLSALHRATTEARKGIAFVGRKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.18
4 0.22
5 0.22
6 0.21
7 0.23
8 0.24
9 0.25
10 0.32
11 0.32
12 0.32
13 0.34
14 0.38
15 0.4
16 0.43
17 0.42
18 0.38
19 0.42
20 0.45
21 0.46
22 0.51
23 0.51
24 0.5
25 0.51
26 0.49
27 0.41
28 0.42
29 0.47
30 0.42
31 0.4
32 0.39
33 0.38
34 0.38
35 0.36
36 0.31
37 0.23
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.22
42 0.2
43 0.2
44 0.24
45 0.31
46 0.33
47 0.34
48 0.34
49 0.38
50 0.38
51 0.37
52 0.32
53 0.27
54 0.27
55 0.25
56 0.3
57 0.28
58 0.28
59 0.38
60 0.46
61 0.48
62 0.53
63 0.57
64 0.61
65 0.7
66 0.8
67 0.82
68 0.85
69 0.9
70 0.9
71 0.93
72 0.94
73 0.93
74 0.92
75 0.89
76 0.86
77 0.83
78 0.78
79 0.73
80 0.63
81 0.54
82 0.52
83 0.51
84 0.53
85 0.57
86 0.62
87 0.65
88 0.72
89 0.81
90 0.83
91 0.87
92 0.87
93 0.87
94 0.86
95 0.85
96 0.81
97 0.72
98 0.64
99 0.54
100 0.43
101 0.33
102 0.25
103 0.18
104 0.14
105 0.14
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.12
110 0.16
111 0.2
112 0.19
113 0.2
114 0.22
115 0.22
116 0.25
117 0.23
118 0.18
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.15
124 0.11
125 0.11
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.21
130 0.2
131 0.21
132 0.3
133 0.33
134 0.32
135 0.41
136 0.47
137 0.48
138 0.53
139 0.54
140 0.52
141 0.59
142 0.55
143 0.52
144 0.48
145 0.45
146 0.39
147 0.37
148 0.34
149 0.24
150 0.26
151 0.2
152 0.18
153 0.17
154 0.18
155 0.18
156 0.24
157 0.25
158 0.22
159 0.25
160 0.24
161 0.25
162 0.25
163 0.25
164 0.18
165 0.17
166 0.16
167 0.15
168 0.17
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.2
173 0.2
174 0.21
175 0.2
176 0.24
177 0.25
178 0.25
179 0.22
180 0.19
181 0.18
182 0.18
183 0.19
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.14
202 0.13
203 0.14
204 0.13
205 0.14
206 0.15
207 0.14
208 0.16
209 0.14
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.2
214 0.23
215 0.27
216 0.34
217 0.41
218 0.46
219 0.5
220 0.6
221 0.63
222 0.7
223 0.76
224 0.77
225 0.76
226 0.74
227 0.7
228 0.61
229 0.51
230 0.41
231 0.32
232 0.23
233 0.16
234 0.15
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.16
241 0.16
242 0.15
243 0.17
244 0.16
245 0.2
246 0.27
247 0.25
248 0.26
249 0.27
250 0.26
251 0.25
252 0.26
253 0.22
254 0.18
255 0.19
256 0.16
257 0.14
258 0.13
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.09
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.13
289 0.13
290 0.11
291 0.14
292 0.15
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.12
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.11
304 0.12
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.11
310 0.13
311 0.14
312 0.13
313 0.12
314 0.14
315 0.15
316 0.16
317 0.18
318 0.22
319 0.23
320 0.23
321 0.23
322 0.21
323 0.19
324 0.18
325 0.13
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.05
348 0.05
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.05
359 0.04
360 0.05
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.09
367 0.1
368 0.16
369 0.26
370 0.3
371 0.34
372 0.35
373 0.37
374 0.37
375 0.39
376 0.34
377 0.26
378 0.22
379 0.18
380 0.18
381 0.17
382 0.15
383 0.15
384 0.16
385 0.17
386 0.17
387 0.19
388 0.27
389 0.34
390 0.37
391 0.34
392 0.4
393 0.42
394 0.42
395 0.43
396 0.35
397 0.31
398 0.27
399 0.28
400 0.22
401 0.2
402 0.19
403 0.19
404 0.19
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.18
409 0.16
410 0.17
411 0.15
412 0.14
413 0.12
414 0.1
415 0.09
416 0.07
417 0.08
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.09
431 0.09
432 0.11
433 0.12
434 0.13
435 0.11
436 0.12
437 0.14
438 0.15
439 0.15
440 0.16
441 0.15
442 0.16
443 0.17
444 0.16
445 0.15
446 0.18
447 0.25
448 0.24
449 0.25
450 0.29
451 0.29
452 0.3
453 0.33
454 0.32
455 0.3
456 0.36
457 0.38
458 0.32
459 0.32
460 0.31
461 0.27
462 0.28
463 0.24
464 0.18
465 0.15
466 0.15
467 0.15
468 0.13
469 0.13
470 0.1
471 0.08
472 0.09
473 0.14
474 0.18
475 0.17
476 0.22
477 0.22
478 0.24
479 0.31
480 0.3
481 0.25
482 0.21
483 0.21
484 0.21
485 0.22
486 0.21
487 0.15
488 0.14
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.09
493 0.07
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.13
507 0.13
508 0.15
509 0.15
510 0.15
511 0.19
512 0.17
513 0.2
514 0.18
515 0.18
516 0.17
517 0.17
518 0.17
519 0.1
520 0.1
521 0.08
522 0.07
523 0.08
524 0.11
525 0.11
526 0.12
527 0.14
528 0.15
529 0.22
530 0.25
531 0.3
532 0.33
533 0.4
534 0.42
535 0.47
536 0.48
537 0.43
538 0.42
539 0.37
540 0.32
541 0.28
542 0.34
543 0.35
544 0.37
545 0.4
546 0.38
547 0.39
548 0.37
549 0.34
550 0.27
551 0.19
552 0.2
553 0.2
554 0.21
555 0.22
556 0.26
557 0.31
558 0.33
559 0.34
560 0.31
561 0.28
562 0.29
563 0.29
564 0.29
565 0.29
566 0.28
567 0.28
568 0.27
569 0.26
570 0.22
571 0.2
572 0.17
573 0.11
574 0.11
575 0.08
576 0.07
577 0.07
578 0.08
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.13
584 0.14
585 0.16
586 0.25
587 0.28
588 0.33
589 0.4
590 0.42
591 0.46
592 0.53
593 0.59
594 0.57
595 0.6
596 0.66
597 0.61
598 0.64
599 0.59
600 0.54
601 0.45
602 0.38
603 0.3
604 0.19
605 0.18
606 0.16
607 0.16
608 0.14
609 0.13
610 0.14
611 0.16
612 0.16
613 0.18
614 0.16
615 0.16
616 0.17
617 0.23
618 0.23
619 0.25
620 0.32
621 0.31
622 0.31
623 0.3
624 0.34
625 0.33
626 0.41
627 0.42
628 0.37
629 0.38
630 0.35
631 0.36
632 0.35
633 0.37