Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XWH0

Protein Details
Accession C4XWH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MPPKPPPNSKKTKLYNSRAIRSESHydrophilic
69-101LPRTLRRRTASHNVKRIPKRLRNKALREMQNSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-95RRRTASHNVKRIPKRLRNKALR
107-125KKPHLRGRELYRLKMQKRL
Subcellular Location(s) mito 12.5, mito_nucl 10.5, nucl 7.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG clu:CLUG_00293  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MPPKPPPNSKKTKLYNSRAIRSESVDPAVKDGVLDVSQFLSSREYEIRAFEQSQLNTKYATSTRVFQSLPRTLRRRTASHNVKRIPKRLRNKALREMQNSVSGTPDKKPHLRGRELYRLKMQKRLLRLASKIKEMKELPRVQGTSVQEKIKILNKQIDESRKKRTVSLNNKVGAHDICATNALAPKPSGNMKFAHRQKEFTWCPTHIWHAKRFHMMKRWGFQIPFSPNQKCFRSTSRAAKQATLAYETSYYGEFITEFPTTESLCAWLTTFTKYNSPVPEWLLGSKVYNDWIYVDDKKFALGTVVVDLPLKKILVRVHPSVYEDFFSKVVEWAPEGVTTIDSRFALGSIQLHGPTALQSLAKVLHLESASAAVSDAWRWCSQVADSSNIPIGTVFCFFAKDPRFWKHPVNPPPSSKRGGDFLFENQRFVEPSVLSSLLSSEGRTASYDNMYSLKQLGKEFANHDPSSTHIHGASKLPVLIYKMANGTWCVNMPWFWVQPVWSKLVQVKSIKTAGMRQEHQINFERGIATYPHDFPYLFEGYKEHLLLEAATQAARAKLPLSKQAPMKVEGRLQLGCDWFFLRKWIFGMKLIDRKDSVAAHGEFTEERVRIIKNTDDLALVIANTRPESEKDSPIALFSRADPTHRAIVEGTYKPDVSKFPALPVVQVHLELIGKGTIRDNARIYEVTKNVSMENLVGFVTSGSFNFRQGSPTGIGLIAAHCKKQQKVYVRNVGCTTYSPARIRLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.87
3 0.85
4 0.86
5 0.8
6 0.76
7 0.68
8 0.62
9 0.59
10 0.52
11 0.48
12 0.44
13 0.39
14 0.36
15 0.34
16 0.29
17 0.23
18 0.19
19 0.17
20 0.13
21 0.13
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.16
30 0.18
31 0.19
32 0.2
33 0.24
34 0.26
35 0.28
36 0.29
37 0.3
38 0.34
39 0.33
40 0.4
41 0.4
42 0.38
43 0.34
44 0.32
45 0.33
46 0.28
47 0.32
48 0.26
49 0.28
50 0.3
51 0.34
52 0.35
53 0.33
54 0.4
55 0.43
56 0.47
57 0.52
58 0.54
59 0.53
60 0.62
61 0.65
62 0.62
63 0.61
64 0.66
65 0.67
66 0.72
67 0.78
68 0.76
69 0.8
70 0.83
71 0.84
72 0.83
73 0.82
74 0.83
75 0.84
76 0.88
77 0.88
78 0.88
79 0.89
80 0.88
81 0.87
82 0.82
83 0.76
84 0.68
85 0.65
86 0.57
87 0.47
88 0.4
89 0.35
90 0.31
91 0.3
92 0.34
93 0.34
94 0.39
95 0.47
96 0.53
97 0.59
98 0.65
99 0.69
100 0.71
101 0.75
102 0.75
103 0.71
104 0.71
105 0.72
106 0.66
107 0.66
108 0.65
109 0.59
110 0.61
111 0.65
112 0.63
113 0.6
114 0.64
115 0.66
116 0.63
117 0.66
118 0.63
119 0.56
120 0.56
121 0.52
122 0.53
123 0.53
124 0.54
125 0.49
126 0.51
127 0.51
128 0.44
129 0.48
130 0.45
131 0.42
132 0.41
133 0.39
134 0.33
135 0.34
136 0.36
137 0.37
138 0.37
139 0.35
140 0.37
141 0.37
142 0.4
143 0.46
144 0.53
145 0.55
146 0.55
147 0.6
148 0.59
149 0.58
150 0.59
151 0.62
152 0.63
153 0.65
154 0.7
155 0.69
156 0.66
157 0.66
158 0.61
159 0.54
160 0.44
161 0.35
162 0.28
163 0.21
164 0.17
165 0.17
166 0.16
167 0.15
168 0.18
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.16
174 0.22
175 0.22
176 0.21
177 0.23
178 0.26
179 0.36
180 0.42
181 0.49
182 0.45
183 0.46
184 0.46
185 0.53
186 0.53
187 0.49
188 0.48
189 0.4
190 0.41
191 0.4
192 0.46
193 0.43
194 0.44
195 0.46
196 0.46
197 0.49
198 0.55
199 0.57
200 0.56
201 0.58
202 0.62
203 0.6
204 0.58
205 0.58
206 0.54
207 0.49
208 0.44
209 0.42
210 0.4
211 0.41
212 0.42
213 0.42
214 0.43
215 0.49
216 0.5
217 0.45
218 0.43
219 0.42
220 0.44
221 0.47
222 0.53
223 0.54
224 0.59
225 0.58
226 0.55
227 0.51
228 0.47
229 0.41
230 0.34
231 0.26
232 0.19
233 0.18
234 0.17
235 0.15
236 0.12
237 0.11
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.14
258 0.14
259 0.17
260 0.19
261 0.23
262 0.24
263 0.26
264 0.25
265 0.25
266 0.26
267 0.23
268 0.21
269 0.18
270 0.16
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.13
280 0.16
281 0.17
282 0.17
283 0.16
284 0.17
285 0.16
286 0.14
287 0.11
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.06
299 0.1
300 0.13
301 0.2
302 0.24
303 0.26
304 0.27
305 0.28
306 0.3
307 0.28
308 0.26
309 0.2
310 0.16
311 0.15
312 0.13
313 0.12
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.14
370 0.15
371 0.15
372 0.15
373 0.16
374 0.17
375 0.16
376 0.16
377 0.1
378 0.09
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.14
386 0.16
387 0.18
388 0.21
389 0.26
390 0.29
391 0.31
392 0.39
393 0.4
394 0.48
395 0.55
396 0.58
397 0.58
398 0.61
399 0.64
400 0.61
401 0.56
402 0.47
403 0.39
404 0.36
405 0.32
406 0.28
407 0.23
408 0.24
409 0.31
410 0.3
411 0.29
412 0.24
413 0.24
414 0.23
415 0.22
416 0.2
417 0.1
418 0.1
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.12
440 0.12
441 0.13
442 0.14
443 0.15
444 0.15
445 0.18
446 0.2
447 0.24
448 0.29
449 0.26
450 0.27
451 0.24
452 0.25
453 0.29
454 0.27
455 0.22
456 0.17
457 0.18
458 0.19
459 0.21
460 0.21
461 0.15
462 0.14
463 0.14
464 0.13
465 0.14
466 0.15
467 0.14
468 0.13
469 0.13
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.12
475 0.12
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.13
480 0.14
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.14
485 0.19
486 0.21
487 0.22
488 0.19
489 0.2
490 0.24
491 0.27
492 0.31
493 0.29
494 0.28
495 0.29
496 0.3
497 0.3
498 0.27
499 0.28
500 0.3
501 0.33
502 0.33
503 0.31
504 0.39
505 0.38
506 0.42
507 0.42
508 0.37
509 0.32
510 0.31
511 0.29
512 0.2
513 0.21
514 0.18
515 0.15
516 0.16
517 0.17
518 0.17
519 0.17
520 0.17
521 0.16
522 0.21
523 0.22
524 0.18
525 0.17
526 0.17
527 0.19
528 0.21
529 0.2
530 0.15
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.11
535 0.09
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.11
545 0.14
546 0.23
547 0.26
548 0.3
549 0.34
550 0.4
551 0.42
552 0.42
553 0.42
554 0.36
555 0.37
556 0.34
557 0.34
558 0.28
559 0.26
560 0.26
561 0.26
562 0.23
563 0.2
564 0.18
565 0.16
566 0.16
567 0.19
568 0.17
569 0.16
570 0.18
571 0.21
572 0.21
573 0.25
574 0.3
575 0.33
576 0.39
577 0.39
578 0.41
579 0.37
580 0.37
581 0.36
582 0.31
583 0.26
584 0.26
585 0.24
586 0.23
587 0.22
588 0.22
589 0.18
590 0.2
591 0.23
592 0.15
593 0.15
594 0.17
595 0.18
596 0.18
597 0.22
598 0.23
599 0.21
600 0.23
601 0.23
602 0.21
603 0.2
604 0.19
605 0.16
606 0.12
607 0.1
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.11
612 0.12
613 0.14
614 0.21
615 0.25
616 0.28
617 0.29
618 0.31
619 0.3
620 0.3
621 0.3
622 0.24
623 0.2
624 0.17
625 0.24
626 0.22
627 0.24
628 0.25
629 0.28
630 0.33
631 0.32
632 0.32
633 0.24
634 0.27
635 0.32
636 0.32
637 0.32
638 0.28
639 0.28
640 0.27
641 0.29
642 0.27
643 0.26
644 0.32
645 0.28
646 0.29
647 0.36
648 0.35
649 0.35
650 0.34
651 0.32
652 0.24
653 0.24
654 0.2
655 0.15
656 0.15
657 0.13
658 0.13
659 0.1
660 0.1
661 0.11
662 0.13
663 0.17
664 0.19
665 0.24
666 0.25
667 0.25
668 0.29
669 0.3
670 0.31
671 0.33
672 0.33
673 0.32
674 0.32
675 0.31
676 0.27
677 0.26
678 0.25
679 0.17
680 0.16
681 0.13
682 0.1
683 0.09
684 0.09
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.08
689 0.13
690 0.14
691 0.16
692 0.18
693 0.19
694 0.21
695 0.21
696 0.25
697 0.21
698 0.22
699 0.21
700 0.18
701 0.18
702 0.16
703 0.17
704 0.21
705 0.2
706 0.22
707 0.25
708 0.31
709 0.35
710 0.43
711 0.5
712 0.52
713 0.61
714 0.69
715 0.75
716 0.73
717 0.75
718 0.69
719 0.63
720 0.54
721 0.46
722 0.43
723 0.39
724 0.43
725 0.4