Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y1L1

Protein Details
Accession C4Y1L1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
290-315HFMRFFWRRDTRKKSKILRKVQFPFEHydrophilic
348-368IRDFKKAKKDKSLTPKQQQEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR019954  Ubiquitin_CS  
IPR044635  UBP14-like  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
KEGG clu:CLUG_02093  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00240  ubiquitin  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00299  UBIQUITIN_1  
PS50053  UBIQUITIN_2  
PS00972  USP_1  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
Amino Acid Sequences MAFTISIKNAGKVHEIELEDSATGLEFKKKIQDITQIPVERQKILIKGGKLSDDVVVSTLKANLKNPIMVLGTPDKDLPVFDSNKHVFLEDLNENQLVKVAEEPSGLINLGNTCYLNSSLQALYNIKDISDKVKSSSGSTAMITTLKGIFNAMGKKQQNVDPTLFLMQFRAQFPQFAEQEMGMYKQQDAEEAFSQIMTVLGSTFDINDAFRIDFKTVTKCLSLPEEEPKIGSDSASKLSCHIDIKTNFLRDGIINGLTDKLEKRNETLNANAEYEITKTITRLPKYLTVHFMRFFWRRDTRKKSKILRKVQFPFELDLSEMLDPSIKQEKIEVRDKLRKIEKDNDELIRDFKKAKKDKSLTPKQQQEEDELKIESIKSKFMDDFAGILPKDFSFETATENPSSVYELQAIITHQGSSADSGHYQAFVKNEKDLEGESWWKFNDNKVSSVNRDKIEALAGGGESDSALILIYKAKGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.29
4 0.28
5 0.27
6 0.21
7 0.2
8 0.16
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.15
13 0.14
14 0.16
15 0.25
16 0.28
17 0.31
18 0.35
19 0.43
20 0.42
21 0.48
22 0.55
23 0.5
24 0.48
25 0.52
26 0.49
27 0.4
28 0.38
29 0.36
30 0.3
31 0.35
32 0.39
33 0.34
34 0.38
35 0.39
36 0.39
37 0.35
38 0.33
39 0.28
40 0.22
41 0.21
42 0.16
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.15
47 0.17
48 0.19
49 0.2
50 0.25
51 0.27
52 0.28
53 0.27
54 0.27
55 0.25
56 0.22
57 0.25
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.2
63 0.18
64 0.18
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.21
69 0.3
70 0.3
71 0.33
72 0.33
73 0.28
74 0.22
75 0.21
76 0.26
77 0.2
78 0.2
79 0.19
80 0.2
81 0.2
82 0.19
83 0.21
84 0.15
85 0.12
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.16
109 0.15
110 0.14
111 0.18
112 0.17
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.17
117 0.21
118 0.21
119 0.19
120 0.23
121 0.24
122 0.25
123 0.27
124 0.24
125 0.21
126 0.2
127 0.18
128 0.15
129 0.15
130 0.13
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.12
138 0.16
139 0.16
140 0.22
141 0.23
142 0.25
143 0.28
144 0.31
145 0.32
146 0.32
147 0.32
148 0.25
149 0.26
150 0.26
151 0.24
152 0.2
153 0.17
154 0.15
155 0.17
156 0.16
157 0.18
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.23
162 0.21
163 0.2
164 0.19
165 0.16
166 0.16
167 0.15
168 0.16
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.11
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.05
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.11
202 0.15
203 0.15
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.18
210 0.15
211 0.2
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.19
216 0.18
217 0.16
218 0.14
219 0.1
220 0.1
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.13
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.18
230 0.18
231 0.24
232 0.27
233 0.27
234 0.25
235 0.24
236 0.24
237 0.16
238 0.17
239 0.13
240 0.1
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.11
248 0.14
249 0.14
250 0.16
251 0.21
252 0.24
253 0.25
254 0.27
255 0.28
256 0.26
257 0.27
258 0.25
259 0.19
260 0.17
261 0.16
262 0.14
263 0.1
264 0.08
265 0.08
266 0.14
267 0.2
268 0.21
269 0.22
270 0.24
271 0.3
272 0.34
273 0.36
274 0.36
275 0.34
276 0.36
277 0.35
278 0.33
279 0.32
280 0.33
281 0.32
282 0.33
283 0.39
284 0.43
285 0.52
286 0.61
287 0.66
288 0.71
289 0.78
290 0.81
291 0.82
292 0.85
293 0.86
294 0.83
295 0.83
296 0.81
297 0.78
298 0.72
299 0.64
300 0.56
301 0.46
302 0.39
303 0.29
304 0.23
305 0.18
306 0.13
307 0.1
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.1
312 0.17
313 0.15
314 0.15
315 0.2
316 0.26
317 0.31
318 0.4
319 0.41
320 0.42
321 0.51
322 0.53
323 0.57
324 0.59
325 0.59
326 0.57
327 0.62
328 0.6
329 0.58
330 0.62
331 0.57
332 0.51
333 0.47
334 0.43
335 0.36
336 0.31
337 0.29
338 0.28
339 0.35
340 0.4
341 0.47
342 0.54
343 0.58
344 0.65
345 0.72
346 0.79
347 0.79
348 0.81
349 0.83
350 0.75
351 0.76
352 0.68
353 0.65
354 0.58
355 0.51
356 0.43
357 0.34
358 0.31
359 0.25
360 0.24
361 0.23
362 0.18
363 0.19
364 0.18
365 0.2
366 0.21
367 0.21
368 0.23
369 0.18
370 0.19
371 0.17
372 0.21
373 0.18
374 0.18
375 0.18
376 0.15
377 0.16
378 0.14
379 0.15
380 0.12
381 0.13
382 0.19
383 0.21
384 0.24
385 0.23
386 0.23
387 0.22
388 0.19
389 0.22
390 0.16
391 0.14
392 0.13
393 0.12
394 0.13
395 0.14
396 0.14
397 0.13
398 0.13
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.18
413 0.22
414 0.24
415 0.25
416 0.26
417 0.26
418 0.27
419 0.26
420 0.24
421 0.24
422 0.28
423 0.26
424 0.28
425 0.27
426 0.3
427 0.29
428 0.33
429 0.39
430 0.35
431 0.38
432 0.42
433 0.48
434 0.51
435 0.6
436 0.6
437 0.51
438 0.5
439 0.47
440 0.41
441 0.38
442 0.31
443 0.22
444 0.16
445 0.15
446 0.13
447 0.11
448 0.1
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.08