Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y060

Protein Details
Accession C4Y060    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSSKKYNRKRRLDLSDEEKVDHydrophilic
198-225AMFLTKKEMKRARRNERQARHKEKQDRIBasic
349-373AKSIKFYKKLMTKRIKWNQSNSDVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-226KKEMKRARRNERQARHKEKQDRIR
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 13.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG clu:CLUG_01592  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MSSKKYNRKRRLDLSDEEKVDESKKQSKGGLNVDIHPLLREMVSLPTIPKNHNPLKQNARSIFDPTALNPYVSQENIHTQFHKPRPLIINPKGKYVSKGNEMRAKLMEDKIKEQEIAELRAKNLLADENIQEVRYKPQQPPLIEWWDKPYIRARSYNEFKDKKLDFFLEHEDAPVSIYIQHPVPVQPPWEKHIVQEKAMFLTKKEMKRARRNERQARHKEKQDRIRLGLDPPPPPKVKLSNLMNVLTNEAIKDPTGVEMRVRKEVEERLEKHLQENEARRLTPEQKHEKIKAKRENDLQRGYFTTVYKVNTLEDPQHFFKVDMNAKQLDLFGIVLINPRFNLIIVEGGAKSIKFYKKLMTKRIKWNQSNSDVDVSNNKCTILWEGQLNELSFKKWSPMYTQDDEEAYKVLNKFGHENYWREAFDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.81
3 0.72
4 0.64
5 0.55
6 0.47
7 0.41
8 0.38
9 0.36
10 0.35
11 0.38
12 0.4
13 0.44
14 0.49
15 0.55
16 0.57
17 0.59
18 0.53
19 0.52
20 0.53
21 0.48
22 0.42
23 0.35
24 0.28
25 0.2
26 0.17
27 0.14
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.15
33 0.21
34 0.24
35 0.27
36 0.32
37 0.39
38 0.46
39 0.51
40 0.54
41 0.57
42 0.65
43 0.69
44 0.72
45 0.67
46 0.64
47 0.59
48 0.59
49 0.51
50 0.43
51 0.37
52 0.28
53 0.32
54 0.27
55 0.26
56 0.21
57 0.22
58 0.22
59 0.21
60 0.21
61 0.16
62 0.23
63 0.26
64 0.29
65 0.28
66 0.3
67 0.39
68 0.44
69 0.5
70 0.43
71 0.47
72 0.51
73 0.58
74 0.63
75 0.62
76 0.66
77 0.59
78 0.66
79 0.62
80 0.57
81 0.52
82 0.49
83 0.46
84 0.45
85 0.51
86 0.5
87 0.54
88 0.54
89 0.52
90 0.46
91 0.44
92 0.38
93 0.37
94 0.36
95 0.31
96 0.35
97 0.35
98 0.35
99 0.32
100 0.28
101 0.3
102 0.27
103 0.3
104 0.3
105 0.27
106 0.26
107 0.28
108 0.28
109 0.21
110 0.19
111 0.16
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.19
121 0.24
122 0.27
123 0.26
124 0.34
125 0.4
126 0.41
127 0.46
128 0.47
129 0.48
130 0.46
131 0.44
132 0.41
133 0.42
134 0.4
135 0.36
136 0.38
137 0.36
138 0.38
139 0.43
140 0.42
141 0.45
142 0.52
143 0.57
144 0.59
145 0.55
146 0.53
147 0.55
148 0.52
149 0.44
150 0.41
151 0.36
152 0.27
153 0.27
154 0.32
155 0.26
156 0.24
157 0.22
158 0.19
159 0.17
160 0.16
161 0.13
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.14
173 0.17
174 0.19
175 0.2
176 0.24
177 0.24
178 0.25
179 0.33
180 0.32
181 0.3
182 0.31
183 0.29
184 0.26
185 0.29
186 0.26
187 0.17
188 0.23
189 0.27
190 0.27
191 0.35
192 0.4
193 0.47
194 0.57
195 0.67
196 0.7
197 0.74
198 0.81
199 0.83
200 0.85
201 0.87
202 0.87
203 0.86
204 0.83
205 0.81
206 0.8
207 0.79
208 0.79
209 0.78
210 0.71
211 0.65
212 0.61
213 0.54
214 0.47
215 0.45
216 0.39
217 0.35
218 0.32
219 0.34
220 0.31
221 0.31
222 0.32
223 0.31
224 0.3
225 0.34
226 0.36
227 0.37
228 0.39
229 0.38
230 0.37
231 0.31
232 0.29
233 0.21
234 0.16
235 0.11
236 0.09
237 0.08
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.12
245 0.17
246 0.19
247 0.25
248 0.25
249 0.23
250 0.25
251 0.3
252 0.33
253 0.37
254 0.37
255 0.39
256 0.44
257 0.44
258 0.43
259 0.42
260 0.38
261 0.35
262 0.39
263 0.39
264 0.37
265 0.36
266 0.35
267 0.37
268 0.41
269 0.41
270 0.44
271 0.46
272 0.5
273 0.57
274 0.63
275 0.68
276 0.69
277 0.73
278 0.73
279 0.69
280 0.69
281 0.72
282 0.75
283 0.73
284 0.72
285 0.63
286 0.56
287 0.54
288 0.49
289 0.42
290 0.33
291 0.28
292 0.24
293 0.24
294 0.23
295 0.21
296 0.2
297 0.19
298 0.21
299 0.23
300 0.23
301 0.27
302 0.28
303 0.3
304 0.29
305 0.27
306 0.28
307 0.31
308 0.34
309 0.32
310 0.33
311 0.32
312 0.32
313 0.32
314 0.29
315 0.2
316 0.15
317 0.11
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.08
330 0.1
331 0.09
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.17
339 0.21
340 0.22
341 0.24
342 0.32
343 0.41
344 0.5
345 0.59
346 0.63
347 0.67
348 0.75
349 0.84
350 0.86
351 0.84
352 0.85
353 0.84
354 0.81
355 0.77
356 0.7
357 0.64
358 0.54
359 0.48
360 0.47
361 0.41
362 0.37
363 0.32
364 0.29
365 0.24
366 0.25
367 0.3
368 0.25
369 0.25
370 0.24
371 0.25
372 0.29
373 0.32
374 0.31
375 0.28
376 0.25
377 0.24
378 0.21
379 0.2
380 0.21
381 0.21
382 0.23
383 0.26
384 0.34
385 0.41
386 0.44
387 0.46
388 0.45
389 0.44
390 0.43
391 0.37
392 0.29
393 0.22
394 0.22
395 0.2
396 0.21
397 0.21
398 0.22
399 0.27
400 0.29
401 0.38
402 0.38
403 0.41
404 0.42
405 0.47