Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XYY3

Protein Details
Accession C4XYY3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-49AANVPPKAPKQSKKAKKQEFLLKTPKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-39KAPKQSKKAKK
Subcellular Location(s) mito 18, cyto_mito 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR004154  Anticodon-bd  
IPR036621  Anticodon-bd_dom_sf  
IPR015807  His-tRNA-ligase  
IPR041715  HisRS-like_core  
IPR004516  HisRS/HisZ  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004821  F:histidine-tRNA ligase activity  
GO:0006427  P:histidyl-tRNA aminoacylation  
KEGG clu:CLUG_01156  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03129  HGTP_anticodon  
PF13393  tRNA-synt_His  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
CDD cd00773  HisRS-like_core  
Amino Acid Sequences MFRRSFPKLLRRMSTEASSPIVAANVPPKAPKQSKKAKKQEFLLKTPKGTKDWADKDMVLREAIFSTLSDMFKKHGGQALDTPVFELREILTGKYGEDSKLIYNLQDQGGELTSLRYDLTVPFARFVAANSISSIKRYHIAKVYRRDQPAMTKGRMREFYQCDFDIAGTYDPMVPDAEVLAILVEGLTSLGIHDFKIKLNHRKVLDGIFQACGVKDEDVRKISSAVDKLDKLPWEAVKKEMCVEKGQPEAVADKIGEFVKVKGSLKHTLDFLQGSELLASNESAQKGISDMAELAGYVEALQIEDHLSFDLSLARGLDYYTGLIYEAVTEASAPPSNAEELKARAKKENKDEDASEYVGVGSIAAGGRYDNLVGMFSNGKTIPCVGISFGVERIFSILKARAAKEWENLSSTHTDVYIMAFGGGAGWTGFLKERMTVARQLWAAGINAEYLYKVKANPRKQFDAADKAKAKLAVILGKEEYPEGKLRVKVLGQGDDSTDGDLVEAGEIVEVVKQKLGEVYVDGMSDISRLVKNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.55
3 0.49
4 0.43
5 0.36
6 0.3
7 0.24
8 0.2
9 0.16
10 0.14
11 0.17
12 0.17
13 0.18
14 0.21
15 0.24
16 0.33
17 0.43
18 0.49
19 0.54
20 0.62
21 0.71
22 0.8
23 0.88
24 0.88
25 0.87
26 0.88
27 0.89
28 0.86
29 0.85
30 0.84
31 0.78
32 0.75
33 0.74
34 0.7
35 0.63
36 0.58
37 0.56
38 0.56
39 0.57
40 0.54
41 0.51
42 0.47
43 0.48
44 0.49
45 0.43
46 0.33
47 0.27
48 0.24
49 0.2
50 0.19
51 0.15
52 0.1
53 0.12
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.18
59 0.22
60 0.23
61 0.22
62 0.23
63 0.23
64 0.25
65 0.29
66 0.36
67 0.34
68 0.32
69 0.3
70 0.27
71 0.26
72 0.23
73 0.19
74 0.11
75 0.14
76 0.16
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.18
82 0.19
83 0.14
84 0.15
85 0.16
86 0.14
87 0.18
88 0.18
89 0.15
90 0.17
91 0.2
92 0.19
93 0.18
94 0.17
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.12
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.13
107 0.18
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.2
112 0.19
113 0.19
114 0.2
115 0.15
116 0.15
117 0.16
118 0.19
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.15
123 0.19
124 0.2
125 0.24
126 0.28
127 0.37
128 0.44
129 0.52
130 0.58
131 0.61
132 0.62
133 0.6
134 0.55
135 0.54
136 0.55
137 0.52
138 0.49
139 0.46
140 0.46
141 0.5
142 0.52
143 0.46
144 0.46
145 0.44
146 0.45
147 0.45
148 0.42
149 0.36
150 0.33
151 0.3
152 0.23
153 0.18
154 0.14
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.02
172 0.02
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.19
184 0.25
185 0.34
186 0.4
187 0.46
188 0.44
189 0.46
190 0.45
191 0.42
192 0.39
193 0.32
194 0.27
195 0.22
196 0.21
197 0.19
198 0.17
199 0.14
200 0.11
201 0.09
202 0.11
203 0.13
204 0.17
205 0.18
206 0.19
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.19
211 0.19
212 0.17
213 0.18
214 0.19
215 0.2
216 0.22
217 0.21
218 0.19
219 0.19
220 0.21
221 0.21
222 0.21
223 0.24
224 0.22
225 0.22
226 0.24
227 0.24
228 0.22
229 0.21
230 0.22
231 0.21
232 0.21
233 0.21
234 0.18
235 0.16
236 0.16
237 0.13
238 0.12
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.1
247 0.13
248 0.14
249 0.15
250 0.19
251 0.24
252 0.26
253 0.27
254 0.25
255 0.23
256 0.24
257 0.21
258 0.17
259 0.12
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.22
329 0.25
330 0.26
331 0.33
332 0.4
333 0.45
334 0.53
335 0.6
336 0.56
337 0.56
338 0.56
339 0.53
340 0.49
341 0.43
342 0.33
343 0.23
344 0.18
345 0.14
346 0.12
347 0.07
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.11
372 0.09
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.13
384 0.14
385 0.17
386 0.21
387 0.22
388 0.23
389 0.28
390 0.31
391 0.32
392 0.34
393 0.31
394 0.29
395 0.28
396 0.28
397 0.25
398 0.23
399 0.19
400 0.15
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.1
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.09
420 0.12
421 0.15
422 0.18
423 0.23
424 0.23
425 0.27
426 0.27
427 0.27
428 0.25
429 0.23
430 0.2
431 0.15
432 0.14
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.09
439 0.1
440 0.13
441 0.22
442 0.31
443 0.41
444 0.5
445 0.57
446 0.62
447 0.63
448 0.67
449 0.66
450 0.67
451 0.61
452 0.62
453 0.57
454 0.51
455 0.52
456 0.46
457 0.39
458 0.32
459 0.31
460 0.27
461 0.25
462 0.27
463 0.26
464 0.25
465 0.25
466 0.23
467 0.2
468 0.17
469 0.21
470 0.2
471 0.24
472 0.26
473 0.28
474 0.32
475 0.32
476 0.35
477 0.36
478 0.38
479 0.35
480 0.33
481 0.33
482 0.31
483 0.3
484 0.25
485 0.2
486 0.14
487 0.12
488 0.11
489 0.09
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.11
500 0.11
501 0.12
502 0.14
503 0.15
504 0.14
505 0.14
506 0.16
507 0.15
508 0.16
509 0.15
510 0.13
511 0.12
512 0.11
513 0.1
514 0.1