Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XVP1

Protein Details
Accession C4XVP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-59IKQHGRRLDHEERKRKREAREBasic
165-184IKTGKSKHKSWKRMITKHTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-102RRLDHEERKRKREAREGHRVAKDAQNLKGWRGKQFAKKRYSEKVAMKKKIKAHQESKVK
169-174KSKHKS
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 9.166, cyto 7, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG clu:CLUG_00064  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MYGCIYPDEAHFFTVSFFLSTSYHQQTKMPQNEYIEQHIKQHGRRLDHEERKRKREAREGHRVAKDAQNLKGWRGKQFAKKRYSEKVAMKKKIKAHQESKVKGPSTPKQDDGEALPTYLLDRQTNNTAKAISSSIKQKRMEKADKFSVPLPKVRGISEEEMFKVIKTGKSKHKSWKRMITKHTFVGEGFTRRPVKMERIIRPSALRQKKANVTHPELGVTVFLPILGVKKNPQSPMYTQLGVLTKGTIIEVNVSELGLVTAGGKVVWGKYAQITNEPDRDGCVNAVLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.14
8 0.2
9 0.27
10 0.28
11 0.29
12 0.32
13 0.39
14 0.48
15 0.54
16 0.51
17 0.47
18 0.5
19 0.55
20 0.56
21 0.55
22 0.5
23 0.42
24 0.43
25 0.47
26 0.48
27 0.44
28 0.49
29 0.46
30 0.47
31 0.51
32 0.56
33 0.59
34 0.64
35 0.71
36 0.74
37 0.77
38 0.78
39 0.83
40 0.81
41 0.78
42 0.77
43 0.77
44 0.76
45 0.78
46 0.79
47 0.78
48 0.75
49 0.69
50 0.62
51 0.58
52 0.56
53 0.49
54 0.44
55 0.43
56 0.4
57 0.42
58 0.45
59 0.41
60 0.39
61 0.4
62 0.44
63 0.46
64 0.55
65 0.61
66 0.63
67 0.68
68 0.69
69 0.72
70 0.72
71 0.7
72 0.69
73 0.71
74 0.73
75 0.75
76 0.74
77 0.72
78 0.72
79 0.71
80 0.71
81 0.7
82 0.67
83 0.67
84 0.71
85 0.68
86 0.67
87 0.66
88 0.58
89 0.51
90 0.51
91 0.48
92 0.47
93 0.48
94 0.44
95 0.39
96 0.39
97 0.37
98 0.32
99 0.3
100 0.21
101 0.18
102 0.14
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.12
107 0.09
108 0.1
109 0.12
110 0.19
111 0.22
112 0.23
113 0.22
114 0.21
115 0.2
116 0.2
117 0.19
118 0.13
119 0.13
120 0.21
121 0.25
122 0.32
123 0.35
124 0.39
125 0.44
126 0.52
127 0.58
128 0.53
129 0.54
130 0.54
131 0.52
132 0.49
133 0.46
134 0.44
135 0.36
136 0.35
137 0.32
138 0.28
139 0.28
140 0.27
141 0.26
142 0.22
143 0.24
144 0.22
145 0.2
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.14
150 0.13
151 0.12
152 0.14
153 0.17
154 0.23
155 0.32
156 0.38
157 0.44
158 0.53
159 0.61
160 0.67
161 0.71
162 0.76
163 0.76
164 0.78
165 0.81
166 0.79
167 0.74
168 0.69
169 0.61
170 0.51
171 0.41
172 0.37
173 0.32
174 0.26
175 0.23
176 0.25
177 0.26
178 0.25
179 0.28
180 0.27
181 0.3
182 0.35
183 0.43
184 0.44
185 0.49
186 0.51
187 0.5
188 0.49
189 0.51
190 0.53
191 0.53
192 0.5
193 0.46
194 0.51
195 0.58
196 0.62
197 0.64
198 0.61
199 0.6
200 0.59
201 0.56
202 0.5
203 0.42
204 0.35
205 0.26
206 0.18
207 0.11
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.12
216 0.19
217 0.24
218 0.28
219 0.3
220 0.33
221 0.35
222 0.4
223 0.42
224 0.36
225 0.31
226 0.33
227 0.32
228 0.28
229 0.25
230 0.19
231 0.14
232 0.13
233 0.14
234 0.1
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.06
245 0.06
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.15
257 0.2
258 0.21
259 0.27
260 0.33
261 0.37
262 0.4
263 0.41
264 0.36
265 0.35
266 0.35
267 0.3
268 0.25
269 0.21