Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y6J8

Protein Details
Accession C4Y6J8    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-85KGTKRSASKSEKSKSFKKAKTTPQPLPESDHydrophilic
192-211WEKLRVKKPAPPKQVRDKLCHydrophilic
529-548AYAKTSKKPQDQRRSELQSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-73RSASKSEKSKSFKK
170-204KLLAERKMKRKSGAEVERIKSLWEKLRVKKPAPPK
Subcellular Location(s) cyto 10, cyto_nucl 9, nucl 6, mito 4, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0017148  P:negative regulation of translation  
GO:0065008  P:regulation of biological quality  
KEGG clu:CLUG_03781  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MTLFEISTSFYPSFRLPAHMLIRLVHKPSMCARDLIASNSFLVFVGKFISTSTMVKGTKRSASKSEKSKSFKKAKTTPQPLPESDSASENDVTIYESAEEGSDLSSDISDSSEDELDKLDEEEEEEEDELDISEKSDDSSDEESMEEKDGESAADPNKKTSAEQHAEQRKLLAERKMKRKSGAEVERIKSLWEKLRVKKPAPPKQVRDKLCDEIWELSNDVIYDLVLKHDASRVVQTLVKYSSKERRDLIVQSLKGNYYKLATSSYGKYLLVKLLHYGSKDSRALIVNELHGKLRKLMRHKEGAYVVEDLFVLYSTAEQKQQMIREFWGAEYAVFKDSGKGKTVLDIVNESAEKRQLIIANLSGTITASVAKGSTGFQILHAAIKEYVSILVDDTEKNDSQIRELIELLAEQFAELVHTQEGSEVACTLIALANAKERKSIIKSLKAHGKELIKNEYGNSVLITLFMTVDDTVLLHKSFSTELFTPDLLPELIQEKFSRRPLLYLLKGLDGKYFAPKNKEDFAKYEQLAYAKTSKKPQDQRRSELQSKALPLIYRSILSTIDPESNPTFTKLLSVNIAAQFVTELTLTPSEDDEINNELRPQLVSAFFDLTFKGDILEDYHLLNKTPFVSRSLKALIQGNEFKWDNESKKLVFVEGKEIPSVGTDFARKCADKLMEDGVLKNWVSGQGAFVVLAIFEVLSISDASKAKTLSKNLKKLKSDMVKDKDNKGAQLLVKAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.24
4 0.32
5 0.36
6 0.38
7 0.38
8 0.36
9 0.41
10 0.41
11 0.42
12 0.38
13 0.33
14 0.33
15 0.39
16 0.43
17 0.38
18 0.34
19 0.32
20 0.35
21 0.37
22 0.37
23 0.32
24 0.26
25 0.25
26 0.24
27 0.23
28 0.16
29 0.15
30 0.11
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.13
37 0.14
38 0.15
39 0.18
40 0.23
41 0.25
42 0.27
43 0.32
44 0.34
45 0.4
46 0.44
47 0.47
48 0.49
49 0.57
50 0.63
51 0.68
52 0.72
53 0.74
54 0.76
55 0.79
56 0.8
57 0.81
58 0.79
59 0.79
60 0.79
61 0.8
62 0.84
63 0.85
64 0.83
65 0.81
66 0.81
67 0.73
68 0.71
69 0.62
70 0.56
71 0.48
72 0.42
73 0.34
74 0.3
75 0.28
76 0.21
77 0.19
78 0.14
79 0.14
80 0.11
81 0.11
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.06
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.1
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.12
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.12
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.12
140 0.15
141 0.21
142 0.22
143 0.23
144 0.26
145 0.26
146 0.27
147 0.3
148 0.35
149 0.33
150 0.37
151 0.45
152 0.51
153 0.53
154 0.52
155 0.47
156 0.4
157 0.4
158 0.42
159 0.41
160 0.41
161 0.48
162 0.58
163 0.65
164 0.66
165 0.66
166 0.65
167 0.64
168 0.66
169 0.66
170 0.64
171 0.64
172 0.62
173 0.59
174 0.54
175 0.48
176 0.4
177 0.36
178 0.34
179 0.35
180 0.42
181 0.47
182 0.56
183 0.63
184 0.63
185 0.65
186 0.69
187 0.7
188 0.73
189 0.74
190 0.72
191 0.76
192 0.83
193 0.8
194 0.76
195 0.71
196 0.65
197 0.56
198 0.5
199 0.41
200 0.36
201 0.33
202 0.27
203 0.22
204 0.17
205 0.16
206 0.14
207 0.11
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.13
220 0.14
221 0.15
222 0.17
223 0.17
224 0.18
225 0.2
226 0.21
227 0.2
228 0.25
229 0.32
230 0.33
231 0.37
232 0.35
233 0.35
234 0.37
235 0.39
236 0.41
237 0.4
238 0.38
239 0.36
240 0.36
241 0.33
242 0.3
243 0.28
244 0.2
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.16
251 0.18
252 0.19
253 0.19
254 0.18
255 0.19
256 0.17
257 0.19
258 0.17
259 0.15
260 0.14
261 0.16
262 0.18
263 0.17
264 0.19
265 0.17
266 0.21
267 0.22
268 0.2
269 0.2
270 0.2
271 0.21
272 0.21
273 0.2
274 0.17
275 0.19
276 0.2
277 0.19
278 0.19
279 0.18
280 0.2
281 0.23
282 0.26
283 0.31
284 0.39
285 0.43
286 0.49
287 0.5
288 0.5
289 0.48
290 0.45
291 0.38
292 0.32
293 0.26
294 0.18
295 0.17
296 0.12
297 0.09
298 0.07
299 0.05
300 0.03
301 0.04
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.09
306 0.11
307 0.13
308 0.17
309 0.19
310 0.19
311 0.19
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.17
316 0.13
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.14
325 0.15
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.18
330 0.21
331 0.19
332 0.16
333 0.15
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.11
338 0.09
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.09
351 0.07
352 0.06
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.1
383 0.09
384 0.1
385 0.13
386 0.12
387 0.13
388 0.16
389 0.15
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.03
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.11
421 0.13
422 0.13
423 0.14
424 0.14
425 0.18
426 0.21
427 0.29
428 0.29
429 0.36
430 0.4
431 0.44
432 0.52
433 0.5
434 0.48
435 0.45
436 0.45
437 0.4
438 0.41
439 0.41
440 0.34
441 0.32
442 0.31
443 0.28
444 0.22
445 0.19
446 0.14
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.11
468 0.11
469 0.13
470 0.15
471 0.15
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.1
476 0.09
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.11
482 0.14
483 0.19
484 0.23
485 0.27
486 0.25
487 0.26
488 0.3
489 0.38
490 0.36
491 0.35
492 0.33
493 0.31
494 0.33
495 0.31
496 0.27
497 0.2
498 0.18
499 0.21
500 0.24
501 0.24
502 0.28
503 0.31
504 0.34
505 0.4
506 0.43
507 0.38
508 0.39
509 0.41
510 0.44
511 0.41
512 0.38
513 0.33
514 0.3
515 0.28
516 0.26
517 0.28
518 0.25
519 0.28
520 0.35
521 0.4
522 0.49
523 0.58
524 0.66
525 0.7
526 0.74
527 0.77
528 0.79
529 0.81
530 0.77
531 0.72
532 0.66
533 0.59
534 0.53
535 0.49
536 0.41
537 0.32
538 0.28
539 0.27
540 0.23
541 0.19
542 0.17
543 0.16
544 0.14
545 0.14
546 0.15
547 0.13
548 0.16
549 0.15
550 0.18
551 0.19
552 0.2
553 0.2
554 0.21
555 0.19
556 0.15
557 0.19
558 0.16
559 0.17
560 0.17
561 0.17
562 0.18
563 0.19
564 0.2
565 0.16
566 0.15
567 0.13
568 0.11
569 0.1
570 0.06
571 0.05
572 0.07
573 0.08
574 0.09
575 0.09
576 0.1
577 0.1
578 0.11
579 0.11
580 0.11
581 0.14
582 0.15
583 0.15
584 0.14
585 0.13
586 0.13
587 0.14
588 0.12
589 0.11
590 0.12
591 0.13
592 0.14
593 0.16
594 0.16
595 0.16
596 0.15
597 0.14
598 0.13
599 0.12
600 0.11
601 0.09
602 0.09
603 0.11
604 0.14
605 0.13
606 0.13
607 0.17
608 0.17
609 0.18
610 0.17
611 0.17
612 0.17
613 0.21
614 0.21
615 0.22
616 0.27
617 0.27
618 0.32
619 0.35
620 0.33
621 0.33
622 0.38
623 0.36
624 0.38
625 0.42
626 0.37
627 0.4
628 0.39
629 0.36
630 0.34
631 0.38
632 0.34
633 0.35
634 0.39
635 0.33
636 0.38
637 0.38
638 0.37
639 0.34
640 0.32
641 0.34
642 0.34
643 0.34
644 0.29
645 0.29
646 0.25
647 0.23
648 0.22
649 0.16
650 0.13
651 0.17
652 0.18
653 0.22
654 0.28
655 0.27
656 0.27
657 0.33
658 0.35
659 0.31
660 0.34
661 0.34
662 0.33
663 0.34
664 0.34
665 0.28
666 0.28
667 0.26
668 0.23
669 0.2
670 0.16
671 0.17
672 0.16
673 0.15
674 0.13
675 0.13
676 0.13
677 0.12
678 0.1
679 0.08
680 0.07
681 0.06
682 0.04
683 0.03
684 0.04
685 0.04
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.11
690 0.12
691 0.14
692 0.17
693 0.19
694 0.25
695 0.31
696 0.4
697 0.46
698 0.55
699 0.64
700 0.71
701 0.79
702 0.77
703 0.76
704 0.77
705 0.76
706 0.76
707 0.76
708 0.74
709 0.75
710 0.75
711 0.76
712 0.75
713 0.68
714 0.61
715 0.54
716 0.53
717 0.45