Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4YA40

Protein Details
Accession C4YA40    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-214GLTVPKHTPKIQKKNKKVSALKKLKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-211PKIQKKNKKVSALKK
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 11.333, cyto 6, cyto_nucl 5.333, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029028  Alpha/beta_knot_MTases  
IPR003750  Put_MeTrfase  
IPR029026  tRNA_m1G_MTases_N  
KEGG clu:CLUG_04978  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02598  Methyltrn_RNA_3  
Amino Acid Sequences MAKPKTEETAKATRKPAKIQSSTKVALCVPSSVISKSNARNLEQITNIAYQIAKAASVYNVSEIVVLDIPTADEIQKKLEAEANKAVQLEGDKGNKKIKFNISNEEIVAEAKSEEGPAAEKLVEKEENENNALLLATLLQFFVTPPYLVKGVFRASKYNKKFKYAEKLPKLSNLPFMNNNGVIEDFKEGLTVPKHTPKIQKKNKKVSALKKLKVTKYVNVGQSSLLELNGTEVPVNVRVTVDVKNKKIVSPQEAYGVTGSKASFGYFVRYAKSFSSIFTESSFPSGYTESVFVQADDFFGKAKDSKLDTVDKVGKGEVLFVVSNLKDLEYSFSQEKIPGVEQVTEMFDSQVKVPPGLRIEDAALVALAKAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.7
3 0.73
4 0.72
5 0.74
6 0.74
7 0.73
8 0.73
9 0.7
10 0.63
11 0.56
12 0.47
13 0.41
14 0.35
15 0.29
16 0.22
17 0.23
18 0.23
19 0.22
20 0.24
21 0.23
22 0.29
23 0.32
24 0.38
25 0.38
26 0.38
27 0.42
28 0.44
29 0.45
30 0.4
31 0.37
32 0.32
33 0.3
34 0.27
35 0.23
36 0.19
37 0.13
38 0.14
39 0.12
40 0.09
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.09
61 0.09
62 0.12
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.2
67 0.21
68 0.24
69 0.3
70 0.29
71 0.28
72 0.28
73 0.27
74 0.23
75 0.22
76 0.2
77 0.18
78 0.24
79 0.24
80 0.28
81 0.35
82 0.38
83 0.39
84 0.43
85 0.48
86 0.5
87 0.51
88 0.56
89 0.53
90 0.51
91 0.49
92 0.42
93 0.32
94 0.23
95 0.2
96 0.12
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.07
104 0.06
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.13
110 0.15
111 0.14
112 0.19
113 0.21
114 0.23
115 0.23
116 0.23
117 0.18
118 0.17
119 0.16
120 0.11
121 0.07
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.13
139 0.17
140 0.18
141 0.23
142 0.29
143 0.39
144 0.45
145 0.53
146 0.51
147 0.54
148 0.57
149 0.57
150 0.61
151 0.61
152 0.65
153 0.63
154 0.65
155 0.6
156 0.61
157 0.58
158 0.48
159 0.46
160 0.37
161 0.31
162 0.28
163 0.29
164 0.26
165 0.23
166 0.21
167 0.14
168 0.13
169 0.11
170 0.09
171 0.09
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.12
180 0.18
181 0.21
182 0.25
183 0.34
184 0.42
185 0.53
186 0.61
187 0.69
188 0.73
189 0.82
190 0.85
191 0.86
192 0.84
193 0.83
194 0.83
195 0.83
196 0.76
197 0.74
198 0.73
199 0.66
200 0.67
201 0.6
202 0.53
203 0.5
204 0.52
205 0.48
206 0.42
207 0.4
208 0.31
209 0.28
210 0.26
211 0.19
212 0.12
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.09
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.16
228 0.24
229 0.28
230 0.29
231 0.35
232 0.36
233 0.36
234 0.41
235 0.4
236 0.38
237 0.35
238 0.34
239 0.34
240 0.33
241 0.33
242 0.27
243 0.23
244 0.17
245 0.16
246 0.14
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.15
253 0.16
254 0.17
255 0.18
256 0.19
257 0.21
258 0.2
259 0.23
260 0.18
261 0.16
262 0.21
263 0.2
264 0.2
265 0.21
266 0.22
267 0.18
268 0.2
269 0.2
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.12
277 0.14
278 0.14
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.07
286 0.08
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.17
291 0.2
292 0.23
293 0.27
294 0.33
295 0.32
296 0.39
297 0.43
298 0.39
299 0.36
300 0.33
301 0.31
302 0.25
303 0.25
304 0.18
305 0.14
306 0.13
307 0.12
308 0.16
309 0.13
310 0.15
311 0.14
312 0.13
313 0.11
314 0.11
315 0.17
316 0.15
317 0.2
318 0.2
319 0.21
320 0.22
321 0.23
322 0.24
323 0.22
324 0.22
325 0.21
326 0.21
327 0.21
328 0.21
329 0.21
330 0.23
331 0.2
332 0.19
333 0.16
334 0.15
335 0.15
336 0.16
337 0.21
338 0.2
339 0.21
340 0.22
341 0.26
342 0.28
343 0.29
344 0.29
345 0.24
346 0.25
347 0.25
348 0.24
349 0.19
350 0.15
351 0.12