Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y2K4

Protein Details
Accession C4Y2K4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-56YVMSHERRKKAAKRKSDKLQQWAEQEHydrophilic
729-750QINFEGKIRRKDYKKYVMERGYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-46RRKKAAKRKS
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 11.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG clu:CLUG_02767  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MFIGKKAPAALRKQLWPVFPTYNILGSRNIYVMSHERRKKAAKRKSDKLQQWAEQEEMRLAREKNQQYAKKLKELKQLTRSVASYVRTREARELEAQKIQELSLPSELGKGSEPAGLAAPRSAKIAPFDASAASLSTSAVPLPQSIQDRLGLAVKYLVSKDHQNWSIVLQQLEAAGGFDGLPQKDIRKMVYAIPKDQLRHVFPQIESLLGQAGLAVSPKLLNTYIKSLMLGRTLNDAQIAYIEGIVAKLRQEPGKEGKLGKLSRATYELLIEAYGKNTNVAKMNEVIQEMKELGLQLSPVVYTNVLSTCVYKTRDHQQAVKLFDSMKFLAGSMAPQTREYQDIIVSYVNNDDIEKALDLYQEMLDQKLDFNQNIMVALARGCMSREQLRFKAWDFIFEIYRCGWEPTANTLEYMLYLASKDGDLALARALYQQLNISNALSPRAFSFLFLAYARSNVGKSIEEFQPFAITVHEEGRNFRRNILEKVDLTPTTENPKQAVPYLPKISLSTPQEVLAESSAVMAHALMVNREFVNVESVTTFLNVAARMGSLDDFIDRYEEFTFLDKTGVTETKTVIEPEILESTSVLLAPKEPSPTKSPILAQVTESQKSAFKMPRNTITYLIALKAAAKHKNYIFAQKVWTERGTYRKSAGFRNLPKSEKEKLDFSFASGMVNCLTDMKLLDDALAILVSTEYQFKWTWKELSHLYAAAAEAGYDKVTKTIRGVVKRAQINFEGKIRRKDYKKYVMERGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.59
3 0.54
4 0.53
5 0.48
6 0.44
7 0.42
8 0.36
9 0.37
10 0.34
11 0.34
12 0.31
13 0.28
14 0.29
15 0.25
16 0.24
17 0.18
18 0.2
19 0.27
20 0.33
21 0.42
22 0.47
23 0.5
24 0.57
25 0.67
26 0.72
27 0.75
28 0.75
29 0.77
30 0.8
31 0.86
32 0.89
33 0.9
34 0.89
35 0.88
36 0.87
37 0.82
38 0.79
39 0.72
40 0.64
41 0.56
42 0.48
43 0.43
44 0.35
45 0.3
46 0.29
47 0.27
48 0.31
49 0.39
50 0.42
51 0.46
52 0.55
53 0.6
54 0.62
55 0.71
56 0.69
57 0.69
58 0.74
59 0.72
60 0.73
61 0.75
62 0.77
63 0.76
64 0.77
65 0.72
66 0.68
67 0.61
68 0.54
69 0.5
70 0.43
71 0.4
72 0.38
73 0.4
74 0.37
75 0.39
76 0.42
77 0.41
78 0.42
79 0.44
80 0.45
81 0.42
82 0.46
83 0.43
84 0.38
85 0.35
86 0.31
87 0.26
88 0.23
89 0.22
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.16
96 0.15
97 0.13
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.14
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.17
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.18
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.13
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.14
131 0.17
132 0.18
133 0.2
134 0.2
135 0.2
136 0.21
137 0.23
138 0.18
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.19
147 0.23
148 0.29
149 0.31
150 0.31
151 0.31
152 0.32
153 0.35
154 0.32
155 0.28
156 0.2
157 0.18
158 0.17
159 0.16
160 0.13
161 0.08
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.17
172 0.19
173 0.19
174 0.2
175 0.22
176 0.27
177 0.36
178 0.37
179 0.36
180 0.4
181 0.42
182 0.39
183 0.42
184 0.41
185 0.36
186 0.38
187 0.39
188 0.38
189 0.34
190 0.39
191 0.34
192 0.29
193 0.25
194 0.2
195 0.17
196 0.12
197 0.11
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.09
209 0.11
210 0.16
211 0.17
212 0.17
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.2
217 0.18
218 0.14
219 0.18
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.15
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.07
236 0.1
237 0.12
238 0.14
239 0.19
240 0.25
241 0.29
242 0.32
243 0.31
244 0.32
245 0.38
246 0.38
247 0.36
248 0.35
249 0.32
250 0.3
251 0.32
252 0.29
253 0.21
254 0.21
255 0.19
256 0.12
257 0.11
258 0.1
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.12
266 0.16
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.18
274 0.13
275 0.14
276 0.12
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.14
297 0.16
298 0.17
299 0.2
300 0.27
301 0.35
302 0.36
303 0.39
304 0.41
305 0.44
306 0.47
307 0.44
308 0.36
309 0.29
310 0.28
311 0.27
312 0.21
313 0.16
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.12
328 0.11
329 0.1
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.09
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.06
370 0.08
371 0.14
372 0.17
373 0.22
374 0.24
375 0.26
376 0.27
377 0.27
378 0.33
379 0.27
380 0.27
381 0.24
382 0.23
383 0.24
384 0.23
385 0.23
386 0.14
387 0.15
388 0.13
389 0.12
390 0.11
391 0.09
392 0.1
393 0.13
394 0.16
395 0.15
396 0.14
397 0.14
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.07
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.1
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.12
431 0.11
432 0.1
433 0.11
434 0.1
435 0.12
436 0.12
437 0.13
438 0.1
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.1
445 0.09
446 0.1
447 0.15
448 0.17
449 0.18
450 0.18
451 0.17
452 0.17
453 0.16
454 0.15
455 0.11
456 0.09
457 0.09
458 0.12
459 0.14
460 0.13
461 0.16
462 0.22
463 0.3
464 0.29
465 0.3
466 0.34
467 0.35
468 0.39
469 0.42
470 0.4
471 0.34
472 0.36
473 0.37
474 0.3
475 0.29
476 0.26
477 0.22
478 0.24
479 0.25
480 0.24
481 0.21
482 0.23
483 0.21
484 0.22
485 0.27
486 0.24
487 0.29
488 0.31
489 0.31
490 0.3
491 0.3
492 0.3
493 0.3
494 0.29
495 0.25
496 0.23
497 0.23
498 0.23
499 0.21
500 0.21
501 0.14
502 0.11
503 0.08
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.09
518 0.07
519 0.11
520 0.1
521 0.1
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.06
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.07
541 0.08
542 0.07
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.1
547 0.12
548 0.13
549 0.12
550 0.13
551 0.11
552 0.11
553 0.15
554 0.16
555 0.15
556 0.15
557 0.15
558 0.17
559 0.18
560 0.18
561 0.15
562 0.14
563 0.13
564 0.14
565 0.15
566 0.13
567 0.12
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.1
572 0.08
573 0.06
574 0.08
575 0.1
576 0.12
577 0.17
578 0.18
579 0.22
580 0.27
581 0.32
582 0.33
583 0.34
584 0.34
585 0.36
586 0.4
587 0.37
588 0.34
589 0.36
590 0.39
591 0.36
592 0.35
593 0.28
594 0.26
595 0.26
596 0.31
597 0.3
598 0.32
599 0.39
600 0.45
601 0.53
602 0.55
603 0.55
604 0.51
605 0.47
606 0.43
607 0.36
608 0.31
609 0.22
610 0.18
611 0.17
612 0.2
613 0.23
614 0.27
615 0.27
616 0.33
617 0.33
618 0.42
619 0.43
620 0.47
621 0.46
622 0.42
623 0.45
624 0.44
625 0.46
626 0.41
627 0.41
628 0.35
629 0.35
630 0.41
631 0.42
632 0.41
633 0.42
634 0.43
635 0.45
636 0.49
637 0.54
638 0.54
639 0.57
640 0.63
641 0.66
642 0.64
643 0.66
644 0.65
645 0.63
646 0.61
647 0.57
648 0.53
649 0.48
650 0.53
651 0.47
652 0.44
653 0.41
654 0.32
655 0.31
656 0.25
657 0.24
658 0.16
659 0.17
660 0.14
661 0.11
662 0.11
663 0.09
664 0.1
665 0.11
666 0.12
667 0.12
668 0.12
669 0.11
670 0.1
671 0.1
672 0.09
673 0.06
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.07
679 0.07
680 0.1
681 0.12
682 0.14
683 0.21
684 0.26
685 0.3
686 0.3
687 0.36
688 0.37
689 0.41
690 0.42
691 0.36
692 0.31
693 0.27
694 0.25
695 0.2
696 0.16
697 0.11
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.08
702 0.08
703 0.12
704 0.14
705 0.16
706 0.17
707 0.26
708 0.33
709 0.4
710 0.45
711 0.48
712 0.55
713 0.6
714 0.61
715 0.57
716 0.55
717 0.53
718 0.52
719 0.52
720 0.54
721 0.54
722 0.61
723 0.62
724 0.66
725 0.68
726 0.74
727 0.77
728 0.77
729 0.81
730 0.79