Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4YBE9

Protein Details
Accession C4YBE9    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-202AGGSNRTKAKRRRKVKDEDDEDFGAPKKKARPQAKPKAKKATPEBasic
280-299SDEEKPKTVPKKKSIPTIQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-175RTKAKRRRKVKD
181-207FGAPKKKARPQAKPKAKKATPEPAKKQ
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013760  Topo_IIA-like_dom_sf  
IPR013757  Topo_IIA_A_a_sf  
IPR002205  Topo_IIA_dom_A  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003918  F:DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
KEGG clu:CLUG_05527  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00521  DNA_topoisoIV  
Amino Acid Sequences MIIDKKMSVSNKKRAVLVQLLLENKFARFDKKGRIVKEAEDDPNSLFVAEELLQEEEENVGDVSRLNSRGVNDLEQHENEHVPENIYSHYDYLLGMSLWSLTHERYQKLLQQKGEKEEELNTLLRKSAKDLWNEDLDEFLASWQKFLQDDEAERSQLVAGGSNRTKAKRRRKVKDEDDEDFGAPKKKARPQAKPKAKKATPEPAKKQTKLPFVKTESPTEGESSKNETPVAVESSTPADNLPTFFKKAPATKPKKPSTKSFFDSSDDEGNSTPTIVVGSSDEEKPKTVPKKKSIPTIQDELDDLVIVKENTPGRRRQRVNYSIEGSDEDEESSYEESD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.57
4 0.5
5 0.46
6 0.42
7 0.43
8 0.4
9 0.39
10 0.33
11 0.26
12 0.28
13 0.24
14 0.24
15 0.27
16 0.32
17 0.4
18 0.5
19 0.56
20 0.55
21 0.61
22 0.58
23 0.57
24 0.59
25 0.55
26 0.5
27 0.46
28 0.43
29 0.37
30 0.36
31 0.31
32 0.23
33 0.16
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.06
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.08
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.15
55 0.16
56 0.22
57 0.23
58 0.25
59 0.24
60 0.26
61 0.29
62 0.28
63 0.28
64 0.24
65 0.23
66 0.21
67 0.21
68 0.18
69 0.15
70 0.15
71 0.14
72 0.13
73 0.15
74 0.15
75 0.12
76 0.12
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.13
90 0.17
91 0.18
92 0.21
93 0.24
94 0.28
95 0.36
96 0.4
97 0.4
98 0.45
99 0.47
100 0.5
101 0.52
102 0.46
103 0.39
104 0.35
105 0.32
106 0.26
107 0.24
108 0.19
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.16
113 0.18
114 0.23
115 0.26
116 0.3
117 0.33
118 0.34
119 0.36
120 0.36
121 0.32
122 0.24
123 0.2
124 0.15
125 0.12
126 0.09
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.14
135 0.11
136 0.12
137 0.17
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.16
142 0.13
143 0.13
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.13
148 0.14
149 0.17
150 0.19
151 0.2
152 0.28
153 0.35
154 0.46
155 0.51
156 0.61
157 0.68
158 0.75
159 0.83
160 0.85
161 0.86
162 0.81
163 0.73
164 0.67
165 0.58
166 0.5
167 0.4
168 0.32
169 0.25
170 0.19
171 0.19
172 0.21
173 0.26
174 0.35
175 0.43
176 0.52
177 0.59
178 0.71
179 0.78
180 0.82
181 0.85
182 0.86
183 0.8
184 0.76
185 0.72
186 0.72
187 0.7
188 0.7
189 0.7
190 0.69
191 0.75
192 0.7
193 0.71
194 0.67
195 0.67
196 0.64
197 0.62
198 0.59
199 0.57
200 0.64
201 0.59
202 0.56
203 0.48
204 0.44
205 0.39
206 0.33
207 0.28
208 0.21
209 0.2
210 0.23
211 0.21
212 0.2
213 0.19
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.19
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.11
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.15
229 0.15
230 0.19
231 0.19
232 0.23
233 0.27
234 0.33
235 0.41
236 0.47
237 0.53
238 0.59
239 0.69
240 0.75
241 0.8
242 0.78
243 0.79
244 0.75
245 0.76
246 0.71
247 0.66
248 0.59
249 0.53
250 0.52
251 0.45
252 0.43
253 0.34
254 0.3
255 0.25
256 0.24
257 0.2
258 0.17
259 0.13
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.06
265 0.09
266 0.12
267 0.15
268 0.17
269 0.18
270 0.19
271 0.21
272 0.29
273 0.36
274 0.43
275 0.5
276 0.56
277 0.66
278 0.71
279 0.8
280 0.8
281 0.79
282 0.76
283 0.73
284 0.66
285 0.57
286 0.52
287 0.42
288 0.33
289 0.24
290 0.18
291 0.11
292 0.13
293 0.11
294 0.1
295 0.14
296 0.19
297 0.27
298 0.31
299 0.4
300 0.47
301 0.57
302 0.63
303 0.67
304 0.73
305 0.75
306 0.77
307 0.76
308 0.72
309 0.62
310 0.58
311 0.51
312 0.42
313 0.35
314 0.28
315 0.2
316 0.15
317 0.14
318 0.14