Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y428

Protein Details
Accession C4Y428    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-100SLSMHETSKSRKQKHKKKKSKQKQKNVELSAKEAHydrophilic
166-188QKFLRKRASKETHPSNKKHKSVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-91KSRKQKHKKKKSKQKQK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG clu:CLUG_02400  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09194  PLDc_yTdp1_1  
cd09196  PLDc_yTdp1_2  
Amino Acid Sequences MTRRSKRIARTDEVRNFRMNSEPIDLDSDLEVVDVDADPKELKSDTLLPETIPDIGNDNDEKENLDSLSMHETSKSRKQKHKKKKSKQKQKNVELSAKEASILSSVMKIAKKSPSTETKAKETLVQEESSPKPDVSGTEEGRDDAAHNGSDEEISIIQVVEVPSEQKFLRKRASKETHPSNKKHKSVEEEATNDTSTENALSEEEATSHTDTENELSEEESYGNTKISPQIDVNELSFESKKLPSVIEVESSSEDEMVEPPTSQPVSSTPKSSIRLLYNSSYKLTDELTDTDVNVDTVTVHDLVGAPDLLETFQFNFNVDLEYFLTFLHPNFAKNKRKIVFVTGTAYLAGHPLREIIKAKYNISECIAPLPNRFASHHSKMMINFYPHDQVEIIIMTCNLTQLDFGGLTQSVWRSGKLKRGKTTAKLGSRFKQDLERYLLKYKMATIEKVVQRLRDYNYNSVGVELVASAPGTYSIDHIDENDETYGYGKLRQVLQRNDLLIKDTEKHHNILAQVTSIAYPYSSRKGDTASILSHLLCPLMFSHWKKHLEPGTQSTSKHQEEFKYKPQLVFPTVKEVASSNFGFLSGSAVHFKHSGSLIHQKQYEQNVKPYLCKWSTPENVTGRERVTPHVKYYACDNGDGWNTLKWVLVGSHNLSKQAWGYPEAKSKGQTFDVASYELSVLVPGSGKNLVPVFKKDVSSDTITIPVRFPFKLPPTRYGENDLPWSAGSDYGKLKDRWGNLHNGGYSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.67
3 0.61
4 0.54
5 0.54
6 0.46
7 0.4
8 0.38
9 0.35
10 0.31
11 0.34
12 0.32
13 0.26
14 0.24
15 0.2
16 0.14
17 0.13
18 0.11
19 0.06
20 0.07
21 0.06
22 0.07
23 0.06
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.14
31 0.21
32 0.24
33 0.28
34 0.29
35 0.26
36 0.28
37 0.28
38 0.26
39 0.2
40 0.16
41 0.15
42 0.15
43 0.18
44 0.18
45 0.2
46 0.19
47 0.19
48 0.21
49 0.19
50 0.2
51 0.16
52 0.16
53 0.14
54 0.14
55 0.19
56 0.18
57 0.17
58 0.18
59 0.21
60 0.26
61 0.36
62 0.45
63 0.48
64 0.58
65 0.7
66 0.78
67 0.87
68 0.91
69 0.93
70 0.94
71 0.96
72 0.97
73 0.97
74 0.97
75 0.97
76 0.97
77 0.96
78 0.95
79 0.92
80 0.89
81 0.8
82 0.74
83 0.65
84 0.54
85 0.44
86 0.33
87 0.25
88 0.17
89 0.15
90 0.11
91 0.09
92 0.1
93 0.14
94 0.16
95 0.17
96 0.2
97 0.28
98 0.31
99 0.33
100 0.4
101 0.45
102 0.51
103 0.58
104 0.58
105 0.57
106 0.57
107 0.55
108 0.53
109 0.45
110 0.44
111 0.39
112 0.35
113 0.29
114 0.32
115 0.33
116 0.31
117 0.31
118 0.24
119 0.22
120 0.22
121 0.22
122 0.22
123 0.28
124 0.26
125 0.27
126 0.28
127 0.27
128 0.27
129 0.26
130 0.2
131 0.15
132 0.15
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.11
152 0.12
153 0.16
154 0.21
155 0.27
156 0.36
157 0.43
158 0.47
159 0.56
160 0.64
161 0.67
162 0.72
163 0.77
164 0.78
165 0.79
166 0.82
167 0.82
168 0.83
169 0.8
170 0.76
171 0.71
172 0.68
173 0.67
174 0.67
175 0.62
176 0.55
177 0.52
178 0.48
179 0.42
180 0.34
181 0.27
182 0.19
183 0.13
184 0.1
185 0.08
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.12
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.18
219 0.2
220 0.19
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.13
253 0.2
254 0.21
255 0.24
256 0.24
257 0.3
258 0.33
259 0.34
260 0.34
261 0.3
262 0.32
263 0.33
264 0.33
265 0.32
266 0.31
267 0.3
268 0.26
269 0.22
270 0.2
271 0.18
272 0.15
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.11
281 0.09
282 0.08
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.07
314 0.08
315 0.11
316 0.1
317 0.12
318 0.18
319 0.27
320 0.35
321 0.38
322 0.47
323 0.44
324 0.48
325 0.47
326 0.47
327 0.41
328 0.35
329 0.34
330 0.26
331 0.25
332 0.21
333 0.2
334 0.13
335 0.11
336 0.09
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.09
342 0.11
343 0.12
344 0.19
345 0.21
346 0.22
347 0.25
348 0.25
349 0.24
350 0.24
351 0.23
352 0.16
353 0.18
354 0.2
355 0.16
356 0.16
357 0.17
358 0.17
359 0.17
360 0.18
361 0.19
362 0.24
363 0.27
364 0.29
365 0.28
366 0.28
367 0.28
368 0.31
369 0.29
370 0.23
371 0.2
372 0.19
373 0.21
374 0.19
375 0.19
376 0.14
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.08
381 0.05
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.12
402 0.14
403 0.23
404 0.31
405 0.37
406 0.39
407 0.47
408 0.52
409 0.54
410 0.6
411 0.6
412 0.58
413 0.58
414 0.58
415 0.56
416 0.57
417 0.54
418 0.46
419 0.46
420 0.4
421 0.39
422 0.41
423 0.4
424 0.36
425 0.39
426 0.39
427 0.31
428 0.3
429 0.26
430 0.26
431 0.24
432 0.21
433 0.2
434 0.27
435 0.28
436 0.34
437 0.33
438 0.28
439 0.29
440 0.32
441 0.32
442 0.31
443 0.33
444 0.31
445 0.33
446 0.32
447 0.3
448 0.26
449 0.23
450 0.16
451 0.12
452 0.08
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.1
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.09
471 0.08
472 0.09
473 0.1
474 0.08
475 0.11
476 0.11
477 0.13
478 0.18
479 0.24
480 0.31
481 0.34
482 0.37
483 0.38
484 0.39
485 0.38
486 0.33
487 0.3
488 0.24
489 0.21
490 0.2
491 0.2
492 0.26
493 0.26
494 0.27
495 0.25
496 0.26
497 0.25
498 0.25
499 0.23
500 0.16
501 0.14
502 0.13
503 0.12
504 0.1
505 0.09
506 0.06
507 0.07
508 0.09
509 0.15
510 0.15
511 0.16
512 0.17
513 0.2
514 0.22
515 0.23
516 0.23
517 0.19
518 0.2
519 0.2
520 0.19
521 0.17
522 0.15
523 0.12
524 0.09
525 0.09
526 0.07
527 0.11
528 0.17
529 0.19
530 0.26
531 0.33
532 0.38
533 0.38
534 0.46
535 0.48
536 0.48
537 0.51
538 0.5
539 0.51
540 0.5
541 0.49
542 0.47
543 0.48
544 0.44
545 0.42
546 0.39
547 0.38
548 0.42
549 0.49
550 0.52
551 0.54
552 0.54
553 0.53
554 0.54
555 0.52
556 0.5
557 0.49
558 0.41
559 0.4
560 0.39
561 0.37
562 0.33
563 0.28
564 0.25
565 0.24
566 0.23
567 0.15
568 0.14
569 0.14
570 0.13
571 0.12
572 0.13
573 0.09
574 0.1
575 0.13
576 0.13
577 0.14
578 0.15
579 0.15
580 0.15
581 0.16
582 0.16
583 0.18
584 0.28
585 0.31
586 0.36
587 0.38
588 0.37
589 0.41
590 0.49
591 0.53
592 0.46
593 0.49
594 0.51
595 0.51
596 0.52
597 0.49
598 0.48
599 0.41
600 0.4
601 0.38
602 0.4
603 0.45
604 0.46
605 0.52
606 0.48
607 0.52
608 0.53
609 0.51
610 0.43
611 0.41
612 0.39
613 0.37
614 0.4
615 0.36
616 0.37
617 0.42
618 0.41
619 0.37
620 0.41
621 0.44
622 0.37
623 0.35
624 0.32
625 0.29
626 0.31
627 0.32
628 0.27
629 0.2
630 0.2
631 0.19
632 0.19
633 0.14
634 0.13
635 0.13
636 0.15
637 0.17
638 0.21
639 0.27
640 0.28
641 0.3
642 0.28
643 0.28
644 0.27
645 0.27
646 0.25
647 0.22
648 0.23
649 0.27
650 0.36
651 0.38
652 0.39
653 0.38
654 0.39
655 0.4
656 0.4
657 0.38
658 0.32
659 0.33
660 0.32
661 0.3
662 0.26
663 0.22
664 0.2
665 0.17
666 0.14
667 0.1
668 0.08
669 0.07
670 0.08
671 0.07
672 0.09
673 0.1
674 0.1
675 0.14
676 0.17
677 0.21
678 0.23
679 0.28
680 0.33
681 0.35
682 0.37
683 0.35
684 0.36
685 0.37
686 0.39
687 0.36
688 0.31
689 0.33
690 0.34
691 0.33
692 0.31
693 0.29
694 0.28
695 0.26
696 0.27
697 0.29
698 0.37
699 0.46
700 0.49
701 0.53
702 0.57
703 0.62
704 0.64
705 0.62
706 0.58
707 0.53
708 0.54
709 0.47
710 0.4
711 0.35
712 0.33
713 0.26
714 0.25
715 0.21
716 0.2
717 0.23
718 0.27
719 0.34
720 0.32
721 0.38
722 0.4
723 0.44
724 0.48
725 0.49
726 0.53
727 0.51
728 0.57