Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y5A4

Protein Details
Accession C4Y5A4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
366-391FTRINRKMTGAKKKSVKKAGPSIEGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
372-385KMTGAKKKSVKKAG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 8.5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG clu:CLUG_03338  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MEAKTDETTGPMAGEETAQEPVQEQPQHTPTPSEGESNENFEQQSDSEQKQNAEAQEQSEPDFEQDIYAIRSHKNGGEGVTRKKVIRKSARDERERDITPAVESYGDNSGAEGYEDPLTQRRRQLEEKMDLAVKSKTSRRKKADEDDLERMQDDRIDHLKNKMIEAANLDVEKNSQGQIATEKLKMLREVMDTMTKADLAISILDNNLLEAVRLWLEPLPDASMPAYQIQKELLQSLGALPIKTDHLVASGIGKVLVFYQRSKRTEPSLKKIVDRLIGDWTRPILNKSDSYKDRTIKFHDYHKARFSNQLRSSRKKQTEAKSLYEQQAERRNRAAIPAARTTAYKIAPKVDPSLLMRQQRGAGEMFTRINRKMTGAKKKSVKKAGPSIEGKSLSM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.1
4 0.12
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.14
9 0.21
10 0.23
11 0.23
12 0.28
13 0.34
14 0.37
15 0.37
16 0.37
17 0.32
18 0.35
19 0.35
20 0.31
21 0.27
22 0.3
23 0.3
24 0.34
25 0.34
26 0.29
27 0.27
28 0.24
29 0.25
30 0.19
31 0.24
32 0.23
33 0.24
34 0.28
35 0.31
36 0.31
37 0.33
38 0.37
39 0.32
40 0.3
41 0.29
42 0.26
43 0.28
44 0.28
45 0.26
46 0.23
47 0.21
48 0.18
49 0.19
50 0.16
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.18
60 0.19
61 0.2
62 0.2
63 0.2
64 0.27
65 0.32
66 0.36
67 0.41
68 0.42
69 0.42
70 0.47
71 0.5
72 0.52
73 0.57
74 0.59
75 0.62
76 0.7
77 0.78
78 0.79
79 0.78
80 0.73
81 0.7
82 0.63
83 0.55
84 0.47
85 0.38
86 0.31
87 0.27
88 0.22
89 0.15
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.15
105 0.19
106 0.22
107 0.27
108 0.3
109 0.35
110 0.41
111 0.48
112 0.5
113 0.51
114 0.5
115 0.47
116 0.44
117 0.38
118 0.35
119 0.28
120 0.21
121 0.2
122 0.25
123 0.33
124 0.4
125 0.5
126 0.55
127 0.62
128 0.69
129 0.74
130 0.78
131 0.77
132 0.74
133 0.7
134 0.65
135 0.57
136 0.49
137 0.4
138 0.29
139 0.22
140 0.16
141 0.14
142 0.16
143 0.18
144 0.2
145 0.22
146 0.27
147 0.25
148 0.25
149 0.26
150 0.22
151 0.21
152 0.21
153 0.2
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.09
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.09
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.16
172 0.15
173 0.15
174 0.13
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.1
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.1
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.1
244 0.11
245 0.13
246 0.22
247 0.3
248 0.33
249 0.37
250 0.39
251 0.44
252 0.53
253 0.57
254 0.57
255 0.58
256 0.58
257 0.57
258 0.57
259 0.53
260 0.48
261 0.42
262 0.35
263 0.34
264 0.33
265 0.3
266 0.28
267 0.25
268 0.23
269 0.22
270 0.22
271 0.18
272 0.21
273 0.26
274 0.29
275 0.37
276 0.38
277 0.44
278 0.5
279 0.51
280 0.52
281 0.52
282 0.54
283 0.54
284 0.54
285 0.55
286 0.58
287 0.59
288 0.6
289 0.63
290 0.61
291 0.54
292 0.61
293 0.57
294 0.58
295 0.6
296 0.64
297 0.64
298 0.68
299 0.74
300 0.75
301 0.77
302 0.75
303 0.76
304 0.75
305 0.78
306 0.75
307 0.74
308 0.71
309 0.7
310 0.66
311 0.63
312 0.55
313 0.51
314 0.55
315 0.54
316 0.49
317 0.46
318 0.44
319 0.38
320 0.41
321 0.42
322 0.38
323 0.39
324 0.4
325 0.39
326 0.37
327 0.37
328 0.37
329 0.34
330 0.32
331 0.32
332 0.29
333 0.32
334 0.35
335 0.37
336 0.38
337 0.34
338 0.35
339 0.34
340 0.42
341 0.43
342 0.46
343 0.45
344 0.43
345 0.45
346 0.42
347 0.4
348 0.32
349 0.27
350 0.22
351 0.25
352 0.26
353 0.27
354 0.3
355 0.3
356 0.32
357 0.31
358 0.34
359 0.38
360 0.45
361 0.51
362 0.54
363 0.61
364 0.67
365 0.76
366 0.82
367 0.84
368 0.81
369 0.79
370 0.83
371 0.82
372 0.82
373 0.77
374 0.72
375 0.69