Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y093

Protein Details
Accession C4Y093    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
708-727DRCGNPPKFNYKKKINSVDFHydrophilic
897-925DVTTSSHKTKSKRSRRKHDKIYNHKFGSAHydrophilic
1045-1064VDDVKEYRKHGKCNTQKSTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
905-914TKSKRSRRKH
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR018835  RNA-binding_domain_put  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG clu:CLUG_01625  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10378  RRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MHQPFVSSVSSPKFQSQQHQEHPLVYHNMFQGSHTPLDLAYSQSMLPANLLASTPGPVLSRPSFVPAHSQNSVVPRGHSAVLVPNQYPAYNKVHSQSQQPYLTYPSSNSSLDQLHLSRTVLLKYLDPKLTLNELLSEISCGPIEYCKMFESPAPPHMEDMETVKTCYISFVSTAVAVNFHHKYGKNPYNLKALQDKLKNSRYLKISLNEPVHAASGASGHTNLSKQDYIKLKTLNYINDLNATRAVLLKFKIANTDLIPSTKEEIRTRCSKYGEIEDFRVSTNEEKHELKFLIHFTSIDTAIKIYEYHLKRIQIDRENHLDLGSEPSLMCLSVSFHRDRCDRQNSSKSRQPSTVSRLDSFSSSSSLSSSSPAMIRRKSANPLNITGSKINESNISPRGSFTATKPTDEDLPEEANEGSHPKSPTMGDPPTDVHRNTLEHSRSSEELESISSSSPSAATESLPAVYAQHYSASDPLLLYQTTPYQMAVPIQQGPQISVPSYQHAYQFNPDPFNVGNRTLYLGNLHPSTSVEEIANNVRAGGLVESFKYYKSKRICFITFVDAAVALKFYLNHQVLHQLIVHGSEVNVGWGKNHSGPLSREISLAVTAGASRNVYIGVRSAGDGEEAANTMRLPDEPTLRSAFGKFGDLEQINFYHNNDCGFMNFMNIVDAIKVVELFESENVDKINEIAGDNGEFYEHYRHFKISFGKDRCGNPPKFNYKKKINSVDFREPFGSHPTRASVGTRDEINPISEEAAMVFGISTDASHPAPALQTSSDDSENDKNGSSGQKSMPVEDSSDGSYDQKAATNGKDNPTGDENKSVDADKKVSGTEEKLDEEIKCANVTSTESVFEEVHGGTEKNDIKSNTIDEPVKDVNVDPEHEDEDEDDDDDISIIIGSDVTTSSHKTKSKRSRRKHDKIYNHKFGSADIFDYNTSLNSVSSLSSTYGYPPPYNCPPANYGTGYPQAVFYPPESPYFVQAQPSSYYSVPSQSIPVSSMYPQVTNPISAMGSKGSYLASGSQVMAQYLARSQHENYVYAANILNNDVSVDDVKEYRKHGKCNTQKSTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.47
3 0.52
4 0.57
5 0.62
6 0.68
7 0.65
8 0.62
9 0.61
10 0.57
11 0.53
12 0.43
13 0.4
14 0.33
15 0.35
16 0.31
17 0.3
18 0.29
19 0.27
20 0.27
21 0.23
22 0.21
23 0.18
24 0.21
25 0.2
26 0.18
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.16
31 0.17
32 0.14
33 0.14
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.11
45 0.18
46 0.19
47 0.21
48 0.2
49 0.25
50 0.25
51 0.25
52 0.34
53 0.33
54 0.38
55 0.36
56 0.37
57 0.35
58 0.39
59 0.44
60 0.36
61 0.32
62 0.28
63 0.3
64 0.29
65 0.26
66 0.22
67 0.24
68 0.28
69 0.3
70 0.27
71 0.27
72 0.28
73 0.28
74 0.29
75 0.26
76 0.27
77 0.26
78 0.28
79 0.28
80 0.36
81 0.38
82 0.44
83 0.47
84 0.49
85 0.51
86 0.49
87 0.48
88 0.44
89 0.44
90 0.37
91 0.32
92 0.28
93 0.27
94 0.27
95 0.26
96 0.24
97 0.23
98 0.23
99 0.25
100 0.22
101 0.21
102 0.22
103 0.22
104 0.21
105 0.22
106 0.21
107 0.2
108 0.21
109 0.22
110 0.25
111 0.31
112 0.31
113 0.3
114 0.3
115 0.31
116 0.34
117 0.31
118 0.27
119 0.22
120 0.2
121 0.2
122 0.19
123 0.17
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.09
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.21
138 0.23
139 0.29
140 0.33
141 0.32
142 0.33
143 0.33
144 0.32
145 0.27
146 0.26
147 0.27
148 0.22
149 0.22
150 0.21
151 0.2
152 0.19
153 0.19
154 0.16
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.2
168 0.21
169 0.26
170 0.35
171 0.43
172 0.46
173 0.5
174 0.53
175 0.58
176 0.59
177 0.57
178 0.54
179 0.51
180 0.5
181 0.51
182 0.54
183 0.53
184 0.58
185 0.62
186 0.56
187 0.59
188 0.55
189 0.53
190 0.53
191 0.47
192 0.45
193 0.46
194 0.46
195 0.39
196 0.36
197 0.32
198 0.27
199 0.23
200 0.18
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.15
211 0.17
212 0.17
213 0.24
214 0.31
215 0.33
216 0.38
217 0.4
218 0.36
219 0.4
220 0.43
221 0.39
222 0.36
223 0.35
224 0.3
225 0.32
226 0.32
227 0.27
228 0.24
229 0.21
230 0.17
231 0.17
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.17
236 0.18
237 0.18
238 0.22
239 0.2
240 0.22
241 0.21
242 0.24
243 0.21
244 0.2
245 0.21
246 0.19
247 0.21
248 0.21
249 0.25
250 0.26
251 0.29
252 0.34
253 0.4
254 0.45
255 0.47
256 0.47
257 0.45
258 0.44
259 0.49
260 0.51
261 0.47
262 0.44
263 0.4
264 0.38
265 0.35
266 0.32
267 0.24
268 0.2
269 0.21
270 0.21
271 0.23
272 0.24
273 0.24
274 0.29
275 0.28
276 0.25
277 0.23
278 0.22
279 0.21
280 0.2
281 0.19
282 0.16
283 0.18
284 0.18
285 0.15
286 0.13
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.16
293 0.18
294 0.23
295 0.27
296 0.3
297 0.33
298 0.39
299 0.46
300 0.45
301 0.48
302 0.47
303 0.49
304 0.48
305 0.44
306 0.38
307 0.31
308 0.23
309 0.24
310 0.19
311 0.13
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.1
317 0.05
318 0.07
319 0.1
320 0.14
321 0.16
322 0.18
323 0.23
324 0.26
325 0.31
326 0.37
327 0.44
328 0.46
329 0.52
330 0.61
331 0.63
332 0.68
333 0.69
334 0.65
335 0.6
336 0.58
337 0.54
338 0.51
339 0.51
340 0.51
341 0.48
342 0.44
343 0.42
344 0.38
345 0.35
346 0.29
347 0.23
348 0.17
349 0.14
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.17
359 0.21
360 0.21
361 0.24
362 0.28
363 0.31
364 0.37
365 0.4
366 0.42
367 0.4
368 0.41
369 0.44
370 0.41
371 0.4
372 0.35
373 0.3
374 0.25
375 0.22
376 0.2
377 0.17
378 0.16
379 0.18
380 0.2
381 0.21
382 0.19
383 0.19
384 0.2
385 0.2
386 0.2
387 0.18
388 0.24
389 0.23
390 0.24
391 0.25
392 0.25
393 0.26
394 0.25
395 0.25
396 0.17
397 0.17
398 0.16
399 0.16
400 0.15
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.13
406 0.13
407 0.12
408 0.14
409 0.15
410 0.17
411 0.22
412 0.22
413 0.19
414 0.2
415 0.22
416 0.24
417 0.27
418 0.24
419 0.2
420 0.2
421 0.21
422 0.21
423 0.27
424 0.25
425 0.23
426 0.24
427 0.25
428 0.24
429 0.24
430 0.23
431 0.15
432 0.14
433 0.13
434 0.12
435 0.1
436 0.09
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.09
469 0.08
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.11
476 0.11
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.13
481 0.12
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.13
488 0.15
489 0.17
490 0.17
491 0.18
492 0.22
493 0.22
494 0.22
495 0.21
496 0.2
497 0.18
498 0.2
499 0.2
500 0.15
501 0.14
502 0.12
503 0.14
504 0.13
505 0.12
506 0.11
507 0.1
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.09
512 0.09
513 0.11
514 0.1
515 0.1
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.1
520 0.11
521 0.09
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.05
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.12
534 0.12
535 0.19
536 0.25
537 0.29
538 0.32
539 0.38
540 0.39
541 0.38
542 0.4
543 0.37
544 0.31
545 0.27
546 0.22
547 0.16
548 0.15
549 0.11
550 0.09
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.05
555 0.12
556 0.13
557 0.13
558 0.13
559 0.17
560 0.17
561 0.18
562 0.18
563 0.11
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.06
572 0.07
573 0.06
574 0.06
575 0.07
576 0.09
577 0.09
578 0.11
579 0.11
580 0.14
581 0.16
582 0.2
583 0.22
584 0.21
585 0.2
586 0.18
587 0.18
588 0.15
589 0.13
590 0.09
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.07
606 0.06
607 0.07
608 0.06
609 0.06
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.07
619 0.09
620 0.13
621 0.13
622 0.16
623 0.18
624 0.18
625 0.19
626 0.17
627 0.17
628 0.14
629 0.15
630 0.13
631 0.11
632 0.16
633 0.16
634 0.16
635 0.15
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.15
640 0.12
641 0.12
642 0.12
643 0.12
644 0.12
645 0.11
646 0.13
647 0.12
648 0.1
649 0.1
650 0.09
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.05
655 0.05
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.05
664 0.08
665 0.08
666 0.09
667 0.09
668 0.09
669 0.09
670 0.09
671 0.09
672 0.07
673 0.07
674 0.06
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.06
680 0.05
681 0.06
682 0.12
683 0.13
684 0.16
685 0.17
686 0.19
687 0.19
688 0.24
689 0.3
690 0.33
691 0.42
692 0.42
693 0.45
694 0.49
695 0.52
696 0.56
697 0.58
698 0.54
699 0.5
700 0.55
701 0.61
702 0.66
703 0.71
704 0.71
705 0.71
706 0.77
707 0.79
708 0.81
709 0.77
710 0.76
711 0.76
712 0.78
713 0.7
714 0.63
715 0.56
716 0.47
717 0.41
718 0.41
719 0.35
720 0.25
721 0.25
722 0.24
723 0.24
724 0.24
725 0.24
726 0.2
727 0.2
728 0.21
729 0.21
730 0.21
731 0.21
732 0.21
733 0.2
734 0.17
735 0.15
736 0.14
737 0.11
738 0.1
739 0.08
740 0.08
741 0.06
742 0.05
743 0.05
744 0.04
745 0.04
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.06
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.08
755 0.09
756 0.09
757 0.08
758 0.09
759 0.11
760 0.14
761 0.14
762 0.14
763 0.17
764 0.19
765 0.21
766 0.2
767 0.18
768 0.16
769 0.17
770 0.21
771 0.19
772 0.19
773 0.19
774 0.25
775 0.25
776 0.27
777 0.28
778 0.25
779 0.25
780 0.22
781 0.23
782 0.16
783 0.17
784 0.15
785 0.13
786 0.12
787 0.12
788 0.11
789 0.12
790 0.13
791 0.15
792 0.17
793 0.24
794 0.27
795 0.3
796 0.35
797 0.33
798 0.35
799 0.37
800 0.39
801 0.33
802 0.36
803 0.33
804 0.29
805 0.3
806 0.28
807 0.26
808 0.25
809 0.25
810 0.2
811 0.2
812 0.19
813 0.2
814 0.21
815 0.2
816 0.21
817 0.22
818 0.22
819 0.22
820 0.23
821 0.21
822 0.21
823 0.2
824 0.17
825 0.15
826 0.13
827 0.13
828 0.12
829 0.14
830 0.15
831 0.14
832 0.14
833 0.15
834 0.17
835 0.16
836 0.15
837 0.14
838 0.11
839 0.11
840 0.11
841 0.11
842 0.1
843 0.17
844 0.2
845 0.2
846 0.25
847 0.25
848 0.26
849 0.28
850 0.31
851 0.27
852 0.29
853 0.29
854 0.24
855 0.29
856 0.28
857 0.26
858 0.23
859 0.21
860 0.22
861 0.22
862 0.23
863 0.19
864 0.2
865 0.21
866 0.21
867 0.21
868 0.15
869 0.16
870 0.15
871 0.14
872 0.12
873 0.1
874 0.1
875 0.1
876 0.09
877 0.06
878 0.05
879 0.04
880 0.04
881 0.04
882 0.04
883 0.04
884 0.05
885 0.06
886 0.08
887 0.11
888 0.15
889 0.22
890 0.28
891 0.32
892 0.43
893 0.53
894 0.63
895 0.71
896 0.78
897 0.83
898 0.89
899 0.95
900 0.95
901 0.95
902 0.95
903 0.95
904 0.95
905 0.94
906 0.85
907 0.77
908 0.66
909 0.56
910 0.52
911 0.42
912 0.33
913 0.23
914 0.22
915 0.19
916 0.2
917 0.19
918 0.12
919 0.12
920 0.1
921 0.09
922 0.08
923 0.09
924 0.09
925 0.09
926 0.1
927 0.1
928 0.11
929 0.11
930 0.14
931 0.18
932 0.21
933 0.23
934 0.24
935 0.3
936 0.36
937 0.43
938 0.4
939 0.4
940 0.4
941 0.42
942 0.45
943 0.41
944 0.35
945 0.33
946 0.36
947 0.33
948 0.29
949 0.26
950 0.22
951 0.21
952 0.21
953 0.18
954 0.17
955 0.17
956 0.2
957 0.23
958 0.23
959 0.25
960 0.28
961 0.28
962 0.3
963 0.3
964 0.3
965 0.29
966 0.3
967 0.3
968 0.25
969 0.26
970 0.21
971 0.24
972 0.23
973 0.21
974 0.22
975 0.2
976 0.21
977 0.19
978 0.2
979 0.18
980 0.18
981 0.23
982 0.22
983 0.22
984 0.21
985 0.25
986 0.25
987 0.23
988 0.22
989 0.18
990 0.17
991 0.16
992 0.17
993 0.14
994 0.13
995 0.12
996 0.13
997 0.11
998 0.11
999 0.12
1000 0.12
1001 0.12
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.15
1005 0.16
1006 0.16
1007 0.16
1008 0.14
1009 0.13
1010 0.15
1011 0.19
1012 0.18
1013 0.21
1014 0.23
1015 0.3
1016 0.32
1017 0.32
1018 0.3
1019 0.3
1020 0.28
1021 0.26
1022 0.26
1023 0.19
1024 0.18
1025 0.18
1026 0.16
1027 0.12
1028 0.12
1029 0.1
1030 0.11
1031 0.11
1032 0.11
1033 0.12
1034 0.14
1035 0.19
1036 0.22
1037 0.28
1038 0.36
1039 0.41
1040 0.49
1041 0.56
1042 0.65
1043 0.71
1044 0.78