Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XXJ2

Protein Details
Accession C4XXJ2    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-77EISNPSLKRDRRKPPVSRQVYVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 10, cyto 8, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034540  Prp24_RRM3  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG clu:CLUG_00665  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12298  RRM3_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
Amino Acid Sequences MIEGTGLKPLNVRFPVQNDNKQRRFCYADFGSSEDAQAVRNSLHEKQIGSFCVQAEISNPSLKRDRRKPPVSRQVYVHNLNFKETDESHLHAFFSKFGDVESVKMPLSAKNRDQGLQNNGFAFVTFITEAGANEAIKLGGADLDNRRIEISAVKSKQNVHKATHFDKDATVSVHNVNEIVTEDCLKAFLESKVGPVAKSQLLPSQKGALVQFTSVADAGKASILLDGSEYEGNIIHIGEMSDFSWAKESAKAKEALPKDQSSSSKPSMVPPMLLRKRRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.44
3 0.49
4 0.57
5 0.6
6 0.68
7 0.73
8 0.75
9 0.72
10 0.69
11 0.68
12 0.59
13 0.58
14 0.51
15 0.49
16 0.44
17 0.45
18 0.42
19 0.34
20 0.34
21 0.26
22 0.22
23 0.16
24 0.15
25 0.13
26 0.1
27 0.12
28 0.16
29 0.17
30 0.22
31 0.23
32 0.24
33 0.26
34 0.3
35 0.29
36 0.27
37 0.27
38 0.22
39 0.22
40 0.21
41 0.18
42 0.15
43 0.17
44 0.17
45 0.19
46 0.19
47 0.21
48 0.29
49 0.34
50 0.42
51 0.49
52 0.57
53 0.63
54 0.73
55 0.79
56 0.82
57 0.88
58 0.85
59 0.79
60 0.72
61 0.7
62 0.67
63 0.63
64 0.56
65 0.51
66 0.44
67 0.43
68 0.4
69 0.32
70 0.29
71 0.24
72 0.25
73 0.2
74 0.22
75 0.22
76 0.22
77 0.21
78 0.19
79 0.19
80 0.15
81 0.14
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.13
86 0.11
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.19
95 0.23
96 0.24
97 0.27
98 0.28
99 0.29
100 0.31
101 0.33
102 0.35
103 0.33
104 0.32
105 0.28
106 0.27
107 0.25
108 0.22
109 0.16
110 0.09
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.06
129 0.07
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.16
138 0.2
139 0.22
140 0.24
141 0.26
142 0.3
143 0.36
144 0.41
145 0.4
146 0.35
147 0.39
148 0.44
149 0.46
150 0.47
151 0.42
152 0.34
153 0.31
154 0.29
155 0.25
156 0.2
157 0.17
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.11
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.16
183 0.19
184 0.17
185 0.18
186 0.18
187 0.19
188 0.22
189 0.24
190 0.25
191 0.25
192 0.24
193 0.25
194 0.25
195 0.21
196 0.19
197 0.17
198 0.17
199 0.13
200 0.13
201 0.11
202 0.1
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.06
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.2
235 0.24
236 0.24
237 0.3
238 0.32
239 0.3
240 0.38
241 0.4
242 0.42
243 0.45
244 0.44
245 0.42
246 0.46
247 0.49
248 0.46
249 0.5
250 0.46
251 0.46
252 0.43
253 0.45
254 0.47
255 0.45
256 0.43
257 0.42
258 0.49
259 0.53