Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XYL6

Protein Details
Accession C4XYL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-35LNIKRDDTPQPAKKKQKVEYAAPQKGHydrophilic
55-90SLGANKARDRKQKVSPWTKMPFKPNKKNEHAPQLYHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 11.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032563  DAMP1_SANT-like  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR027109  Swc4/Dmap1  
Gene Ontology GO:0035267  C:NuA4 histone acetyltransferase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0043968  P:histone H2A acetylation  
GO:0043967  P:histone H4 acetylation  
KEGG clu:CLUG_01039  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16282  SANT_DAMP1_like  
Amino Acid Sequences MSANDILDVLNIKRDDTPQPAKKKQKVEYAAPQKGAMARELYNLLGPNTPPVSLSLGANKARDRKQKVSPWTKMPFKPNKKNEHAPQLYHWQKGSEELLKQESAGKPYFFDKFSVSLDIPELVDEATYDHFMEEILQEEKRRNEQELKDKEEEDSVPSSETTTDGSSEKVATLKNEQAVKLSKDMKDTKSNGRTDGKVKTETDTPGTQQKTRGLNKSGDGGAEEEKEAKEGDEIDEDEEEDDEDEDEVKDNEGSQEEKESDKKEKDEKARQTKVANSSKATTDVQDNNSITDKHTNPPWSYKETQLLFDYCKVFELKWYVIADRFPYDRTMEELKEQFYRISAKILNHQGNANPHLVESLESYSKDAEIDRKQYLESLLKRTPAEIAEEESLVIEARRFELAAKKMLMERSHLLTLLDSPQSSQSVQQYLSSSGMTNLYNKLMIMDKQQKKKMSNKSNSANTDPVPPSIPVAASSSSYKKDRGFQTHLQQYLSGLVKQSSTKGEPSPIQQLLSKRLTTKEEEAYGLHYHANERLTPGVILRSTQRLPGLQQRQSVFKSVNSMLQELDIPTAGSTTWKPVMPTRKTMAKYDELIRAVVALLDVKKGKDKLEAEIELIKSQRGLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.28
3 0.35
4 0.45
5 0.47
6 0.58
7 0.67
8 0.75
9 0.8
10 0.84
11 0.83
12 0.83
13 0.81
14 0.8
15 0.81
16 0.81
17 0.8
18 0.71
19 0.64
20 0.56
21 0.52
22 0.44
23 0.36
24 0.28
25 0.22
26 0.23
27 0.25
28 0.23
29 0.21
30 0.21
31 0.2
32 0.19
33 0.18
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.18
38 0.18
39 0.21
40 0.19
41 0.2
42 0.21
43 0.27
44 0.3
45 0.33
46 0.36
47 0.4
48 0.48
49 0.56
50 0.58
51 0.59
52 0.66
53 0.72
54 0.79
55 0.81
56 0.8
57 0.8
58 0.8
59 0.82
60 0.79
61 0.8
62 0.8
63 0.8
64 0.84
65 0.84
66 0.85
67 0.85
68 0.88
69 0.86
70 0.86
71 0.81
72 0.73
73 0.69
74 0.69
75 0.66
76 0.59
77 0.51
78 0.42
79 0.36
80 0.37
81 0.37
82 0.32
83 0.29
84 0.29
85 0.31
86 0.29
87 0.29
88 0.32
89 0.29
90 0.28
91 0.29
92 0.26
93 0.24
94 0.27
95 0.31
96 0.25
97 0.24
98 0.22
99 0.22
100 0.24
101 0.26
102 0.23
103 0.21
104 0.21
105 0.2
106 0.17
107 0.15
108 0.13
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.13
125 0.17
126 0.21
127 0.27
128 0.3
129 0.32
130 0.39
131 0.45
132 0.54
133 0.58
134 0.62
135 0.58
136 0.56
137 0.52
138 0.47
139 0.4
140 0.32
141 0.27
142 0.2
143 0.17
144 0.16
145 0.16
146 0.13
147 0.13
148 0.11
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.17
160 0.19
161 0.23
162 0.25
163 0.25
164 0.27
165 0.31
166 0.3
167 0.32
168 0.34
169 0.31
170 0.36
171 0.41
172 0.42
173 0.46
174 0.48
175 0.52
176 0.55
177 0.55
178 0.53
179 0.52
180 0.5
181 0.47
182 0.49
183 0.43
184 0.4
185 0.39
186 0.36
187 0.35
188 0.34
189 0.33
190 0.28
191 0.26
192 0.29
193 0.31
194 0.3
195 0.3
196 0.35
197 0.39
198 0.43
199 0.48
200 0.44
201 0.44
202 0.43
203 0.43
204 0.37
205 0.29
206 0.24
207 0.19
208 0.16
209 0.14
210 0.13
211 0.11
212 0.1
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.16
246 0.18
247 0.23
248 0.24
249 0.28
250 0.33
251 0.39
252 0.46
253 0.53
254 0.6
255 0.65
256 0.67
257 0.67
258 0.63
259 0.61
260 0.62
261 0.6
262 0.52
263 0.43
264 0.39
265 0.37
266 0.37
267 0.32
268 0.23
269 0.2
270 0.21
271 0.22
272 0.25
273 0.24
274 0.22
275 0.23
276 0.22
277 0.19
278 0.21
279 0.2
280 0.18
281 0.21
282 0.24
283 0.24
284 0.3
285 0.32
286 0.32
287 0.32
288 0.33
289 0.36
290 0.33
291 0.33
292 0.29
293 0.27
294 0.22
295 0.23
296 0.22
297 0.15
298 0.15
299 0.14
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.12
304 0.15
305 0.16
306 0.15
307 0.16
308 0.17
309 0.16
310 0.14
311 0.15
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.15
317 0.17
318 0.16
319 0.18
320 0.19
321 0.19
322 0.2
323 0.2
324 0.16
325 0.14
326 0.17
327 0.14
328 0.16
329 0.17
330 0.17
331 0.23
332 0.3
333 0.31
334 0.29
335 0.29
336 0.28
337 0.29
338 0.3
339 0.25
340 0.18
341 0.15
342 0.14
343 0.14
344 0.12
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.13
355 0.16
356 0.2
357 0.2
358 0.21
359 0.21
360 0.21
361 0.23
362 0.24
363 0.24
364 0.26
365 0.28
366 0.3
367 0.3
368 0.3
369 0.28
370 0.22
371 0.22
372 0.16
373 0.17
374 0.15
375 0.15
376 0.14
377 0.12
378 0.12
379 0.08
380 0.07
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.14
388 0.17
389 0.2
390 0.2
391 0.2
392 0.23
393 0.27
394 0.26
395 0.23
396 0.23
397 0.22
398 0.23
399 0.22
400 0.19
401 0.16
402 0.16
403 0.16
404 0.14
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.13
410 0.14
411 0.14
412 0.16
413 0.17
414 0.18
415 0.19
416 0.19
417 0.2
418 0.17
419 0.15
420 0.13
421 0.14
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.19
432 0.29
433 0.36
434 0.44
435 0.5
436 0.55
437 0.59
438 0.67
439 0.7
440 0.7
441 0.72
442 0.73
443 0.75
444 0.78
445 0.76
446 0.71
447 0.64
448 0.54
449 0.52
450 0.44
451 0.37
452 0.3
453 0.26
454 0.23
455 0.2
456 0.19
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.16
462 0.18
463 0.22
464 0.24
465 0.26
466 0.27
467 0.34
468 0.4
469 0.45
470 0.49
471 0.52
472 0.6
473 0.64
474 0.63
475 0.56
476 0.49
477 0.41
478 0.39
479 0.33
480 0.24
481 0.18
482 0.17
483 0.18
484 0.19
485 0.21
486 0.2
487 0.2
488 0.23
489 0.24
490 0.28
491 0.29
492 0.32
493 0.38
494 0.34
495 0.33
496 0.34
497 0.35
498 0.38
499 0.4
500 0.38
501 0.33
502 0.36
503 0.38
504 0.4
505 0.41
506 0.39
507 0.36
508 0.36
509 0.33
510 0.33
511 0.3
512 0.26
513 0.22
514 0.17
515 0.16
516 0.18
517 0.2
518 0.17
519 0.18
520 0.18
521 0.18
522 0.18
523 0.17
524 0.19
525 0.17
526 0.18
527 0.18
528 0.23
529 0.23
530 0.25
531 0.27
532 0.25
533 0.29
534 0.38
535 0.44
536 0.43
537 0.48
538 0.48
539 0.51
540 0.51
541 0.52
542 0.43
543 0.36
544 0.37
545 0.33
546 0.36
547 0.32
548 0.31
549 0.26
550 0.25
551 0.25
552 0.19
553 0.18
554 0.13
555 0.11
556 0.1
557 0.1
558 0.09
559 0.1
560 0.1
561 0.15
562 0.18
563 0.19
564 0.21
565 0.29
566 0.39
567 0.42
568 0.49
569 0.5
570 0.55
571 0.57
572 0.61
573 0.6
574 0.56
575 0.55
576 0.53
577 0.54
578 0.46
579 0.44
580 0.37
581 0.31
582 0.25
583 0.2
584 0.15
585 0.11
586 0.1
587 0.15
588 0.17
589 0.18
590 0.25
591 0.27
592 0.29
593 0.34
594 0.35
595 0.37
596 0.44
597 0.45
598 0.41
599 0.45
600 0.44
601 0.39
602 0.38
603 0.31