FuNGI

C4YAX5

Protein Details

Accession

C4YAX5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
669-694	TALSYSKKVRKNLKKQKDLPHYNQST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12, cyto 11.5, nucl 9.5, cysk 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR047107 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_C IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	clu:CLUG_05440 -
Pfam	View protein in Pfam PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02735 RNAP_I_Rpa1_C cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

MNAFVTIQNDVNAFIDSTKNQNAQAGKMPVPGIKQALEKKEGLFRKHMMGKRVNYAARSVISPDPNLETNEIGVPPVFAVKLTYPEPVTAYNVAELRQAVINGPDKWPGAIQVQNEDGSMVSLIGMTLEQRKAIANQLLTPSNGATVINKKVHRHIKNKDVVIMNRQPTLHKASMMGHKVRVLPGEKTLRLHYANTGAYNADFDGDEMNMHFPQNENAKAEALNLANTDSQYLTPTSGSPLRGLIQDHISAGVWLTNKDSFFTREKYQQLIYGCIRPEDGHTNGATRIVTVPPAVFKPEPLWTGKQVITTILLNIKPKGVPGINLVSKNKIKDDYWGKGSRENEVLFRNGELLSGILDKSQYGASAYGIVHSLHEVYGPDTASKALSVLGRLFTNYIMMTAFTCGMDDLRLTDEGNAWRKDILKQSVDIGRAAACEVTNLDSSTTSSDSELLKRLEEILRDDNKSGILDAITQSKVNAITSQVVSKCVPDGTMKRFPYNSMQAMALSGAKGSGVNVSQIMCLLGQQALEGRRVPVMVSGKTLPSFKPYETDARAGGYIKGRFYSGIRPQEYYFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLTKQLEGIHVSYDNSVRDGDGSLLQFLYGGDAVDTTKQSHMNQYKFCLDNYDALLAKYNPGELTEHLDTDTALSYSKKVRKNLKKQKDLPHYNQSTKYDPVLSVFNPAKYLGAVSEKFQEKLDDFVNQHSDLFAKHSSDGVSEKKFRALMQLKYMRSLIHPGESVGIIAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGHGAANVTLGIPRMREIIMTASASIKTPQMTLPLLDDVSDDMADSFCKSIGKVCLSEFIDKVVVTETTGTDDGTSYRSYKVKIVFFTKKEYEEEYDIAQEQLQNTVATKFLAKLELAISKEMKKQTRSDSLPTVGKAVPKAQTDAALAPKTIGEEGEDGDASDDKLRANTKQAVSYDAPDEDEEKMRRAEQTSDEEMEESETESGSESESESDSDDDNMVVDEAKESKPKDTKPKTLTKSAKDRQADVVSSHHFVKKYDFDDENGEWCEFEIELLGDVQKLLMVNIIEDLCRQVVVREIKNIGRCLRPQPENGRRVLTTEGVNFKAMWEQDDFIDVNGVRSNDISAVLRTYGVEAARNTIVNEINNVFSTYAISVSSRHLDLIADMMTREGSYLAFNRQGIDSSTSAFKKMSYETTCQFLTKAVLDGDREDLESPSARIVMGKLSNVGTGSFDVMAQMPTVA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.15
3	0.15
4	0.21
5	0.26
6	0.27
7	0.27
8	0.32
9	0.33
10	0.33
11	0.4
12	0.39
13	0.35
14	0.37
15	0.37
16	0.35
17	0.35
18	0.35
19	0.3
20	0.27
21	0.33
22	0.37
23	0.41
24	0.43
25	0.43
26	0.42
27	0.48
28	0.52
29	0.49
30	0.48
31	0.45
32	0.49
33	0.57
34	0.59
35	0.58
36	0.6
37	0.61
38	0.62
39	0.67
40	0.62
41	0.54
42	0.52
43	0.48
44	0.4
45	0.37
46	0.33
47	0.31
48	0.31
49	0.31
50	0.3
51	0.3
52	0.31
53	0.31
54	0.29
55	0.23
56	0.21
57	0.23
58	0.2
59	0.17
60	0.14
61	0.12
62	0.11
63	0.12
64	0.1
65	0.08
66	0.1
67	0.11
68	0.16
69	0.17
70	0.2
71	0.2
72	0.21
73	0.23
74	0.22
75	0.25
76	0.22
77	0.22
78	0.22
79	0.22
80	0.21
81	0.21
82	0.19
83	0.17
84	0.17
85	0.16
86	0.14
87	0.18
88	0.24
89	0.23
90	0.25
91	0.26
92	0.25
93	0.26
94	0.25
95	0.23
96	0.22
97	0.24
98	0.24
99	0.25
100	0.27
101	0.27
102	0.26
103	0.23
104	0.18
105	0.15
106	0.13
107	0.08
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.06
114	0.11
115	0.11
116	0.12
117	0.12
118	0.14
119	0.16
120	0.22
121	0.26
122	0.22
123	0.26
124	0.3
125	0.32
126	0.3
127	0.3
128	0.23
129	0.19
130	0.18
131	0.15
132	0.14
133	0.17
134	0.24
135	0.3
136	0.34
137	0.37
138	0.46
139	0.56
140	0.61
141	0.66
142	0.68
143	0.72
144	0.76
145	0.76
146	0.73
147	0.7
148	0.64
149	0.63
150	0.63
151	0.55
152	0.49
153	0.47
154	0.42
155	0.39
156	0.43
157	0.36
158	0.29
159	0.29
160	0.31
161	0.39
162	0.44
163	0.43
164	0.37
165	0.38
166	0.39
167	0.39
168	0.38
169	0.33
170	0.28
171	0.33
172	0.39
173	0.38
174	0.39
175	0.39
176	0.4
177	0.38
178	0.38
179	0.33
180	0.31
181	0.31
182	0.29
183	0.27
184	0.22
185	0.2
186	0.19
187	0.16
188	0.11
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.08
194	0.08
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.1
200	0.15
201	0.21
202	0.23
203	0.23
204	0.24
205	0.25
206	0.25
207	0.25
208	0.23
209	0.18
210	0.16
211	0.14
212	0.14
213	0.14
214	0.14
215	0.14
216	0.11
217	0.1
218	0.11
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.11
223	0.15
224	0.17
225	0.18
226	0.17
227	0.18
228	0.19
229	0.2
230	0.21
231	0.2
232	0.19
233	0.19
234	0.19
235	0.18
236	0.16
237	0.14
238	0.12
239	0.12
240	0.1
241	0.09
242	0.12
243	0.13
244	0.13
245	0.15
246	0.17
247	0.19
248	0.23
249	0.27
250	0.29
251	0.34
252	0.37
253	0.39
254	0.38
255	0.38
256	0.36
257	0.37
258	0.35
259	0.33
260	0.31
261	0.28
262	0.27
263	0.23
264	0.25
265	0.25
266	0.24
267	0.22
268	0.22
269	0.23
270	0.22
271	0.24
272	0.2
273	0.14
274	0.14
275	0.12
276	0.12
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.13
281	0.17
282	0.15
283	0.15
284	0.17
285	0.21
286	0.23
287	0.25
288	0.27
289	0.25
290	0.3
291	0.3
292	0.29
293	0.26
294	0.24
295	0.22
296	0.19
297	0.18
298	0.17
299	0.18
300	0.18
301	0.19
302	0.19
303	0.17
304	0.17
305	0.21
306	0.17
307	0.17
308	0.19
309	0.26
310	0.28
311	0.33
312	0.34
313	0.35
314	0.38
315	0.38
316	0.37
317	0.32
318	0.29
319	0.33
320	0.39
321	0.38
322	0.43
323	0.48
324	0.46
325	0.48
326	0.49
327	0.44
328	0.41
329	0.36
330	0.32
331	0.28
332	0.28
333	0.24
334	0.23
335	0.2
336	0.15
337	0.14
338	0.11
339	0.08
340	0.07
341	0.08
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.1
353	0.1
354	0.09
355	0.1
356	0.1
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.09
381	0.1
382	0.09
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.11
401	0.16
402	0.23
403	0.22
404	0.21
405	0.22
406	0.23
407	0.26
408	0.3
409	0.31
410	0.27
411	0.27
412	0.3
413	0.33
414	0.33
415	0.29
416	0.22
417	0.17
418	0.15
419	0.14
420	0.11
421	0.07
422	0.06
423	0.06
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.11
431	0.11
432	0.09
433	0.09
434	0.11
435	0.12
436	0.13
437	0.17
438	0.15
439	0.15
440	0.14
441	0.17
442	0.16
443	0.16
444	0.19
445	0.22
446	0.26
447	0.27
448	0.27
449	0.25
450	0.24
451	0.23
452	0.19
453	0.12
454	0.08
455	0.07
456	0.08
457	0.11
458	0.11
459	0.1
460	0.1
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.1
465	0.08
466	0.1
467	0.11
468	0.15
469	0.14
470	0.16
471	0.16
472	0.15
473	0.15
474	0.12
475	0.13
476	0.13
477	0.18
478	0.22
479	0.31
480	0.32
481	0.33
482	0.34
483	0.35
484	0.37
485	0.38
486	0.33
487	0.25
488	0.24
489	0.22
490	0.22
491	0.2
492	0.14
493	0.08
494	0.06
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.06
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.07
514	0.08
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.12
522	0.14
523	0.13
524	0.15
525	0.15
526	0.16
527	0.17
528	0.18
529	0.14
530	0.15
531	0.16
532	0.14
533	0.16
534	0.17
535	0.22
536	0.23
537	0.24
538	0.21
539	0.2
540	0.2
541	0.19
542	0.18
543	0.17
544	0.16
545	0.15
546	0.15
547	0.14
548	0.14
549	0.15
550	0.2
551	0.24
552	0.3
553	0.31
554	0.32
555	0.33
556	0.39
557	0.39
558	0.37
559	0.29
560	0.23
561	0.22
562	0.2
563	0.2
564	0.14
565	0.12
566	0.08
567	0.08
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.07
574	0.07
575	0.07
576	0.08
577	0.1
578	0.12
579	0.18
580	0.19
581	0.24
582	0.29
583	0.32
584	0.32
585	0.33
586	0.32
587	0.28
588	0.27
589	0.23
590	0.23
591	0.22
592	0.21
593	0.18
594	0.17
595	0.17
596	0.15
597	0.14
598	0.09
599	0.09
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.08
606	0.08
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.04
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.04
618	0.05
619	0.05
620	0.06
621	0.07
622	0.09
623	0.1
624	0.18
625	0.24
626	0.28
627	0.29
628	0.31
629	0.34
630	0.33
631	0.33
632	0.28
633	0.23
634	0.21
635	0.21
636	0.2
637	0.16
638	0.15
639	0.16
640	0.13
641	0.13
642	0.1
643	0.09
644	0.07
645	0.07
646	0.08
647	0.07
648	0.13
649	0.13
650	0.13
651	0.13
652	0.13
653	0.12
654	0.11
655	0.11
656	0.05
657	0.06
658	0.06
659	0.07
660	0.14
661	0.21
662	0.25
663	0.32
664	0.42
665	0.52
666	0.64
667	0.73
668	0.77
669	0.81
670	0.84
671	0.88
672	0.88
673	0.86
674	0.82
675	0.81
676	0.76
677	0.69
678	0.66
679	0.59
680	0.51
681	0.44
682	0.38
683	0.29
684	0.24
685	0.21
686	0.18
687	0.15
688	0.18
689	0.17
690	0.16
691	0.16
692	0.16
693	0.15
694	0.12
695	0.12
696	0.07
697	0.11
698	0.11
699	0.11
700	0.17
701	0.18
702	0.19
703	0.19
704	0.19
705	0.15
706	0.17
707	0.17
708	0.16
709	0.15
710	0.17
711	0.19
712	0.18
713	0.18
714	0.15
715	0.15
716	0.11
717	0.13
718	0.12
719	0.1
720	0.1
721	0.11
722	0.11
723	0.12
724	0.15
725	0.16
726	0.19
727	0.21
728	0.21
729	0.23
730	0.23
731	0.22
732	0.29
733	0.31
734	0.3
735	0.36
736	0.43
737	0.41
738	0.42
739	0.42
740	0.33
741	0.28
742	0.29
743	0.21
744	0.16
745	0.16
746	0.14
747	0.15
748	0.14
749	0.13
750	0.08
751	0.07
752	0.05
753	0.04
754	0.04
755	0.03
756	0.03
757	0.03
758	0.03
759	0.03
760	0.03
761	0.04
762	0.06
763	0.06
764	0.06
765	0.07
766	0.09
767	0.11
768	0.12
769	0.12
770	0.1
771	0.1
772	0.11
773	0.11
774	0.09
775	0.09
776	0.07
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.06
781	0.05
782	0.06
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.07
787	0.07
788	0.07
789	0.08
790	0.09
791	0.11
792	0.11
793	0.11
794	0.11
795	0.11
796	0.11
797	0.11
798	0.1
799	0.09
800	0.1
801	0.1
802	0.12
803	0.12
804	0.12
805	0.13
806	0.13
807	0.12
808	0.12
809	0.11
810	0.08
811	0.09
812	0.08
813	0.06
814	0.05
815	0.05
816	0.05
817	0.06
818	0.05
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.1
823	0.14
824	0.17
825	0.18
826	0.18
827	0.24
828	0.26
829	0.28
830	0.24
831	0.21
832	0.2
833	0.18
834	0.18
835	0.13
836	0.11
837	0.08
838	0.09
839	0.08
840	0.1
841	0.1
842	0.1
843	0.08
844	0.09
845	0.09
846	0.1
847	0.11
848	0.1
849	0.13
850	0.15
851	0.16
852	0.21
853	0.26
854	0.28
855	0.31
856	0.38
857	0.43
858	0.43
859	0.49
860	0.48
861	0.44
862	0.42
863	0.41
864	0.37
865	0.32
866	0.31
867	0.25
868	0.23
869	0.21
870	0.19
871	0.16
872	0.14
873	0.11
874	0.11
875	0.11
876	0.09
877	0.1
878	0.1
879	0.1
880	0.09
881	0.1
882	0.1
883	0.1
884	0.11
885	0.1
886	0.11
887	0.12
888	0.16
889	0.16
890	0.17
891	0.18
892	0.2
893	0.25
894	0.31
895	0.34
896	0.34
897	0.38
898	0.43
899	0.51
900	0.52
901	0.52
902	0.51
903	0.5
904	0.5
905	0.45
906	0.41
907	0.33
908	0.31
909	0.28
910	0.26
911	0.26
912	0.24
913	0.26
914	0.23
915	0.23
916	0.23
917	0.24
918	0.25
919	0.21
920	0.2
921	0.18
922	0.17
923	0.16
924	0.14
925	0.12
926	0.08
927	0.08
928	0.09
929	0.1
930	0.09
931	0.08
932	0.09
933	0.09
934	0.09
935	0.1
936	0.09
937	0.08
938	0.12
939	0.14
940	0.15
941	0.2
942	0.27
943	0.27
944	0.32
945	0.32
946	0.35
947	0.35
948	0.35
949	0.32
950	0.25
951	0.24
952	0.19
953	0.2
954	0.17
955	0.21
956	0.2
957	0.2
958	0.21
959	0.21
960	0.24
961	0.24
962	0.26
963	0.25
964	0.31
965	0.33
966	0.33
967	0.32
968	0.3
969	0.28
970	0.25
971	0.2
972	0.14
973	0.1
974	0.08
975	0.08
976	0.08
977	0.08
978	0.07
979	0.07
980	0.07
981	0.08
982	0.09
983	0.09
984	0.09
985	0.1
986	0.1
987	0.11
988	0.11
989	0.09
990	0.09
991	0.08
992	0.07
993	0.07
994	0.06
995	0.07
996	0.09
997	0.11
998	0.16
999	0.17
1000	0.24
1001	0.3
1002	0.37
1003	0.47
1004	0.53
1005	0.62
1006	0.65
1007	0.75
1008	0.73
1009	0.77
1010	0.79
1011	0.77
1012	0.79
1013	0.76
1014	0.77
1015	0.69
1016	0.66
1017	0.63
1018	0.59
1019	0.52
1020	0.43
1021	0.42
1022	0.36
1023	0.35
1024	0.35
1025	0.31
1026	0.27
1027	0.26
1028	0.31
1029	0.32
1030	0.32
1031	0.36
1032	0.35
1033	0.33
1034	0.38
1035	0.39
1036	0.37
1037	0.32
1038	0.29
1039	0.22
1040	0.21
1041	0.2
1042	0.13
1043	0.11
1044	0.09
1045	0.06
1046	0.07
1047	0.07
1048	0.08
1049	0.07
1050	0.07
1051	0.07
1052	0.06
1053	0.06
1054	0.06
1055	0.08
1056	0.07
1057	0.07
1058	0.1
1059	0.11
1060	0.1
1061	0.1
1062	0.12
1063	0.09
1064	0.1
1065	0.1
1066	0.08
1067	0.15
1068	0.23
1069	0.25
1070	0.29
1071	0.32
1072	0.37
1073	0.42
1074	0.47
1075	0.44
1076	0.43
1077	0.44
1078	0.47
1079	0.52
1080	0.52
1081	0.55
1082	0.61
1083	0.67
1084	0.66
1085	0.66
1086	0.62
1087	0.54
1088	0.51
1089	0.47
1090	0.39
1091	0.32
1092	0.32
1093	0.34
1094	0.3
1095	0.31
1096	0.28
1097	0.25
1098	0.27
1099	0.24
1100	0.2
1101	0.18
1102	0.17
1103	0.17
1104	0.2
1105	0.2
1106	0.15
1107	0.19
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.18
1111	0.18
1112	0.15
1113	0.15
1114	0.16
1115	0.12
1116	0.14
1117	0.14
1118	0.12
1119	0.14
1120	0.14
1121	0.14
1122	0.13
1123	0.14
1124	0.15
1125	0.14
1126	0.17
1127	0.15
1128	0.19
1129	0.2
1130	0.21
1131	0.2
1132	0.21
1133	0.23
1134	0.2
1135	0.23
1136	0.2
1137	0.2
1138	0.2
1139	0.21
1140	0.17
1141	0.15
1142	0.16
1143	0.13
1144	0.12
1145	0.11
1146	0.1
1147	0.11
1148	0.14
1149	0.18
1150	0.16
1151	0.16
1152	0.16
1153	0.15
1154	0.15
1155	0.16
1156	0.14
1157	0.11
1158	0.11
1159	0.11
1160	0.11
1161	0.1
1162	0.1
1163	0.08
1164	0.07
1165	0.1
1166	0.13
1167	0.17
1168	0.21
1169	0.21
1170	0.23
1171	0.23
1172	0.25
1173	0.24
1174	0.26
1175	0.22
1176	0.21
1177	0.27
1178	0.26
1179	0.27
1180	0.26
1181	0.23
1182	0.23
1183	0.26
1184	0.32
1185	0.3
1186	0.36
1187	0.37
1188	0.41
1189	0.42
1190	0.38
1191	0.35
1192	0.28
1193	0.26
1194	0.21
1195	0.22
1196	0.2
1197	0.21
1198	0.22
1199	0.24
1200	0.25
1201	0.23
1202	0.22
1203	0.2
1204	0.19
1205	0.19
1206	0.19
1207	0.18
1208	0.16
1209	0.15
1210	0.14
1211	0.14
1212	0.14
1213	0.18
1214	0.19
1215	0.2
1216	0.21
1217	0.22
1218	0.23
1219	0.22
1220	0.22
1221	0.17
1222	0.15
1223	0.16
1224	0.13
1225	0.12
1226	0.12
1227	0.12
1228	0.12

C4YAX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer