Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4YCD1

Protein Details
Accession C4YCD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
462-483GGGGKKSSKKGRMRKREEVIKSBasic
988-1009DDDLPQKQRNTRPRLPPTGKIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
462-477GGGGKKSSKKGRMRKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001487  Bromodomain  
IPR036427  Bromodomain-like_sf  
IPR006565  BTP  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037782  Spt7  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
KEGG clu:CLUG_05770  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07524  Bromo_TP  
PF00439  Bromodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50014  BROMODOMAIN_2  
Amino Acid Sequences MDQLGTFQLNDARRLFELAKALHQKRFFNHHLTAEQCHIINAILERDNFQLWRQFLDGNCCLVIAKDSSDDESADSIPEGTEPVTQLALRIRYLLWEKAINFYYDKTSRENSGSLATIEELPKEHEMIELLDQLPEESNEESVPQEKTNVRDEEDDYDDDEDEENGEDKSKTSNGQEATVLKLNDNGQVILEMEGSVFAKSSEPDSEQEEERTQEPGTQEINAAESLEEQEATIKSFNKVYHNFEYDRETLIKKRKLDKSDMQLENQKTTENTESGEIPINLGLVSHSLKHLLNTIQERRDDISLNDLELRTLFMDVRKNRGKWANDERVGQEELYDACEKVLLDLRGYTEHSTPFLNKVSKREAPNYGLIIKKPMDLNTVMKKLKGLAYNSKQEFVDDLMLIWNNCLTYNSNPKHYLRAHALAMQKRTQKLVPSIPNIVIRNRSELEKDDEAEDGRASTPGGGGKKSSKKGRMRKREEVIKSEEPEGVADGSVESTLAQNTPTASVEPVSPVAEEKPSVAPEEREEDEEDEDAETEMRDNDEEDEDQDPELLAWKNLTATSRANYCENRAALFDDHYHLKMDAEALVRESGKMKNFHQFLEFKEVVSKGNKLLDSDEPYLLEYDIVGGVPGLAYEGVDDDAQEKYENSMADAIVQNPETTAVARSSLVLPEDSGLNKLYRDNITEIQEIRKICFKISLIRQMQTQAFVHRTQMRQPEIEYVKEVDVDPVSRLPNHDIFSEKTQYAALRKGVAKVAMHTGFESTEPFAINTLTQVAETYISNLAKTLKSHCESSSSNKLSEREILLLSLLENGVEKPDDLYTFIEERALKHQKKLRDLHDKLSGFLKDLLRPSLESFNEKNFEDNSEQFTTGDFTSDLGDDFFGFKELGLDKEFKMLTSSIPINLLHARLQSSLASSDSTSKSTKYEDLHEWNTPKLTAADVEKQIGLLRPFYRDWVKKTEAHYVKQQKRNGESTELPPPQELYLLEDDDLPQKQRNTRPRLPPTGKIASVKKKLLSGAFILPDEEENADIKLETGDPGLMVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.27
4 0.31
5 0.29
6 0.36
7 0.44
8 0.47
9 0.5
10 0.54
11 0.55
12 0.54
13 0.61
14 0.58
15 0.55
16 0.56
17 0.56
18 0.56
19 0.55
20 0.53
21 0.48
22 0.45
23 0.38
24 0.32
25 0.27
26 0.21
27 0.2
28 0.18
29 0.18
30 0.19
31 0.19
32 0.21
33 0.23
34 0.25
35 0.23
36 0.24
37 0.26
38 0.24
39 0.26
40 0.26
41 0.28
42 0.28
43 0.35
44 0.35
45 0.3
46 0.29
47 0.26
48 0.24
49 0.21
50 0.22
51 0.15
52 0.14
53 0.14
54 0.16
55 0.18
56 0.19
57 0.19
58 0.18
59 0.18
60 0.17
61 0.14
62 0.13
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.14
74 0.19
75 0.21
76 0.19
77 0.19
78 0.18
79 0.23
80 0.27
81 0.28
82 0.26
83 0.28
84 0.29
85 0.34
86 0.35
87 0.31
88 0.28
89 0.27
90 0.32
91 0.3
92 0.32
93 0.31
94 0.32
95 0.34
96 0.36
97 0.36
98 0.29
99 0.29
100 0.28
101 0.23
102 0.21
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.14
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.16
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.16
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.14
130 0.15
131 0.14
132 0.19
133 0.21
134 0.25
135 0.32
136 0.33
137 0.33
138 0.34
139 0.36
140 0.35
141 0.36
142 0.34
143 0.27
144 0.26
145 0.24
146 0.21
147 0.19
148 0.14
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.13
157 0.14
158 0.16
159 0.18
160 0.24
161 0.24
162 0.26
163 0.29
164 0.27
165 0.3
166 0.32
167 0.29
168 0.23
169 0.25
170 0.24
171 0.24
172 0.24
173 0.19
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.12
178 0.12
179 0.08
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.12
190 0.14
191 0.15
192 0.2
193 0.22
194 0.23
195 0.26
196 0.25
197 0.24
198 0.23
199 0.23
200 0.19
201 0.19
202 0.18
203 0.19
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.15
208 0.16
209 0.13
210 0.13
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.18
224 0.21
225 0.26
226 0.3
227 0.36
228 0.4
229 0.44
230 0.44
231 0.42
232 0.45
233 0.38
234 0.37
235 0.32
236 0.28
237 0.31
238 0.39
239 0.43
240 0.44
241 0.52
242 0.57
243 0.61
244 0.67
245 0.68
246 0.67
247 0.72
248 0.68
249 0.63
250 0.62
251 0.58
252 0.53
253 0.45
254 0.37
255 0.27
256 0.28
257 0.27
258 0.2
259 0.19
260 0.17
261 0.17
262 0.18
263 0.21
264 0.17
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.14
279 0.14
280 0.19
281 0.26
282 0.31
283 0.33
284 0.34
285 0.35
286 0.34
287 0.34
288 0.3
289 0.23
290 0.23
291 0.2
292 0.2
293 0.2
294 0.18
295 0.16
296 0.15
297 0.15
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.18
303 0.2
304 0.28
305 0.35
306 0.35
307 0.4
308 0.47
309 0.48
310 0.49
311 0.57
312 0.59
313 0.55
314 0.57
315 0.52
316 0.48
317 0.46
318 0.37
319 0.26
320 0.18
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.11
325 0.09
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.15
330 0.12
331 0.12
332 0.13
333 0.14
334 0.15
335 0.17
336 0.17
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.17
343 0.2
344 0.24
345 0.24
346 0.28
347 0.35
348 0.39
349 0.42
350 0.44
351 0.44
352 0.42
353 0.44
354 0.41
355 0.38
356 0.34
357 0.3
358 0.29
359 0.24
360 0.23
361 0.21
362 0.19
363 0.18
364 0.19
365 0.24
366 0.26
367 0.33
368 0.31
369 0.3
370 0.29
371 0.28
372 0.3
373 0.3
374 0.27
375 0.3
376 0.36
377 0.44
378 0.45
379 0.45
380 0.4
381 0.36
382 0.32
383 0.24
384 0.2
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.08
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.12
397 0.22
398 0.24
399 0.29
400 0.33
401 0.33
402 0.39
403 0.38
404 0.39
405 0.34
406 0.35
407 0.31
408 0.33
409 0.38
410 0.34
411 0.36
412 0.37
413 0.36
414 0.33
415 0.35
416 0.31
417 0.29
418 0.3
419 0.35
420 0.36
421 0.35
422 0.36
423 0.36
424 0.39
425 0.37
426 0.34
427 0.31
428 0.26
429 0.27
430 0.25
431 0.24
432 0.21
433 0.22
434 0.26
435 0.23
436 0.23
437 0.19
438 0.19
439 0.18
440 0.17
441 0.14
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.08
449 0.1
450 0.09
451 0.11
452 0.17
453 0.24
454 0.3
455 0.36
456 0.42
457 0.51
458 0.6
459 0.7
460 0.74
461 0.77
462 0.8
463 0.81
464 0.82
465 0.76
466 0.71
467 0.68
468 0.62
469 0.55
470 0.47
471 0.39
472 0.3
473 0.26
474 0.21
475 0.13
476 0.08
477 0.06
478 0.05
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.03
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.05
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.11
510 0.15
511 0.14
512 0.14
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.14
517 0.13
518 0.09
519 0.08
520 0.07
521 0.06
522 0.05
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.05
528 0.05
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.08
536 0.07
537 0.06
538 0.09
539 0.08
540 0.07
541 0.06
542 0.07
543 0.07
544 0.08
545 0.09
546 0.08
547 0.1
548 0.11
549 0.13
550 0.15
551 0.18
552 0.18
553 0.2
554 0.22
555 0.21
556 0.2
557 0.19
558 0.19
559 0.16
560 0.17
561 0.15
562 0.12
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.12
567 0.11
568 0.1
569 0.09
570 0.1
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.11
578 0.12
579 0.15
580 0.18
581 0.19
582 0.25
583 0.26
584 0.27
585 0.29
586 0.28
587 0.27
588 0.32
589 0.31
590 0.24
591 0.25
592 0.25
593 0.23
594 0.23
595 0.21
596 0.14
597 0.18
598 0.18
599 0.16
600 0.18
601 0.19
602 0.23
603 0.24
604 0.23
605 0.19
606 0.19
607 0.19
608 0.17
609 0.13
610 0.07
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.04
615 0.03
616 0.03
617 0.03
618 0.03
619 0.02
620 0.02
621 0.02
622 0.02
623 0.03
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.07
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.1
637 0.09
638 0.11
639 0.11
640 0.11
641 0.1
642 0.1
643 0.1
644 0.08
645 0.09
646 0.07
647 0.07
648 0.08
649 0.07
650 0.07
651 0.08
652 0.09
653 0.09
654 0.1
655 0.1
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.08
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.14
667 0.14
668 0.16
669 0.18
670 0.21
671 0.24
672 0.26
673 0.27
674 0.26
675 0.28
676 0.26
677 0.23
678 0.26
679 0.22
680 0.2
681 0.23
682 0.21
683 0.26
684 0.32
685 0.4
686 0.37
687 0.38
688 0.39
689 0.39
690 0.38
691 0.33
692 0.29
693 0.22
694 0.22
695 0.22
696 0.26
697 0.27
698 0.28
699 0.31
700 0.37
701 0.36
702 0.34
703 0.35
704 0.39
705 0.36
706 0.35
707 0.31
708 0.25
709 0.23
710 0.23
711 0.22
712 0.15
713 0.13
714 0.13
715 0.12
716 0.13
717 0.14
718 0.13
719 0.15
720 0.18
721 0.21
722 0.22
723 0.22
724 0.22
725 0.24
726 0.28
727 0.3
728 0.26
729 0.22
730 0.22
731 0.23
732 0.23
733 0.25
734 0.21
735 0.22
736 0.24
737 0.25
738 0.26
739 0.27
740 0.24
741 0.22
742 0.27
743 0.23
744 0.23
745 0.21
746 0.19
747 0.17
748 0.17
749 0.16
750 0.1
751 0.1
752 0.1
753 0.09
754 0.09
755 0.09
756 0.09
757 0.08
758 0.08
759 0.08
760 0.07
761 0.07
762 0.07
763 0.08
764 0.08
765 0.09
766 0.12
767 0.12
768 0.12
769 0.13
770 0.15
771 0.15
772 0.17
773 0.2
774 0.24
775 0.26
776 0.29
777 0.29
778 0.32
779 0.33
780 0.4
781 0.45
782 0.4
783 0.4
784 0.41
785 0.42
786 0.38
787 0.4
788 0.34
789 0.26
790 0.23
791 0.21
792 0.17
793 0.16
794 0.14
795 0.11
796 0.08
797 0.06
798 0.06
799 0.06
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.09
805 0.09
806 0.11
807 0.12
808 0.14
809 0.15
810 0.15
811 0.18
812 0.17
813 0.18
814 0.26
815 0.35
816 0.34
817 0.4
818 0.46
819 0.49
820 0.58
821 0.64
822 0.64
823 0.65
824 0.67
825 0.66
826 0.7
827 0.63
828 0.55
829 0.53
830 0.44
831 0.35
832 0.37
833 0.33
834 0.27
835 0.29
836 0.3
837 0.26
838 0.27
839 0.28
840 0.29
841 0.28
842 0.3
843 0.3
844 0.34
845 0.36
846 0.35
847 0.34
848 0.28
849 0.31
850 0.29
851 0.29
852 0.29
853 0.28
854 0.29
855 0.26
856 0.26
857 0.24
858 0.19
859 0.19
860 0.13
861 0.1
862 0.11
863 0.11
864 0.11
865 0.09
866 0.09
867 0.08
868 0.09
869 0.09
870 0.08
871 0.08
872 0.08
873 0.11
874 0.12
875 0.14
876 0.15
877 0.17
878 0.16
879 0.22
880 0.22
881 0.19
882 0.2
883 0.19
884 0.17
885 0.21
886 0.22
887 0.17
888 0.2
889 0.19
890 0.2
891 0.22
892 0.22
893 0.19
894 0.19
895 0.2
896 0.18
897 0.2
898 0.17
899 0.17
900 0.17
901 0.15
902 0.15
903 0.14
904 0.19
905 0.19
906 0.22
907 0.21
908 0.21
909 0.23
910 0.25
911 0.3
912 0.27
913 0.31
914 0.36
915 0.42
916 0.46
917 0.5
918 0.49
919 0.47
920 0.45
921 0.39
922 0.33
923 0.26
924 0.22
925 0.19
926 0.22
927 0.27
928 0.27
929 0.29
930 0.27
931 0.27
932 0.27
933 0.28
934 0.25
935 0.23
936 0.22
937 0.24
938 0.25
939 0.31
940 0.39
941 0.4
942 0.44
943 0.47
944 0.51
945 0.52
946 0.55
947 0.6
948 0.57
949 0.56
950 0.61
951 0.64
952 0.69
953 0.72
954 0.73
955 0.71
956 0.71
957 0.73
958 0.67
959 0.63
960 0.59
961 0.55
962 0.61
963 0.55
964 0.49
965 0.43
966 0.4
967 0.33
968 0.3
969 0.25
970 0.2
971 0.21
972 0.21
973 0.21
974 0.2
975 0.21
976 0.23
977 0.25
978 0.23
979 0.24
980 0.28
981 0.36
982 0.45
983 0.54
984 0.59
985 0.66
986 0.74
987 0.79
988 0.85
989 0.83
990 0.81
991 0.8
992 0.78
993 0.73
994 0.69
995 0.69
996 0.68
997 0.7
998 0.68
999 0.62
1000 0.57
1001 0.57
1002 0.53
1003 0.48
1004 0.41
1005 0.39
1006 0.37
1007 0.34
1008 0.31
1009 0.27
1010 0.25
1011 0.22
1012 0.19
1013 0.14
1014 0.12
1015 0.12
1016 0.12
1017 0.11
1018 0.1
1019 0.1
1020 0.1
1021 0.1
1022 0.1
1023 0.1