FuNGI

C4Y6L0

Protein Details

Accession

C4Y6L0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
560-596	VNRAVPAKKPVHKVTKKKQKPKFSKHKFFKPDHEFDP	Basic
605-632	WLPLKLRSNYRPSKKDLKKKSGGHQGAI	Hydrophilic
643-662	HSSSTSTKSKSKGKKKKGKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
565-587	PAKKPVHKVTKKKQKPKFSKHKF
615-624	RPSKKDLKKK
650-662	KSKSKGKKKKGKK

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 13, cyto 8, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011716 TPR-3 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	clu:CLUG_03794 -
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like PF07720 TPR_3

Amino Acid Sequences

MSNSVIEAFKGINVASAHDLTEHEAIFEVSYQYLSKIKDFRDLKSFHYCLVSLINSDKYYRALQLIKEVPNEIHQEYPLEKAYVYYKTGKVDLLKDVYKSTINSNDISDALSRGLKHVVAQSYYQTGKYDAALQLYSELISTNTVDGTVDLACNERAILSQIAMKSGSCPVPQSTVSDSTETYDIIFNNALIKLASGNYDESLQLLKSALSQCEEQNLDSEPTELMMEVSPIKLTVAYIYQLSGRIDEAVEVLSTLDLTFITDLMVQLIIKNNYKSLHPSEENVNFVARELDYQFHFHHLRQKLTPIQRHTLLKNHLLLSYQSKSLSKSSKYLTNRFYKEYSDSFNGDVTPLIYKVLITLDITLEDLESPSQNTAVAKKIFKFARGKLESNDISDILVAAAILLVSVNTVSGNYDQSLLILEKLVEVELSSSPETLHASIFGLIFTLYEQRNYSKKLNSLQYALLQKFESLGSEVLQRNPHLYYFVRAFAFKYLNAGSEEKSLHLFGILHSTRKDDSIVSSVVNKDNGSLAPMESLASNESIEELLSVNVETLVSAENPVNRAVPAKKPVHKVTKKKQKPKFSKHKFFKPDHEFDPAKDLDSERWLPLKLRSNYRPSKKDLKKKSGGHQGAIESSPAPQTAAHSSSTSTKSKSKGKKKKGKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.18
3	0.18
4	0.18
5	0.17
6	0.18
7	0.17
8	0.2
9	0.17
10	0.14
11	0.14
12	0.14
13	0.13
14	0.14
15	0.11
16	0.09
17	0.1
18	0.1
19	0.11
20	0.16
21	0.17
22	0.22
23	0.27
24	0.28
25	0.37
26	0.4
27	0.42
28	0.47
29	0.48
30	0.47
31	0.52
32	0.51
33	0.43
34	0.44
35	0.39
36	0.31
37	0.34
38	0.29
39	0.21
40	0.24
41	0.26
42	0.24
43	0.25
44	0.25
45	0.23
46	0.24
47	0.24
48	0.26
49	0.26
50	0.26
51	0.34
52	0.39
53	0.4
54	0.4
55	0.4
56	0.35
57	0.36
58	0.39
59	0.32
60	0.27
61	0.24
62	0.25
63	0.24
64	0.27
65	0.24
66	0.2
67	0.18
68	0.18
69	0.21
70	0.22
71	0.24
72	0.26
73	0.27
74	0.29
75	0.31
76	0.32
77	0.32
78	0.32
79	0.34
80	0.34
81	0.33
82	0.32
83	0.32
84	0.31
85	0.29
86	0.27
87	0.27
88	0.28
89	0.29
90	0.29
91	0.29
92	0.28
93	0.25
94	0.25
95	0.21
96	0.14
97	0.14
98	0.14
99	0.13
100	0.13
101	0.15
102	0.14
103	0.15
104	0.2
105	0.21
106	0.21
107	0.22
108	0.23
109	0.26
110	0.27
111	0.26
112	0.21
113	0.2
114	0.19
115	0.18
116	0.21
117	0.17
118	0.19
119	0.18
120	0.17
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.09
125	0.08
126	0.06
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.06
134	0.07
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.06
143	0.07
144	0.09
145	0.1
146	0.09
147	0.12
148	0.12
149	0.14
150	0.14
151	0.13
152	0.12
153	0.15
154	0.17
155	0.14
156	0.16
157	0.16
158	0.2
159	0.21
160	0.22
161	0.23
162	0.25
163	0.26
164	0.25
165	0.24
166	0.22
167	0.22
168	0.19
169	0.16
170	0.13
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.1
175	0.11
176	0.11
177	0.1
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.08
182	0.09
183	0.08
184	0.09
185	0.09
186	0.1
187	0.1
188	0.09
189	0.1
190	0.09
191	0.08
192	0.07
193	0.07
194	0.1
195	0.12
196	0.13
197	0.13
198	0.15
199	0.15
200	0.19
201	0.2
202	0.17
203	0.16
204	0.17
205	0.16
206	0.15
207	0.16
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.08
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.08
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.04
254	0.05
255	0.09
256	0.11
257	0.13
258	0.13
259	0.15
260	0.15
261	0.16
262	0.2
263	0.2
264	0.25
265	0.24
266	0.26
267	0.3
268	0.31
269	0.32
270	0.28
271	0.24
272	0.17
273	0.16
274	0.16
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.12
281	0.12
282	0.16
283	0.17
284	0.17
285	0.25
286	0.27
287	0.29
288	0.28
289	0.32
290	0.35
291	0.41
292	0.46
293	0.42
294	0.42
295	0.44
296	0.46
297	0.43
298	0.42
299	0.39
300	0.36
301	0.35
302	0.32
303	0.27
304	0.25
305	0.24
306	0.23
307	0.21
308	0.18
309	0.16
310	0.16
311	0.17
312	0.2
313	0.24
314	0.2
315	0.22
316	0.24
317	0.31
318	0.35
319	0.39
320	0.42
321	0.46
322	0.46
323	0.46
324	0.45
325	0.39
326	0.38
327	0.33
328	0.31
329	0.25
330	0.24
331	0.21
332	0.2
333	0.18
334	0.15
335	0.13
336	0.09
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.08
362	0.12
363	0.16
364	0.17
365	0.18
366	0.25
367	0.25
368	0.3
369	0.34
370	0.32
371	0.4
372	0.43
373	0.44
374	0.39
375	0.45
376	0.4
377	0.37
378	0.34
379	0.23
380	0.18
381	0.16
382	0.15
383	0.07
384	0.06
385	0.04
386	0.03
387	0.02
388	0.02
389	0.02
390	0.02
391	0.02
392	0.02
393	0.02
394	0.02
395	0.02
396	0.02
397	0.04
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.08
402	0.07
403	0.07
404	0.09
405	0.08
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.04
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.09
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.07
425	0.08
426	0.09
427	0.09
428	0.08
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.1
434	0.09
435	0.1
436	0.12
437	0.15
438	0.19
439	0.24
440	0.29
441	0.29
442	0.34
443	0.39
444	0.45
445	0.44
446	0.43
447	0.4
448	0.4
449	0.43
450	0.38
451	0.33
452	0.26
453	0.23
454	0.21
455	0.2
456	0.15
457	0.1
458	0.1
459	0.09
460	0.15
461	0.16
462	0.19
463	0.21
464	0.21
465	0.21
466	0.21
467	0.21
468	0.18
469	0.18
470	0.18
471	0.18
472	0.22
473	0.21
474	0.2
475	0.21
476	0.22
477	0.23
478	0.19
479	0.2
480	0.17
481	0.18
482	0.2
483	0.21
484	0.18
485	0.19
486	0.2
487	0.17
488	0.18
489	0.16
490	0.13
491	0.13
492	0.12
493	0.09
494	0.18
495	0.19
496	0.2
497	0.2
498	0.23
499	0.22
500	0.23
501	0.24
502	0.15
503	0.17
504	0.18
505	0.19
506	0.17
507	0.19
508	0.21
509	0.22
510	0.23
511	0.2
512	0.17
513	0.18
514	0.17
515	0.15
516	0.13
517	0.11
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.08
522	0.09
523	0.08
524	0.08
525	0.08
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.06
531	0.06
532	0.05
533	0.06
534	0.06
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.09
544	0.11
545	0.12
546	0.14
547	0.14
548	0.13
549	0.18
550	0.2
551	0.26
552	0.33
553	0.4
554	0.47
555	0.54
556	0.63
557	0.69
558	0.75
559	0.79
560	0.82
561	0.85
562	0.88
563	0.9
564	0.91
565	0.91
566	0.93
567	0.93
568	0.93
569	0.93
570	0.94
571	0.94
572	0.95
573	0.93
574	0.89
575	0.88
576	0.87
577	0.82
578	0.75
579	0.73
580	0.64
581	0.55
582	0.56
583	0.45
584	0.37
585	0.32
586	0.3
587	0.24
588	0.3
589	0.31
590	0.27
591	0.3
592	0.29
593	0.3
594	0.36
595	0.43
596	0.43
597	0.51
598	0.55
599	0.63
600	0.72
601	0.79
602	0.78
603	0.76
604	0.8
605	0.8
606	0.83
607	0.84
608	0.84
609	0.84
610	0.85
611	0.88
612	0.88
613	0.82
614	0.76
615	0.7
616	0.62
617	0.56
618	0.49
619	0.4
620	0.28
621	0.25
622	0.22
623	0.17
624	0.15
625	0.11
626	0.14
627	0.19
628	0.21
629	0.21
630	0.21
631	0.23
632	0.29
633	0.34
634	0.35
635	0.33
636	0.37
637	0.43
638	0.52
639	0.61
640	0.66
641	0.72
642	0.79

C4Y6L0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer