Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UPI2

Protein Details
Accession Q0UPI2    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-58IDAERREKMRRIARNPTDKNIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 7, cysk 4, pero 3, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016514  C:SWI/SNF complex  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pno:SNOG_06332  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd10568  SWIB_like  
Amino Acid Sequences MISISDMAFAFRKGPIVPPQHAGQQQYSNANMQAQQRIDAERREKMRRIARNPTDKNIPEGVEDICIGDGVVRYKELREVERNLDATMMRKKLDVMDSKHHSRASRYGTMRIWISNTVENQPWQSTGIDADAFDFESNTNATYRVKIQGRLLDEEGDEGLEDEEDEKDADAMDEDSEPKPAVKPKPFSNYFSSITIDFDRAKSLQPDNFTQIEWKRPDQPGAKETTFSELEFERKGDENINITVNLQRFQNPEIFRLSKPLAELLDTDEEDRAGVLMGIWEYARAQHLQQDDDERKFACDAKLKALFGGQDSFYFPNLPQLIKPHLTTLPPIQLQYTIRVDKDYISPPADSGKVASEPTIYDVQVALEDPMQPLFQDILRRPDSIQTLQEIQKLDEQIVLLMGAIGQSKAKHAFFTSMSKDPVAFVKRWLSSQRRDLEVLLGEATRGGGEDASGEEWRRGGADGVWGTDVAKESVALWLARQNIKTH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.28
3 0.34
4 0.37
5 0.39
6 0.41
7 0.47
8 0.5
9 0.48
10 0.44
11 0.42
12 0.44
13 0.44
14 0.43
15 0.38
16 0.36
17 0.34
18 0.34
19 0.32
20 0.34
21 0.31
22 0.32
23 0.31
24 0.35
25 0.37
26 0.4
27 0.42
28 0.43
29 0.49
30 0.54
31 0.58
32 0.61
33 0.67
34 0.69
35 0.72
36 0.75
37 0.78
38 0.81
39 0.81
40 0.78
41 0.78
42 0.69
43 0.66
44 0.59
45 0.5
46 0.4
47 0.37
48 0.31
49 0.22
50 0.21
51 0.16
52 0.11
53 0.1
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.19
63 0.22
64 0.26
65 0.3
66 0.35
67 0.38
68 0.43
69 0.43
70 0.38
71 0.36
72 0.3
73 0.29
74 0.31
75 0.29
76 0.24
77 0.23
78 0.24
79 0.27
80 0.34
81 0.36
82 0.35
83 0.42
84 0.49
85 0.54
86 0.57
87 0.55
88 0.49
89 0.46
90 0.48
91 0.46
92 0.48
93 0.46
94 0.48
95 0.46
96 0.48
97 0.45
98 0.38
99 0.33
100 0.26
101 0.26
102 0.24
103 0.25
104 0.25
105 0.25
106 0.25
107 0.25
108 0.23
109 0.21
110 0.19
111 0.16
112 0.14
113 0.12
114 0.13
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.11
130 0.13
131 0.2
132 0.23
133 0.25
134 0.28
135 0.32
136 0.34
137 0.36
138 0.35
139 0.28
140 0.25
141 0.23
142 0.19
143 0.14
144 0.11
145 0.07
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.18
168 0.25
169 0.3
170 0.34
171 0.4
172 0.5
173 0.53
174 0.54
175 0.53
176 0.51
177 0.47
178 0.44
179 0.38
180 0.29
181 0.28
182 0.24
183 0.2
184 0.16
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.14
189 0.16
190 0.18
191 0.19
192 0.21
193 0.23
194 0.25
195 0.25
196 0.24
197 0.25
198 0.24
199 0.28
200 0.29
201 0.28
202 0.3
203 0.31
204 0.37
205 0.37
206 0.4
207 0.36
208 0.4
209 0.38
210 0.33
211 0.32
212 0.3
213 0.25
214 0.21
215 0.18
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.12
229 0.12
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.14
237 0.2
238 0.18
239 0.19
240 0.23
241 0.25
242 0.23
243 0.26
244 0.25
245 0.2
246 0.2
247 0.2
248 0.15
249 0.13
250 0.13
251 0.11
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.06
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.1
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.21
278 0.24
279 0.24
280 0.26
281 0.22
282 0.21
283 0.21
284 0.22
285 0.19
286 0.22
287 0.22
288 0.27
289 0.31
290 0.3
291 0.29
292 0.28
293 0.25
294 0.19
295 0.2
296 0.14
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.17
304 0.18
305 0.17
306 0.16
307 0.19
308 0.24
309 0.25
310 0.26
311 0.22
312 0.23
313 0.23
314 0.24
315 0.24
316 0.25
317 0.24
318 0.24
319 0.21
320 0.22
321 0.22
322 0.25
323 0.27
324 0.23
325 0.23
326 0.24
327 0.23
328 0.22
329 0.25
330 0.24
331 0.22
332 0.22
333 0.21
334 0.21
335 0.23
336 0.22
337 0.18
338 0.15
339 0.14
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.11
344 0.11
345 0.14
346 0.15
347 0.13
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.08
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.1
363 0.16
364 0.18
365 0.25
366 0.28
367 0.29
368 0.29
369 0.33
370 0.36
371 0.33
372 0.32
373 0.28
374 0.32
375 0.33
376 0.35
377 0.32
378 0.28
379 0.29
380 0.27
381 0.24
382 0.2
383 0.18
384 0.14
385 0.13
386 0.11
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.1
396 0.15
397 0.16
398 0.17
399 0.18
400 0.22
401 0.23
402 0.31
403 0.33
404 0.33
405 0.35
406 0.34
407 0.33
408 0.3
409 0.34
410 0.31
411 0.26
412 0.26
413 0.32
414 0.32
415 0.37
416 0.45
417 0.45
418 0.49
419 0.57
420 0.59
421 0.56
422 0.56
423 0.53
424 0.48
425 0.42
426 0.35
427 0.28
428 0.21
429 0.17
430 0.15
431 0.14
432 0.09
433 0.07
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.07
439 0.09
440 0.11
441 0.12
442 0.12
443 0.13
444 0.13
445 0.13
446 0.13
447 0.12
448 0.11
449 0.18
450 0.18
451 0.2
452 0.2
453 0.19
454 0.18
455 0.19
456 0.2
457 0.13
458 0.12
459 0.1
460 0.1
461 0.13
462 0.15
463 0.13
464 0.13
465 0.16
466 0.23
467 0.27