Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XWF4

Protein Details
Accession C4XWF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
617-640NNKLHRFGKWYHKKSRKTDSSSIAHydrophilic
720-744EAEEPRSKRRQSSRLQQKSRSPELEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR003349  JmjN  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG clu:CLUG_00277  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02373  JmjC  
PF02375  JmjN  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
PS51183  JMJN  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15543  PHD_RSF1  
Amino Acid Sequences MTFDKTLLKPCPVLLPSAEEFQNPIEYLSREDILQLGNEFGLVKVVPPKGWKPPFSIAPSFTFHTRIQKLSDLGITTRSRKIFIDGLNRFCNMTGRRNVHSWFVTHNQKIHYYDLYLAVCRLYPGRNDLMGISQEELTKLNLMFDLPASETILKSEFTDKIKAYAQYLSHNGNNFDFPESDPEDDTESCLVCRKNHSPTQMLLCDHCNNPYHLKCLSPPLTEVPEGTWYCEKCLIGTGAYGFEENPELKFNIWGFVEHCKQFESEFFSRYSKDGSPLSLDEIEQLFWNLVESENSELKVRYGADIHNLRPGEISGFPTMEIPKSPYDSNADGSQYIHHPWNLTRLPFAKGSLLNFINSTISGMTIPWIYVGSLLSTFCWHVEDHYTLSANYCHFGNVKKWYGIPSSYADEFEKIMKASAPDLFQRQPDLLHQLVTLMSPSELSAKGIPCVYADQGPNEFVVTYPRVYHAGFNSGLNFNEAVNFTMDAWIDFGERSIRDYAEIKKENVFDHFMLVQNILENYLQPNSAFEDNHKNFIGKCIRSYEQFLHRQKSLVHDLESDRLETVLKVPESKSGLMTPGPATRMSTMKKNKANTEDEDDDLCDICRTYVSFQYCDVNNKLHRFGKWYHKKSRKTDSSSIAVSNLLTPTESPYLKKGQEDGMTYSATAVAQSGSAERLQSLQDNNQDLKEEESEEEFGAKVPFSDQMNELISQAKRKASEEAEEPRSKRRQSSRLQQKSRSPELEAKPEINEEIEDSASPQKKSQYSSLLRQLNQFDHIKLCLKCTQKMCGDHGERLPKGSHLIVEKPFGEMEAILAGAKRKFLGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.31
4 0.34
5 0.33
6 0.25
7 0.26
8 0.25
9 0.27
10 0.2
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.22
15 0.24
16 0.23
17 0.19
18 0.2
19 0.2
20 0.17
21 0.18
22 0.15
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.09
28 0.1
29 0.08
30 0.09
31 0.15
32 0.17
33 0.19
34 0.25
35 0.3
36 0.39
37 0.47
38 0.48
39 0.49
40 0.54
41 0.6
42 0.62
43 0.63
44 0.55
45 0.51
46 0.52
47 0.48
48 0.42
49 0.39
50 0.35
51 0.39
52 0.4
53 0.38
54 0.38
55 0.41
56 0.4
57 0.38
58 0.39
59 0.31
60 0.28
61 0.32
62 0.32
63 0.31
64 0.36
65 0.34
66 0.33
67 0.32
68 0.36
69 0.35
70 0.37
71 0.44
72 0.44
73 0.49
74 0.5
75 0.5
76 0.46
77 0.4
78 0.41
79 0.34
80 0.37
81 0.39
82 0.42
83 0.45
84 0.49
85 0.5
86 0.49
87 0.47
88 0.4
89 0.37
90 0.39
91 0.45
92 0.44
93 0.46
94 0.43
95 0.46
96 0.47
97 0.45
98 0.39
99 0.32
100 0.3
101 0.31
102 0.29
103 0.24
104 0.22
105 0.19
106 0.17
107 0.16
108 0.16
109 0.14
110 0.15
111 0.19
112 0.23
113 0.23
114 0.23
115 0.23
116 0.24
117 0.23
118 0.22
119 0.19
120 0.16
121 0.16
122 0.16
123 0.16
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.09
134 0.1
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.12
141 0.13
142 0.16
143 0.18
144 0.21
145 0.26
146 0.25
147 0.27
148 0.31
149 0.31
150 0.29
151 0.3
152 0.28
153 0.28
154 0.32
155 0.32
156 0.31
157 0.32
158 0.32
159 0.28
160 0.28
161 0.24
162 0.23
163 0.19
164 0.17
165 0.2
166 0.21
167 0.21
168 0.2
169 0.2
170 0.21
171 0.2
172 0.21
173 0.16
174 0.14
175 0.13
176 0.17
177 0.18
178 0.17
179 0.24
180 0.28
181 0.35
182 0.41
183 0.45
184 0.45
185 0.46
186 0.51
187 0.49
188 0.45
189 0.38
190 0.37
191 0.35
192 0.32
193 0.33
194 0.27
195 0.25
196 0.32
197 0.32
198 0.31
199 0.28
200 0.29
201 0.27
202 0.34
203 0.36
204 0.29
205 0.29
206 0.29
207 0.32
208 0.31
209 0.29
210 0.22
211 0.24
212 0.23
213 0.24
214 0.25
215 0.22
216 0.23
217 0.26
218 0.24
219 0.17
220 0.2
221 0.18
222 0.14
223 0.14
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.14
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.19
243 0.24
244 0.22
245 0.23
246 0.2
247 0.21
248 0.2
249 0.21
250 0.23
251 0.21
252 0.22
253 0.23
254 0.24
255 0.24
256 0.24
257 0.26
258 0.19
259 0.2
260 0.19
261 0.18
262 0.2
263 0.19
264 0.22
265 0.18
266 0.17
267 0.15
268 0.15
269 0.14
270 0.11
271 0.1
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.13
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.18
291 0.21
292 0.22
293 0.25
294 0.24
295 0.23
296 0.22
297 0.21
298 0.16
299 0.14
300 0.16
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.13
305 0.13
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.18
314 0.19
315 0.2
316 0.2
317 0.19
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.12
325 0.13
326 0.13
327 0.2
328 0.21
329 0.2
330 0.21
331 0.22
332 0.24
333 0.23
334 0.24
335 0.19
336 0.18
337 0.19
338 0.21
339 0.19
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.06
367 0.07
368 0.09
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.11
382 0.14
383 0.18
384 0.2
385 0.21
386 0.21
387 0.23
388 0.24
389 0.22
390 0.21
391 0.17
392 0.18
393 0.17
394 0.18
395 0.16
396 0.15
397 0.15
398 0.13
399 0.11
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.16
412 0.15
413 0.13
414 0.13
415 0.17
416 0.13
417 0.13
418 0.12
419 0.11
420 0.11
421 0.11
422 0.09
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.13
442 0.13
443 0.12
444 0.11
445 0.1
446 0.07
447 0.1
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.12
453 0.12
454 0.14
455 0.12
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.16
460 0.15
461 0.15
462 0.14
463 0.13
464 0.09
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.08
469 0.09
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.09
482 0.1
483 0.1
484 0.11
485 0.14
486 0.18
487 0.25
488 0.28
489 0.27
490 0.29
491 0.31
492 0.3
493 0.3
494 0.29
495 0.2
496 0.19
497 0.19
498 0.17
499 0.16
500 0.15
501 0.13
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.08
512 0.1
513 0.12
514 0.12
515 0.13
516 0.23
517 0.24
518 0.28
519 0.28
520 0.26
521 0.24
522 0.32
523 0.37
524 0.27
525 0.28
526 0.3
527 0.31
528 0.32
529 0.37
530 0.35
531 0.36
532 0.44
533 0.47
534 0.46
535 0.45
536 0.45
537 0.42
538 0.42
539 0.41
540 0.34
541 0.3
542 0.29
543 0.3
544 0.32
545 0.32
546 0.26
547 0.18
548 0.16
549 0.15
550 0.12
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.14
555 0.15
556 0.19
557 0.22
558 0.22
559 0.21
560 0.17
561 0.19
562 0.17
563 0.18
564 0.16
565 0.16
566 0.16
567 0.15
568 0.16
569 0.16
570 0.21
571 0.21
572 0.29
573 0.35
574 0.42
575 0.48
576 0.52
577 0.56
578 0.58
579 0.61
580 0.56
581 0.56
582 0.5
583 0.45
584 0.41
585 0.35
586 0.28
587 0.23
588 0.19
589 0.11
590 0.09
591 0.07
592 0.07
593 0.08
594 0.1
595 0.16
596 0.19
597 0.19
598 0.21
599 0.25
600 0.26
601 0.3
602 0.3
603 0.31
604 0.33
605 0.36
606 0.41
607 0.4
608 0.39
609 0.4
610 0.44
611 0.48
612 0.54
613 0.59
614 0.64
615 0.7
616 0.78
617 0.81
618 0.86
619 0.85
620 0.82
621 0.82
622 0.77
623 0.72
624 0.65
625 0.58
626 0.47
627 0.37
628 0.29
629 0.22
630 0.17
631 0.11
632 0.09
633 0.08
634 0.12
635 0.16
636 0.17
637 0.17
638 0.2
639 0.27
640 0.28
641 0.3
642 0.28
643 0.29
644 0.33
645 0.34
646 0.34
647 0.3
648 0.28
649 0.27
650 0.24
651 0.19
652 0.14
653 0.11
654 0.08
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.06
659 0.07
660 0.08
661 0.08
662 0.08
663 0.09
664 0.11
665 0.14
666 0.16
667 0.21
668 0.26
669 0.3
670 0.31
671 0.31
672 0.31
673 0.28
674 0.28
675 0.24
676 0.21
677 0.17
678 0.18
679 0.19
680 0.17
681 0.17
682 0.14
683 0.14
684 0.12
685 0.11
686 0.09
687 0.08
688 0.12
689 0.13
690 0.16
691 0.15
692 0.18
693 0.21
694 0.21
695 0.21
696 0.23
697 0.23
698 0.25
699 0.28
700 0.28
701 0.28
702 0.29
703 0.35
704 0.32
705 0.36
706 0.38
707 0.42
708 0.47
709 0.52
710 0.52
711 0.54
712 0.59
713 0.58
714 0.6
715 0.61
716 0.63
717 0.66
718 0.75
719 0.78
720 0.81
721 0.87
722 0.86
723 0.85
724 0.85
725 0.84
726 0.76
727 0.71
728 0.69
729 0.66
730 0.67
731 0.62
732 0.54
733 0.47
734 0.45
735 0.4
736 0.32
737 0.26
738 0.18
739 0.16
740 0.15
741 0.13
742 0.14
743 0.21
744 0.25
745 0.25
746 0.26
747 0.32
748 0.35
749 0.4
750 0.44
751 0.46
752 0.48
753 0.56
754 0.63
755 0.63
756 0.61
757 0.62
758 0.61
759 0.54
760 0.53
761 0.47
762 0.39
763 0.35
764 0.36
765 0.38
766 0.33
767 0.35
768 0.36
769 0.38
770 0.44
771 0.45
772 0.5
773 0.5
774 0.55
775 0.55
776 0.59
777 0.59
778 0.58
779 0.61
780 0.62
781 0.55
782 0.53
783 0.49
784 0.41
785 0.4
786 0.35
787 0.32
788 0.27
789 0.33
790 0.33
791 0.37
792 0.35
793 0.33
794 0.31
795 0.27
796 0.23
797 0.17
798 0.14
799 0.1
800 0.1
801 0.08
802 0.1
803 0.13
804 0.13
805 0.14