Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4Y0M9

Protein Details
Accession C4Y0M9    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
268-289NDSKEHKPRGGRKGKTQRETAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-115RKKA
271-294KEHKPRGGRKGKTQRETAKGDKRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG clu:CLUG_01761  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSEVDTQPIDNISSRLYVGNIDFHTTEDSFMEFLKKVGTNPQSIDMPSKERGSFVKYLGFGFVQFATPEEAEDAIGKLNGALLGERFIYVKKALPQATAEEKRKKTEAYFQRKKAMDKWKREHLSNGAKEKGSSEEPNTEESIGEEAPAENASETDTTQRVGKKSKDTVFISNLDYKVTAKHLSYLLKDKGLKSKWIYVPKRMMPAHLLRIFRDQKKTIYNKGIAFIRLINEDTQQRAIKELNGYEINGREIVVQVAIDFDSNRPSHNDSKEHKPRGGRKGKTQRETAKGDKRRQDENQKSLSEEKGADESQKNGEIKAEEPKDEELKGDENKSEEKKDEQKIAEPETVPNQAGSSSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.14
4 0.15
5 0.15
6 0.2
7 0.19
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.24
12 0.22
13 0.22
14 0.16
15 0.16
16 0.14
17 0.14
18 0.16
19 0.12
20 0.12
21 0.16
22 0.17
23 0.17
24 0.26
25 0.3
26 0.31
27 0.32
28 0.36
29 0.34
30 0.34
31 0.38
32 0.32
33 0.32
34 0.32
35 0.34
36 0.3
37 0.3
38 0.31
39 0.32
40 0.32
41 0.29
42 0.31
43 0.28
44 0.28
45 0.28
46 0.26
47 0.2
48 0.18
49 0.17
50 0.12
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.1
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.1
76 0.1
77 0.14
78 0.18
79 0.24
80 0.25
81 0.26
82 0.27
83 0.3
84 0.38
85 0.43
86 0.46
87 0.48
88 0.5
89 0.52
90 0.53
91 0.5
92 0.43
93 0.45
94 0.49
95 0.51
96 0.58
97 0.59
98 0.65
99 0.67
100 0.67
101 0.65
102 0.66
103 0.64
104 0.65
105 0.67
106 0.69
107 0.69
108 0.68
109 0.64
110 0.62
111 0.63
112 0.6
113 0.58
114 0.51
115 0.47
116 0.45
117 0.41
118 0.36
119 0.29
120 0.24
121 0.21
122 0.23
123 0.24
124 0.26
125 0.25
126 0.22
127 0.18
128 0.16
129 0.15
130 0.1
131 0.09
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.11
146 0.14
147 0.16
148 0.21
149 0.24
150 0.29
151 0.36
152 0.39
153 0.44
154 0.44
155 0.45
156 0.43
157 0.41
158 0.37
159 0.33
160 0.29
161 0.22
162 0.2
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.09
168 0.12
169 0.14
170 0.16
171 0.18
172 0.23
173 0.22
174 0.25
175 0.26
176 0.26
177 0.31
178 0.31
179 0.33
180 0.29
181 0.37
182 0.39
183 0.48
184 0.49
185 0.48
186 0.53
187 0.52
188 0.57
189 0.49
190 0.44
191 0.38
192 0.39
193 0.41
194 0.38
195 0.36
196 0.3
197 0.38
198 0.43
199 0.43
200 0.45
201 0.39
202 0.38
203 0.47
204 0.51
205 0.49
206 0.49
207 0.5
208 0.45
209 0.46
210 0.45
211 0.36
212 0.32
213 0.26
214 0.2
215 0.17
216 0.17
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.16
221 0.19
222 0.19
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.2
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.19
233 0.19
234 0.17
235 0.14
236 0.14
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.11
249 0.11
250 0.13
251 0.15
252 0.2
253 0.27
254 0.33
255 0.41
256 0.41
257 0.52
258 0.61
259 0.63
260 0.63
261 0.65
262 0.68
263 0.71
264 0.76
265 0.71
266 0.72
267 0.77
268 0.83
269 0.8
270 0.8
271 0.78
272 0.75
273 0.77
274 0.75
275 0.75
276 0.74
277 0.77
278 0.76
279 0.72
280 0.73
281 0.74
282 0.76
283 0.75
284 0.75
285 0.73
286 0.66
287 0.65
288 0.6
289 0.53
290 0.45
291 0.36
292 0.29
293 0.26
294 0.26
295 0.27
296 0.26
297 0.26
298 0.26
299 0.32
300 0.3
301 0.26
302 0.29
303 0.25
304 0.25
305 0.32
306 0.32
307 0.27
308 0.29
309 0.33
310 0.33
311 0.32
312 0.31
313 0.24
314 0.27
315 0.3
316 0.3
317 0.28
318 0.28
319 0.35
320 0.39
321 0.41
322 0.38
323 0.42
324 0.48
325 0.53
326 0.58
327 0.54
328 0.57
329 0.59
330 0.61
331 0.59
332 0.51
333 0.48
334 0.45
335 0.45
336 0.38
337 0.32
338 0.27