FuNGI

C4Y6Z8

Protein Details

Accession

C4Y6Z8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
370-397	EQELAAKQEKKKKKKQKQRKNDQGTGEP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
376-401	KQEKKKKKKQKQRKNDQGTGEPAKKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 15, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	clu:CLUG_03932 -
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MDNSQEIKFPSGLESESDLVKPTMPTNELTPNEQDQAICGDVETTSEKVTAIQTIQGSVQIGDSSSKETLSAEPVDTAQESDANSGNEVESIANENTPGHDHMKRGQDNVNENTNDLTPITNAEDNSSQDKGNDEVSEEAHAGKVKDFLEGQTQETVEKFSDDEISLDDSSSDSDSDSVSSSSDSSSSDSSSSDSSDSSDDEETNNNEEIIDELEEEEEGSSGPILSKNEVSDEAAPTLPSDYKVAENAPLELVGTITSLVEKNIIIKANISGEFRVLKENSVLCLEDRQVIGPLFETFGRLQAPNYRIKFNTDEEFEKFKDKKGAKVFYVVPDSQFLYTDAIKKAKGTDASNCHDEELPEEEQEFSDDEQELAAKQEKKKKKKQKQRKNDQGTGEPAKKKHQTNSDQKFVSYGFASNSTPATLPSTPQYGAQYHHHGTSPHVKPYVQSTENVSNPYGVPINQVQPNPYGQPYPYQQAQNQFYPQPGYSNAPQYQNMPYQNAMQFQQQPQYQQHQQASSQLHAQFQPQTSFQQQQQMQLQHAQLTPSSLQTQHASQPYYAQYQQQGTNQSNYSQAQWAQATSEPSALHQLQQLVANRLTQNQHQQGQEPPGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.2
3	0.21
4	0.2
5	0.2
6	0.18
7	0.19
8	0.18
9	0.17
10	0.21
11	0.21
12	0.22
13	0.25
14	0.33
15	0.33
16	0.36
17	0.38
18	0.36
19	0.37
20	0.36
21	0.31
22	0.24
23	0.25
24	0.22
25	0.17
26	0.13
27	0.11
28	0.1
29	0.13
30	0.14
31	0.11
32	0.11
33	0.12
34	0.12
35	0.13
36	0.14
37	0.15
38	0.13
39	0.16
40	0.16
41	0.17
42	0.17
43	0.17
44	0.17
45	0.14
46	0.14
47	0.1
48	0.11
49	0.11
50	0.12
51	0.14
52	0.13
53	0.13
54	0.13
55	0.14
56	0.15
57	0.17
58	0.19
59	0.16
60	0.16
61	0.16
62	0.18
63	0.17
64	0.16
65	0.12
66	0.12
67	0.12
68	0.13
69	0.15
70	0.14
71	0.14
72	0.14
73	0.14
74	0.12
75	0.12
76	0.1
77	0.08
78	0.12
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.12
84	0.14
85	0.16
86	0.17
87	0.2
88	0.22
89	0.28
90	0.38
91	0.39
92	0.41
93	0.43
94	0.45
95	0.49
96	0.52
97	0.53
98	0.43
99	0.41
100	0.39
101	0.34
102	0.28
103	0.21
104	0.17
105	0.1
106	0.11
107	0.14
108	0.14
109	0.14
110	0.16
111	0.18
112	0.2
113	0.23
114	0.23
115	0.19
116	0.18
117	0.2
118	0.18
119	0.18
120	0.16
121	0.14
122	0.13
123	0.14
124	0.15
125	0.14
126	0.13
127	0.12
128	0.13
129	0.12
130	0.12
131	0.15
132	0.14
133	0.16
134	0.16
135	0.16
136	0.22
137	0.23
138	0.24
139	0.22
140	0.22
141	0.21
142	0.21
143	0.21
144	0.13
145	0.12
146	0.11
147	0.09
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.14
153	0.13
154	0.13
155	0.12
156	0.1
157	0.1
158	0.1
159	0.09
160	0.06
161	0.06
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.08
171	0.08
172	0.09
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.1
181	0.09
182	0.1
183	0.1
184	0.1
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.13
190	0.14
191	0.16
192	0.15
193	0.13
194	0.12
195	0.11
196	0.11
197	0.1
198	0.09
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.03
209	0.03
210	0.04
211	0.06
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.1
216	0.11
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.13
222	0.12
223	0.12
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.11
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.11
237	0.1
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.05
242	0.04
243	0.04
244	0.03
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.05
249	0.05
250	0.06
251	0.09
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.12
257	0.14
258	0.14
259	0.11
260	0.12
261	0.13
262	0.13
263	0.16
264	0.13
265	0.12
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.14
271	0.1
272	0.12
273	0.12
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.11
278	0.1
279	0.1
280	0.09
281	0.09
282	0.07
283	0.07
284	0.09
285	0.07
286	0.08
287	0.1
288	0.09
289	0.1
290	0.15
291	0.18
292	0.23
293	0.25
294	0.26
295	0.25
296	0.29
297	0.31
298	0.28
299	0.28
300	0.24
301	0.25
302	0.25
303	0.28
304	0.26
305	0.29
306	0.27
307	0.26
308	0.31
309	0.3
310	0.34
311	0.39
312	0.43
313	0.37
314	0.41
315	0.41
316	0.36
317	0.4
318	0.33
319	0.25
320	0.22
321	0.22
322	0.17
323	0.16
324	0.13
325	0.1
326	0.11
327	0.14
328	0.15
329	0.16
330	0.16
331	0.16
332	0.16
333	0.18
334	0.2
335	0.19
336	0.23
337	0.28
338	0.32
339	0.33
340	0.32
341	0.3
342	0.27
343	0.25
344	0.2
345	0.18
346	0.15
347	0.13
348	0.13
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.11
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.06
360	0.07
361	0.13
362	0.16
363	0.21
364	0.31
365	0.4
366	0.5
367	0.61
368	0.71
369	0.76
370	0.83
371	0.9
372	0.92
373	0.94
374	0.95
375	0.96
376	0.94
377	0.91
378	0.84
379	0.78
380	0.73
381	0.69
382	0.65
383	0.57
384	0.49
385	0.49
386	0.51
387	0.5
388	0.5
389	0.53
390	0.56
391	0.63
392	0.69
393	0.69
394	0.63
395	0.59
396	0.53
397	0.44
398	0.36
399	0.25
400	0.19
401	0.12
402	0.13
403	0.14
404	0.13
405	0.13
406	0.12
407	0.11
408	0.11
409	0.14
410	0.12
411	0.13
412	0.14
413	0.17
414	0.16
415	0.18
416	0.2
417	0.17
418	0.2
419	0.24
420	0.28
421	0.26
422	0.28
423	0.27
424	0.25
425	0.28
426	0.35
427	0.34
428	0.33
429	0.33
430	0.32
431	0.31
432	0.38
433	0.42
434	0.33
435	0.3
436	0.32
437	0.37
438	0.39
439	0.4
440	0.33
441	0.25
442	0.24
443	0.25
444	0.2
445	0.13
446	0.15
447	0.16
448	0.2
449	0.23
450	0.24
451	0.24
452	0.24
453	0.26
454	0.25
455	0.24
456	0.21
457	0.18
458	0.22
459	0.24
460	0.28
461	0.3
462	0.32
463	0.33
464	0.41
465	0.45
466	0.43
467	0.44
468	0.4
469	0.37
470	0.36
471	0.33
472	0.27
473	0.25
474	0.26
475	0.25
476	0.32
477	0.34
478	0.34
479	0.35
480	0.35
481	0.37
482	0.39
483	0.38
484	0.33
485	0.3
486	0.32
487	0.34
488	0.34
489	0.31
490	0.3
491	0.33
492	0.33
493	0.38
494	0.34
495	0.37
496	0.39
497	0.46
498	0.46
499	0.49
500	0.51
501	0.47
502	0.46
503	0.49
504	0.47
505	0.41
506	0.41
507	0.35
508	0.33
509	0.31
510	0.33
511	0.31
512	0.3
513	0.32
514	0.27
515	0.3
516	0.32
517	0.36
518	0.35
519	0.4
520	0.38
521	0.42
522	0.48
523	0.47
524	0.44
525	0.45
526	0.44
527	0.38
528	0.38
529	0.32
530	0.24
531	0.25
532	0.23
533	0.21
534	0.22
535	0.19
536	0.21
537	0.22
538	0.25
539	0.28
540	0.32
541	0.31
542	0.29
543	0.33
544	0.34
545	0.37
546	0.36
547	0.34
548	0.34
549	0.36
550	0.4
551	0.4
552	0.43
553	0.41
554	0.44
555	0.42
556	0.38
557	0.38
558	0.35
559	0.33
560	0.31
561	0.29
562	0.28
563	0.28
564	0.27
565	0.24
566	0.26
567	0.27
568	0.23
569	0.25
570	0.2
571	0.2
572	0.27
573	0.25
574	0.24
575	0.24
576	0.25
577	0.24
578	0.3
579	0.33
580	0.31
581	0.32
582	0.34
583	0.32
584	0.36
585	0.38
586	0.38
587	0.44
588	0.47
589	0.51
590	0.49
591	0.51
592	0.52

C4Y6Z8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer