Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XXH5

Protein Details
Accession C4XXH5    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37YPPDWDPSQVPKKRKNTNPNAEKVRLMHydrophilic
135-156TENKRFQEQKAKRKNNPFWQAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-259KPKRK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
KEGG clu:CLUG_00648  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKAINKYYPPDWDPSQVPKKRKNTNPNAEKVRLMLPFSMKCLQCNEYIASRRKFNARKEITPEKYMGIKIIRFHIKCPRCNNGIVFRTDPKSAGFAPVEGGVRNYESLAPQEKIKPLETEDEIFERLEREETENKRFQEQKAKRKNNPFWQAKDQGEKDVLESLEDKLADQQREQEIHDHLAYLQAKSARLQQSGGVDHVTNVVHAQVSQALAKEKAIEDNDEDLEKAKVIFSTREKRPMPASVSGVITVKKPKRKPVDEVKSAIIEKKDEVKESKTQTTGKPSLAVSALAGYSSSDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.51
3 0.47
4 0.52
5 0.56
6 0.56
7 0.62
8 0.66
9 0.72
10 0.77
11 0.83
12 0.84
13 0.85
14 0.88
15 0.89
16 0.89
17 0.88
18 0.81
19 0.71
20 0.63
21 0.57
22 0.48
23 0.4
24 0.34
25 0.32
26 0.3
27 0.34
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.35
32 0.34
33 0.3
34 0.32
35 0.3
36 0.31
37 0.38
38 0.45
39 0.44
40 0.46
41 0.47
42 0.54
43 0.58
44 0.59
45 0.62
46 0.6
47 0.63
48 0.67
49 0.74
50 0.69
51 0.65
52 0.58
53 0.49
54 0.46
55 0.39
56 0.35
57 0.28
58 0.25
59 0.24
60 0.3
61 0.37
62 0.34
63 0.37
64 0.44
65 0.47
66 0.52
67 0.57
68 0.56
69 0.51
70 0.54
71 0.55
72 0.54
73 0.51
74 0.48
75 0.44
76 0.41
77 0.41
78 0.38
79 0.34
80 0.25
81 0.24
82 0.2
83 0.21
84 0.17
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.13
90 0.13
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.18
102 0.21
103 0.22
104 0.23
105 0.22
106 0.2
107 0.23
108 0.23
109 0.21
110 0.19
111 0.18
112 0.18
113 0.16
114 0.15
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.12
120 0.19
121 0.23
122 0.29
123 0.33
124 0.34
125 0.38
126 0.4
127 0.38
128 0.42
129 0.47
130 0.51
131 0.57
132 0.66
133 0.68
134 0.75
135 0.81
136 0.8
137 0.82
138 0.77
139 0.71
140 0.7
141 0.68
142 0.6
143 0.59
144 0.49
145 0.41
146 0.36
147 0.3
148 0.24
149 0.21
150 0.18
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.2
162 0.21
163 0.23
164 0.23
165 0.22
166 0.19
167 0.21
168 0.21
169 0.17
170 0.13
171 0.18
172 0.18
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.23
179 0.21
180 0.21
181 0.22
182 0.22
183 0.24
184 0.25
185 0.25
186 0.18
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.13
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.15
207 0.16
208 0.16
209 0.17
210 0.19
211 0.2
212 0.19
213 0.18
214 0.15
215 0.14
216 0.12
217 0.1
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.16
222 0.23
223 0.32
224 0.37
225 0.46
226 0.47
227 0.49
228 0.51
229 0.52
230 0.49
231 0.45
232 0.43
233 0.37
234 0.37
235 0.34
236 0.32
237 0.26
238 0.24
239 0.28
240 0.32
241 0.39
242 0.43
243 0.52
244 0.61
245 0.67
246 0.73
247 0.75
248 0.79
249 0.77
250 0.75
251 0.69
252 0.63
253 0.58
254 0.53
255 0.44
256 0.35
257 0.3
258 0.35
259 0.34
260 0.34
261 0.37
262 0.38
263 0.44
264 0.49
265 0.53
266 0.49
267 0.5
268 0.51
269 0.57
270 0.56
271 0.5
272 0.47
273 0.41
274 0.39
275 0.36
276 0.3
277 0.21
278 0.18
279 0.16
280 0.13
281 0.12
282 0.09