Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XWA1

Protein Details
Accession C4XWA1    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-59MTETIERKESKKEKRDRKKEKKEKKDRKRKLEDESDNVNEBasic
359-388SREMTRTPQRERPARPPKRQYNDYEQPGKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-49RKESKKEKRDRKKEKKEKKDRKRK
102-122RLLKKGKLDLEKISKKHPAPR
325-350DRSKRNPKRFAGEERPEREEREGSGA
355-357RER
364-376RTPQRERPARPPK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034226  Nop13/Rnp24_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG clu:CLUG_00224  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12397  RRM2_Nop13p_fungi  
Amino Acid Sequences MKRSGTWNFHDAHRNLLLIMTETIERKESKKEKRDRKKEKKEKKDRKRKLEDESDNVNEDDEDKEEKEDSKTSDEPNAEEGTNNELEIDLSAQVPLSKKQQRLLKKGKLDLEKISKKHPAPRPANEEAEAKPARSEFGVWIGNLSYDTSKEDLVRFITAKTASFGEEGDHVPVEEKDITRVNLPKKENKIKGFAYVDLPSAKHVDSVVSLSESVLNGRKLLIKNSSSFEGRPEADSKKPLSKNPPSRILFVGNLSFDTTEDNLEEHFRHCGDIVRIRMATFEDTGKCKGFAFIDFKDESGPTAALKSKLAKKLINRPLRLEYGEDRSKRNPKRFAGEERPEREEREGSGAEPAERERDSREMTRTPQRERPARPPKRQYNDYEQPGKRVKSSIALATAQRASAAIVPSQGKKTTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.33
3 0.32
4 0.27
5 0.19
6 0.2
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.17
11 0.19
12 0.2
13 0.2
14 0.3
15 0.39
16 0.47
17 0.56
18 0.66
19 0.73
20 0.83
21 0.92
22 0.93
23 0.95
24 0.95
25 0.96
26 0.97
27 0.97
28 0.97
29 0.97
30 0.97
31 0.97
32 0.96
33 0.96
34 0.96
35 0.93
36 0.92
37 0.91
38 0.88
39 0.84
40 0.8
41 0.72
42 0.63
43 0.55
44 0.45
45 0.34
46 0.27
47 0.21
48 0.15
49 0.15
50 0.13
51 0.15
52 0.16
53 0.18
54 0.2
55 0.23
56 0.23
57 0.27
58 0.29
59 0.3
60 0.35
61 0.34
62 0.32
63 0.32
64 0.31
65 0.25
66 0.22
67 0.21
68 0.19
69 0.18
70 0.17
71 0.13
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.08
81 0.1
82 0.12
83 0.2
84 0.27
85 0.29
86 0.36
87 0.44
88 0.51
89 0.61
90 0.69
91 0.68
92 0.69
93 0.73
94 0.74
95 0.73
96 0.67
97 0.64
98 0.64
99 0.63
100 0.57
101 0.56
102 0.56
103 0.53
104 0.59
105 0.6
106 0.6
107 0.6
108 0.67
109 0.69
110 0.67
111 0.66
112 0.59
113 0.54
114 0.45
115 0.44
116 0.37
117 0.28
118 0.24
119 0.21
120 0.19
121 0.17
122 0.17
123 0.09
124 0.14
125 0.15
126 0.14
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.08
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.16
167 0.21
168 0.24
169 0.3
170 0.33
171 0.38
172 0.45
173 0.54
174 0.58
175 0.55
176 0.56
177 0.5
178 0.53
179 0.47
180 0.4
181 0.33
182 0.27
183 0.26
184 0.2
185 0.19
186 0.14
187 0.14
188 0.12
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.09
205 0.14
206 0.14
207 0.17
208 0.21
209 0.2
210 0.22
211 0.24
212 0.25
213 0.22
214 0.22
215 0.21
216 0.19
217 0.18
218 0.18
219 0.19
220 0.2
221 0.21
222 0.24
223 0.25
224 0.3
225 0.33
226 0.36
227 0.42
228 0.49
229 0.57
230 0.6
231 0.67
232 0.6
233 0.6
234 0.57
235 0.51
236 0.42
237 0.34
238 0.29
239 0.19
240 0.17
241 0.15
242 0.13
243 0.1
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.14
258 0.16
259 0.21
260 0.23
261 0.25
262 0.25
263 0.24
264 0.24
265 0.22
266 0.19
267 0.15
268 0.16
269 0.15
270 0.18
271 0.2
272 0.2
273 0.2
274 0.18
275 0.19
276 0.17
277 0.19
278 0.22
279 0.2
280 0.25
281 0.24
282 0.24
283 0.24
284 0.23
285 0.19
286 0.15
287 0.14
288 0.09
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.16
293 0.22
294 0.27
295 0.33
296 0.38
297 0.4
298 0.44
299 0.54
300 0.62
301 0.64
302 0.6
303 0.59
304 0.59
305 0.59
306 0.53
307 0.47
308 0.41
309 0.4
310 0.45
311 0.42
312 0.42
313 0.46
314 0.55
315 0.6
316 0.65
317 0.66
318 0.64
319 0.7
320 0.73
321 0.75
322 0.75
323 0.77
324 0.77
325 0.73
326 0.74
327 0.66
328 0.62
329 0.56
330 0.47
331 0.39
332 0.36
333 0.31
334 0.25
335 0.28
336 0.26
337 0.23
338 0.22
339 0.21
340 0.19
341 0.19
342 0.2
343 0.19
344 0.23
345 0.28
346 0.31
347 0.36
348 0.38
349 0.44
350 0.53
351 0.57
352 0.58
353 0.61
354 0.66
355 0.69
356 0.71
357 0.75
358 0.76
359 0.8
360 0.84
361 0.87
362 0.88
363 0.89
364 0.89
365 0.86
366 0.85
367 0.85
368 0.83
369 0.82
370 0.73
371 0.71
372 0.72
373 0.66
374 0.59
375 0.52
376 0.45
377 0.42
378 0.44
379 0.41
380 0.38
381 0.39
382 0.37
383 0.39
384 0.37
385 0.3
386 0.26
387 0.21
388 0.17
389 0.18
390 0.18
391 0.14
392 0.18
393 0.22
394 0.26
395 0.3
396 0.33