Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XX73

Protein Details
Accession C4XX73    Localization Confidence High Confidence Score 24.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-35AAAALDPPKKEPKKRKSRQKRQKNQPPAIEYEDHydrophilic
175-204LSEIREQKRKENRKKKDSKASSKKSSKQNTHydrophilic
221-250ADKIEATSQKTKRKRKSKKAKKTASETTREHydrophilic
264-296EQIDKPSETGKPKKKKKSRRERERAKKAQEGSKBasic
329-360ENENTGEEKKKAKKRNRKRKPTKGSADSANPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-25PKKEPKKRKSRQKRQK
181-202QKRKENRKKKDSKASSKKSSKQ
230-242KTKRKRKSKKAKK
273-292GKPKKKKKSRRERERAKKAQ
336-351EKKKAKKRNRKRKPTK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG clu:CLUG_00546  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSAAAALDPPKKEPKKRKSRQKRQKNQPPAIEYEDPDLKVVVRLLPPSLKEEDFLAQAKALCPALGTELAWTRFFYMRGSRNVQAFEEPICSRAYFLFPTKETADEFKRQISGASFLEPESGDHYSAQTMKPIFGSVTQVEPATSLGDIIKDSLFIKFMASYAAKTKNIDLSALLSEIREQKRKENRKKKDSKASSKKSSKQNTPAPASRTEGTGKNEATADKIEATSQKTKRKRKSKKAKKTASETTRETITVPNTQQGPAAEQIDKPSETGKPKKKKKSRRERERAKKAQEGSKTASAGTGAGSGLDVSEGKRSEHSDPSNKKPSEENENTGEEKKKAKKRNRKRKPTKGSADSANPAADQNAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.75
3 0.84
4 0.91
5 0.92
6 0.95
7 0.96
8 0.96
9 0.96
10 0.97
11 0.97
12 0.97
13 0.95
14 0.93
15 0.87
16 0.82
17 0.78
18 0.7
19 0.61
20 0.55
21 0.5
22 0.41
23 0.36
24 0.3
25 0.22
26 0.2
27 0.2
28 0.18
29 0.16
30 0.17
31 0.2
32 0.23
33 0.24
34 0.26
35 0.29
36 0.26
37 0.24
38 0.25
39 0.24
40 0.23
41 0.23
42 0.2
43 0.17
44 0.18
45 0.17
46 0.18
47 0.16
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.11
55 0.16
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.2
61 0.2
62 0.21
63 0.25
64 0.29
65 0.35
66 0.4
67 0.41
68 0.42
69 0.43
70 0.41
71 0.35
72 0.3
73 0.25
74 0.24
75 0.2
76 0.18
77 0.18
78 0.16
79 0.15
80 0.15
81 0.17
82 0.15
83 0.18
84 0.22
85 0.21
86 0.26
87 0.26
88 0.26
89 0.25
90 0.27
91 0.28
92 0.29
93 0.29
94 0.27
95 0.27
96 0.26
97 0.26
98 0.22
99 0.21
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.14
104 0.16
105 0.14
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.14
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.13
150 0.17
151 0.18
152 0.18
153 0.19
154 0.2
155 0.2
156 0.19
157 0.15
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.07
163 0.09
164 0.15
165 0.18
166 0.21
167 0.22
168 0.3
169 0.4
170 0.51
171 0.61
172 0.65
173 0.73
174 0.79
175 0.88
176 0.88
177 0.89
178 0.88
179 0.88
180 0.89
181 0.87
182 0.86
183 0.85
184 0.84
185 0.82
186 0.8
187 0.76
188 0.74
189 0.72
190 0.69
191 0.67
192 0.64
193 0.57
194 0.52
195 0.47
196 0.39
197 0.34
198 0.29
199 0.27
200 0.26
201 0.27
202 0.25
203 0.22
204 0.23
205 0.21
206 0.2
207 0.16
208 0.14
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.17
214 0.23
215 0.29
216 0.37
217 0.46
218 0.56
219 0.65
220 0.74
221 0.81
222 0.84
223 0.89
224 0.91
225 0.93
226 0.95
227 0.95
228 0.92
229 0.89
230 0.88
231 0.85
232 0.8
233 0.72
234 0.63
235 0.54
236 0.46
237 0.38
238 0.31
239 0.26
240 0.25
241 0.22
242 0.24
243 0.23
244 0.23
245 0.24
246 0.21
247 0.21
248 0.18
249 0.2
250 0.17
251 0.16
252 0.19
253 0.2
254 0.2
255 0.18
256 0.17
257 0.2
258 0.27
259 0.36
260 0.44
261 0.52
262 0.62
263 0.73
264 0.81
265 0.87
266 0.9
267 0.92
268 0.93
269 0.94
270 0.95
271 0.96
272 0.96
273 0.97
274 0.96
275 0.92
276 0.88
277 0.83
278 0.8
279 0.75
280 0.7
281 0.64
282 0.59
283 0.52
284 0.44
285 0.38
286 0.3
287 0.23
288 0.18
289 0.12
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.1
299 0.11
300 0.13
301 0.16
302 0.2
303 0.23
304 0.32
305 0.39
306 0.45
307 0.51
308 0.59
309 0.67
310 0.64
311 0.62
312 0.6
313 0.58
314 0.58
315 0.57
316 0.53
317 0.47
318 0.51
319 0.52
320 0.5
321 0.49
322 0.42
323 0.44
324 0.49
325 0.54
326 0.6
327 0.68
328 0.74
329 0.81
330 0.9
331 0.92
332 0.94
333 0.96
334 0.97
335 0.97
336 0.97
337 0.96
338 0.93
339 0.89
340 0.85
341 0.81
342 0.74
343 0.65
344 0.55
345 0.45
346 0.37