Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XW45

Protein Details
Accession C4XW45    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-66GDLRKEIKKLQRSRDQVKQWSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-282PKEPK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR012270  CCR4-NOT_su3/5  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG clu:CLUG_00168  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences MSTRKLQQEFDKLQKKVAEGLQQFDDIHDKIASTENTNQKDKLEGDLRKEIKKLQRSRDQVKQWSGDSSNKLDRNVLQDIRSRIENAMERFKEMEKVSKMKQFSNEGLELQAKLGARGLDEAKKLEATRYITDVLEELKRQNELLSADLAQYSHKKKSGGIQQAIDDLTEKIERNNFHVGRLELVLRNLDNDQLEPERIDEIRDDLDYYVENNQAADFVEFNEFYDVLELDESLELSQSFTVDDSPRKETPSPSEPKEKTVKVSDKEATKVKETKAEPKEPKVELKQPKPEATRVEVKEARSESRSGAVNEAKESKPEAKETKVEAREVRDTPTRAPPPGLAASPRKKAVASASPSPVLNNENKTFWDTAGRPAQLAQHRLHSPLPFSAISSQLETSLLNCPDSFDSERPRHYNPTNVHPSSVDYPQEPMYELHSAGVMRKFDTDTLFFCFYYSEGQDNLAKWNAARELSRRGWVFHRETKQWFSQEQGKARKDEGYKYFDYQSSWLIRRKDQVEFGADARQTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.56
3 0.52
4 0.5
5 0.49
6 0.42
7 0.46
8 0.42
9 0.41
10 0.39
11 0.34
12 0.33
13 0.23
14 0.23
15 0.19
16 0.16
17 0.16
18 0.22
19 0.22
20 0.22
21 0.3
22 0.37
23 0.42
24 0.46
25 0.46
26 0.4
27 0.44
28 0.4
29 0.4
30 0.41
31 0.39
32 0.42
33 0.51
34 0.55
35 0.53
36 0.55
37 0.55
38 0.55
39 0.61
40 0.63
41 0.63
42 0.69
43 0.74
44 0.8
45 0.82
46 0.82
47 0.81
48 0.79
49 0.73
50 0.65
51 0.62
52 0.58
53 0.54
54 0.5
55 0.47
56 0.48
57 0.47
58 0.46
59 0.43
60 0.42
61 0.41
62 0.44
63 0.4
64 0.35
65 0.38
66 0.41
67 0.41
68 0.39
69 0.35
70 0.29
71 0.32
72 0.34
73 0.32
74 0.39
75 0.36
76 0.37
77 0.37
78 0.37
79 0.37
80 0.32
81 0.36
82 0.32
83 0.37
84 0.41
85 0.45
86 0.47
87 0.45
88 0.49
89 0.47
90 0.44
91 0.45
92 0.42
93 0.36
94 0.36
95 0.33
96 0.27
97 0.21
98 0.2
99 0.14
100 0.12
101 0.14
102 0.12
103 0.1
104 0.13
105 0.16
106 0.18
107 0.19
108 0.2
109 0.19
110 0.21
111 0.21
112 0.2
113 0.22
114 0.22
115 0.23
116 0.24
117 0.25
118 0.22
119 0.22
120 0.21
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.15
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.17
139 0.19
140 0.22
141 0.24
142 0.25
143 0.26
144 0.34
145 0.42
146 0.45
147 0.46
148 0.44
149 0.42
150 0.43
151 0.42
152 0.34
153 0.25
154 0.15
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.15
160 0.16
161 0.19
162 0.29
163 0.27
164 0.27
165 0.3
166 0.29
167 0.26
168 0.27
169 0.25
170 0.16
171 0.17
172 0.16
173 0.13
174 0.14
175 0.12
176 0.13
177 0.11
178 0.1
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.12
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.06
229 0.08
230 0.11
231 0.13
232 0.18
233 0.19
234 0.22
235 0.23
236 0.23
237 0.28
238 0.34
239 0.36
240 0.35
241 0.44
242 0.41
243 0.45
244 0.49
245 0.44
246 0.39
247 0.42
248 0.45
249 0.37
250 0.41
251 0.4
252 0.36
253 0.38
254 0.39
255 0.33
256 0.31
257 0.33
258 0.29
259 0.33
260 0.32
261 0.39
262 0.41
263 0.48
264 0.47
265 0.49
266 0.54
267 0.48
268 0.52
269 0.47
270 0.49
271 0.49
272 0.52
273 0.56
274 0.54
275 0.58
276 0.56
277 0.54
278 0.49
279 0.45
280 0.46
281 0.39
282 0.43
283 0.4
284 0.37
285 0.39
286 0.37
287 0.35
288 0.28
289 0.27
290 0.21
291 0.21
292 0.23
293 0.19
294 0.21
295 0.21
296 0.2
297 0.21
298 0.24
299 0.21
300 0.19
301 0.21
302 0.21
303 0.21
304 0.25
305 0.27
306 0.26
307 0.3
308 0.33
309 0.4
310 0.37
311 0.39
312 0.36
313 0.37
314 0.39
315 0.36
316 0.36
317 0.32
318 0.32
319 0.32
320 0.39
321 0.37
322 0.33
323 0.33
324 0.3
325 0.29
326 0.29
327 0.27
328 0.22
329 0.28
330 0.33
331 0.36
332 0.36
333 0.33
334 0.31
335 0.31
336 0.33
337 0.32
338 0.31
339 0.32
340 0.34
341 0.34
342 0.34
343 0.33
344 0.29
345 0.24
346 0.23
347 0.23
348 0.22
349 0.22
350 0.23
351 0.26
352 0.25
353 0.22
354 0.25
355 0.2
356 0.25
357 0.31
358 0.3
359 0.27
360 0.27
361 0.33
362 0.31
363 0.35
364 0.29
365 0.3
366 0.31
367 0.33
368 0.35
369 0.3
370 0.27
371 0.24
372 0.27
373 0.2
374 0.2
375 0.2
376 0.2
377 0.19
378 0.19
379 0.18
380 0.14
381 0.15
382 0.13
383 0.13
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.14
388 0.16
389 0.16
390 0.21
391 0.24
392 0.22
393 0.29
394 0.33
395 0.4
396 0.42
397 0.46
398 0.49
399 0.48
400 0.52
401 0.48
402 0.53
403 0.57
404 0.54
405 0.51
406 0.44
407 0.45
408 0.4
409 0.4
410 0.32
411 0.23
412 0.24
413 0.25
414 0.25
415 0.22
416 0.19
417 0.19
418 0.19
419 0.18
420 0.16
421 0.15
422 0.15
423 0.17
424 0.21
425 0.18
426 0.17
427 0.19
428 0.2
429 0.2
430 0.23
431 0.22
432 0.19
433 0.24
434 0.26
435 0.24
436 0.23
437 0.21
438 0.18
439 0.2
440 0.21
441 0.17
442 0.15
443 0.18
444 0.21
445 0.21
446 0.25
447 0.22
448 0.21
449 0.19
450 0.23
451 0.23
452 0.23
453 0.25
454 0.26
455 0.32
456 0.35
457 0.42
458 0.39
459 0.39
460 0.42
461 0.48
462 0.51
463 0.52
464 0.56
465 0.56
466 0.61
467 0.65
468 0.66
469 0.62
470 0.56
471 0.52
472 0.54
473 0.55
474 0.58
475 0.61
476 0.59
477 0.57
478 0.58
479 0.6
480 0.54
481 0.55
482 0.53
483 0.51
484 0.49
485 0.5
486 0.53
487 0.47
488 0.46
489 0.39
490 0.38
491 0.39
492 0.41
493 0.43
494 0.44
495 0.47
496 0.53
497 0.55
498 0.55
499 0.53
500 0.52
501 0.51
502 0.49
503 0.46
504 0.44